RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423971.2

ACTBP13-201, Transcript of actin, beta pseudogene 13, humanhuman

BASIC

Gene ACTBP13, Length 3,959 nt, Biotype unitary pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP13-201ENST00000423971 PDK2Q15119 407 aa8.72□□□□□ -1.01
ACTBP13-201ENST00000423971 CARTPTQ16568 116 aa8.72□□□□□ -1.01
ACTBP13-201ENST00000423971 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa8.72□□□□□ -1.01
ACTBP13-201ENST00000423971 TTC39CQ8N584 583 aa8.72□□□□□ -1.01
ACTBP13-201ENST00000423971 CLIP3Q96DZ5 547 aa8.72□□□□□ -1.01
ACTBP13-201ENST00000423971 MFSD3Q96ES6 412 aa8.72□□□□□ -1.01
ACTBP13-201ENST00000423971 HSFY1Q96LI6 401 aa8.72□□□□□ -1.01
ACTBP13-201ENST00000423971 ZNF358Q9NW07 568 aa8.72□□□□□ -1.01
ACTBP13-201ENST00000423971 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP8.72□□□□□ -1.01
ACTBP13-201ENST00000423971 CDH9Q9ULB4 789 aa8.72□□□□□ -1.01
ACTBP13-201ENST00000423971 DMTF1Q9Y222 760 aa8.72□□□□□ -1.01
ACTBP13-201ENST00000423971 BRWD1Q9NSI6 2320 aa8.72□□□□□ -1.01
ACTBP13-201ENST00000423971 WDR90Q96KV7 1748 aa8.72□□□□□ -1.01
ACTBP13-201ENST00000423971 CLUHO75153 1309 aa8.72□□□□□ -1.01
ACTBP13-201ENST00000423971 ATG2BQ96BY7 2078 aa8.72□□□□□ -1.01
ACTBP13-201ENST00000423971 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
ACTBP13-201ENST00000423971 SYCE1LA8MT33 242 aa8.72□□□□□ -1.01
ACTBP13-201ENST00000423971 I6L893 689 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
ACTBP13-201ENST00000423971 KPNA6O60684 536 aa8.72□□□□□ -1.01
ACTBP13-201ENST00000423971 FAM58BPP0C7Q3 252 aa8.72□□□□□ -1.01
ACTBP13-201ENST00000423971 GNAZP19086 355 aa8.72□□□□□ -1.01
ACTBP13-201ENST00000423971 KCNQ1P51787 676 aa8.72□□□□□ -1.01
ACTBP13-201ENST00000423971 NDUFA5Q16718 116 aa8.72□□□□□ -1.01
ACTBP13-201ENST00000423971 FBXO48Q5FWF7 155 aa8.72□□□□□ -1.01
ACTBP13-201ENST00000423971 RTP2Q5QGT7 225 aa8.72□□□□□ -1.01
ACTBP13-201ENST00000423971 LRRC38Q5VT99 294 aa8.72□□□□□ -1.01
ACTBP13-201ENST00000423971 KLHDC10Q6PID8 442 aa8.72□□□□□ -1.01
ACTBP13-201ENST00000423971 EFHBQ8N7U6 833 aa8.72□□□□□ -1.01
ACTBP13-201ENST00000423971 EME1Q96AY2 570 aa8.72□□□□□ -1.01
ACTBP13-201ENST00000423971 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
ACTBP13-201ENST00000423971 SYBUQ9NX95 663 aa8.72□□□□□ -1.01
ACTBP13-201ENST00000423971 MGAMO43451 1857 aa8.72□□□□□ -1.01
ACTBP13-201ENST00000423971 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa8.72□□□□□ -1.01
ACTBP13-201ENST00000423971 CFAP99D6REC4 459 aa8.71□□□□□ -1.01
ACTBP13-201ENST00000423971 CNTN5O94779 1100 aa8.71□□□□□ -1.01
ACTBP13-201ENST00000423971 MT-CO1P00395 513 aa8.71□□□□□ -1.01
ACTBP13-201ENST00000423971 STMN1P16949 149 aa8.71□□□□□ -1.01
ACTBP13-201ENST00000423971 BGNP21810 368 aa8.71□□□□□ -1.01
ACTBP13-201ENST00000423971 KCNA4P22459 653 aa8.71□□□□□ -1.01
ACTBP13-201ENST00000423971 STAT4Q14765 748 aa8.71□□□□□ -1.01
ACTBP13-201ENST00000423971 DLG2Q15700 870 aa8.71□□□□□ -1.01
ACTBP13-201ENST00000423971 GEN1Q17RS7 908 aa8.71□□□□□ -1.01
ACTBP13-201ENST00000423971 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa8.71□□□□□ -1.01
ACTBP13-201ENST00000423971 ZNF567Q8N184 647 aa8.71□□□□□ -1.01
ACTBP13-201ENST00000423971 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.01
ACTBP13-201ENST00000423971 ZNF778Q96MU6 729 aa8.71□□□□□ -1.01
ACTBP13-201ENST00000423971 HEPHQ9BQS7 1158 aa8.71□□□□□ -1.01
ACTBP13-201ENST00000423971 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.01
ACTBP13-201ENST00000423971 GIN1Q9NXP7 522 aa8.71□□□□□ -1.01
ACTBP13-201ENST00000423971 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.01
