RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462602.6

SH3BP4-208, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP4, Length 257 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF687Q8N1G0 1237 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP9.51□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 IL17RCQ8NAC3 791 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 LRRN4CLQ8ND94 238 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 OR2A12Q8NGT7 310 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 OR8D1Q8WZ84 308 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 RUBCNQ92622 972 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 EDAQ92838 391 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 SNF8Q96H20 258 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 EXOC2Q96KP1 924 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP9.51□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 ACOX2Q99424 681 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 GABRG3Q99928 467 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 RHOXF2Q9BQY4 288 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 FAM129AQ9BZQ8 928 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 TRIM31Q9BZY9 425 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 LRRC40Q9H9A6 602 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 NOD2Q9HC29 1040 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 FAM114A2Q9NRY5 505 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 WHRNQ9P202 907 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 A0A1W2PQ67 120 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 AP3B1O00203 1094 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 SOCS5O75159 536 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 SIN3BO75182 1162 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 AP2A1O95782 977 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 EPOP01588 193 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 PRNPP04156 253 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 TUBBP07437 444 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 APRTP07741 180 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 TPSB2P20231 275 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 IVDP26440 423 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 WASP42768 502 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 MAGEA6P43360 314 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 MAGEA9P43362 315 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 WNT3AP56704 352 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 CAV1Q03135 178 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 MORF4L2Q15014 288 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 TPSAB1Q15661 275 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 CFAP58Q5T655 872 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 C9orf64Q5T6V5 341 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 FAM46CQ5VWP2 391 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 IZUMO3Q5VZ72 239 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 LINC00523Q86TU6 105 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 HOOK3Q86VS8 718 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 PAF1Q8N7H5 531 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 TMIEQ8NEW7 156 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 SPATA22Q8NHS9 363 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 SEC14L1Q92503 715 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 TADA1Q96BN2 335 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 IFT43Q96FT9 208 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 IER2Q9BTL4 223 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 FSD1LQ9BXM9 530 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 DPH5Q9H2P9 285 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 MFSD1Q9H3U5 465 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 EPB41L5Q9HCM4 733 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 PRSS16Q9NQE7 514 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 IL36AQ9UHA7 158 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 ANAPC5Q9UJX4 755 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 MMP17Q9ULZ9 603 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 SNX24Q9Y343 169 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 MIA3Q5JRA6 1907 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 NCOR1O75376 2440 aa9.49□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa9.49□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 F5H423 210 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 ADAM23O75077 832 aa9.49□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 PMPCBO75439 489 aa9.49□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 SUN1O94901 812 aa9.49□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 MMP2P08253 660 aa9.49□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 HOXB2P14652 356 aa9.49□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 MCM3P25205 808 aa9.49□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 NFKBIAP25963 317 aa9.49□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 RPL21P46778 160 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 RPS9P46781 194 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 ITGA8P53708 1063 aa9.49□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 RPL26P61254 145 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 CDK18Q07002 472 aa9.49□□□□□ -0.89
SH3BP4-208ENST00000462602 CCDC15Q0P6D6 951 aa9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50 ms