RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429595.1

PTPRK-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRK, Length 558 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-211ENST00000429595 RUFY3Q7L099 469 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 ZSCAN30Q86W11 494 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 EXOC8Q8IYI6 725 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 PPM1KQ8N3J5 372 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 CPA6Q8N4T0 437 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 OR56A1Q8NGH5 318 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 ZFP28Q8NHY6 868 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 GPT2Q8TD30 523 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 HMGB4Q8WW32 186 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 SLC5A5Q92911 643 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 LRRC3BQ96PB8 259 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 GCNAQ96QF7 691 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 GAREM1Q9H706 876 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 IFT122Q9HBG6 1241 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 KLHL11Q9NVR0 708 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 MAFFQ9ULX9 164 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 MMP17Q9ULZ9 603 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 EDARQ9UNE0 448 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 COL6A6A6NMZ7 2263 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 ASAP2O43150 1006 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 STX6O43752 255 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 MARCH6O60337 910 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 CDK4P11802 303 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 TKTP29401 623 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 SREBF1P36956 1147 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 GNAQP50148 359 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 GRIK2Q13002 908 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 PDGFRLQ15198 375 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 TAF12Q16514 161 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 MST1LQ2TV78 715 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 EOGTQ5NDL2 527 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 ATL3Q6DD88 541 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 RHOT2Q8IXI1 618 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 TRIML1Q8N9V2 468 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 OR2W6PQ8NHA6 318 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 CPB2Q96IY4 423 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 PGBD1Q96JS3 809 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 SPZ1Q9BXG8 430 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 TASP1Q9H6P5 420 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 FANCLQ9NW38 375 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 MGST3O14880 152 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 PJA2O43164 708 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 KLK10O43240 276 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 CHMP2AO43633 222 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 TPM3P06753 285 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF883P0CG24 379 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 CALM1P0DP23 149 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 CALM2P0DP24 149 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 CALM3P0DP25 149 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 SYT1P21579 422 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 GABRR2P28476 465 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 SFNP31947 248 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 AVPR1AP37288 418 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 JAK3P52333 1124 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 CLRN1P58418 232 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 SETQ01105 290 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP6.62□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 PKP1Q13835 747 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 INAVAQ3KP66 663 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 CTXN3Q4LDR2 81 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 STXBP5Q5T5C0 1151 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 ITIH5Q86UX2 942 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 RNF149Q8NC42 400 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 TCP11Q8WWU5 503 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 FAM227BQ96M60 508 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 SH2D3AQ9BRG2 576 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 PANK2Q9BZ23 570 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 MINDY3Q9H8M7 445 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 HPS4Q9NQG7 708 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 PDRG1Q9NUG6 133 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 SMC3Q9UQE7 1217 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 ATG2BQ96BY7 2078 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 A0A1B0GTW7 788 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 CCDC78A2IDD5 438 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 I3L4J1 428 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 BRINP1O60477 761 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRK-211ENST00000429595 TSPAN1O60635 241 aa6.61□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.5 ms