ACTBP13-201ENST00000423971 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa8.71□□□□□ -1.01
ACTBP13-201ENST00000423971 LOC100653049A0A140TA62 436 aa8.71□□□□□ -1.01
ACTBP13-201ENST00000423971 FKBP6O75344 327 aa8.71□□□□□ -1.01
ACTBP13-201ENST00000423971 KRT34O76011 436 aa8.71□□□□□ -1.01
ACTBP13-201ENST00000423971 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.01
ACTBP13-201ENST00000423971 STIP1P31948 543 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.01
ACTBP13-201ENST00000423971 RXRGP48443 463 aa8.71□□□□□ -1.01
ACTBP13-201ENST00000423971 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.01
ACTBP13-201ENST00000423971 CDC16Q13042 620 aa8.71□□□□□ -1.01
ACTBP13-201ENST00000423971 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.01
ACTBP13-201ENST00000423971 PTPRCAPQ14761 206 aa8.71□□□□□ -1.01
ACTBP13-201ENST00000423971 SLC45A4Q5BKX6 768 aa8.71□□□□□ -1.01
ACTBP13-201ENST00000423971 LINGO4Q6UY18 593 aa8.71□□□□□ -1.01
ACTBP13-201ENST00000423971 TPGS1Q6ZTW0 290 aa8.71□□□□□ -1.01
ACTBP13-201ENST00000423971 ACAD11Q709F0 780 aa8.71□□□□□ -1.01
ACTBP13-201ENST00000423971 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.01
ACTBP13-201ENST00000423971 CACUL1Q86Y37 369 aa8.71□□□□□ -1.01
ACTBP13-201ENST00000423971 FNDC8Q8TC99 324 aa8.71□□□□□ -1.01
ACTBP13-201ENST00000423971 OSCP1Q8WVF1 389 aa8.71□□□□□ -1.01
ACTBP13-201ENST00000423971 SEPT8Q92599 483 aa8.71□□□□□ -1.01
ACTBP13-201ENST00000423971 SMIM14Q96QK8 99 aa8.71□□□□□ -1.01
ACTBP13-201ENST00000423971 YME1L1Q96TA2 773 aa8.71□□□□□ -1.01
ACTBP13-201ENST00000423971 FICDQ9BVA6 458 aa8.71□□□□□ -1.01
ACTBP13-201ENST00000423971 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.01
ACTBP13-201ENST00000423971 MARCH7Q9H992 704 aa8.71□□□□□ -1.01
ACTBP13-201ENST00000423971 SP110Q9HB58 689 aa8.71□□□□□ -1.01
ACTBP13-201ENST00000423971 CHRAC1Q9NRG0 131 aa8.71□□□□□ -1.01
ACTBP13-201ENST00000423971 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.01
ACTBP13-201ENST00000423971 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.01
ACTBP13-201ENST00000423971 EPS15L1Q9UBC2 864 aa8.71□□□□□ -1.01
ACTBP13-201ENST00000423971 ARID2Q68CP9 1835 aa8.71□□□□□ -1.02
ACTBP13-201ENST00000423971 CHD7Q9P2D1 2997 aa8.71□□□□□ -1.02
ACTBP13-201ENST00000423971 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
ACTBP13-201ENST00000423971 BIRC5O15392 142 aa8.71□□□□□ -1.02
ACTBP13-201ENST00000423971 FYNP06241 537 aa8.71□□□□□ -1.02
ACTBP13-201ENST00000423971 SELPP16109 830 aa8.71□□□□□ -1.02
ACTBP13-201ENST00000423971 VCLP18206 1134 aa8.71□□□□□ -1.02
ACTBP13-201ENST00000423971 WARSP23381 471 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
ACTBP13-201ENST00000423971 DRG2P55039 364 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
ACTBP13-201ENST00000423971 CAV1Q03135 178 aa8.71□□□□□ -1.02
ACTBP13-201ENST00000423971 ZNF460Q14592 562 aa8.71□□□□□ -1.02
ACTBP13-201ENST00000423971 ARHGAP17Q68EM7 881 aa8.71□□□□□ -1.02
ACTBP13-201ENST00000423971 TRAF7Q6Q0C0 670 aa8.71□□□□□ -1.02
ACTBP13-201ENST00000423971 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
ACTBP13-201ENST00000423971 DENND1CQ8IV53 801 aa8.71□□□□□ -1.02
ACTBP13-201ENST00000423971 TNS4Q8IZW8 715 aa8.71□□□□□ -1.02
ACTBP13-201ENST00000423971 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
ACTBP13-201ENST00000423971 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
ACTBP13-201ENST00000423971 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
ACTBP13-201ENST00000423971 TLCD1Q96CP7 247 aa8.71□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.9 ms