RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362913.1

SNORD56.1-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 56, humanhuman

BASIC

Gene SNORD56, Length 68 nt, Biotype snoRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD56.1-201ENST00000362913 TEX45Q8NA69 505 aa2.77□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 DENND1AQ8TEH3 1009 aa2.77□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 DDB2Q92466 427 aa2.77□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 EME1Q96AY2 570 aa2.77□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 RNF183Q96D59 192 aa2.77□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 KLHL15Q96M94 604 aa2.77□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 MPHOSPH8Q99549 860 aa2.77□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa2.77□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 CDT1Q9H211 546 aa2.77□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 MUC13Q9H3R2 512 aa2.77□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 SNTG1Q9NSN8 517 aa2.77□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 C20orf141Q9NUB4 165 aa2.77□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 DECR2Q9NUI1 292 aa2.77□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 MSRB1Q9NZV6 116 aa2.77□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 PCDHA12Q9UN75 941 aa2.77□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 A4GNTQ9UNA3 340 aa2.77□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 CAMK2AQ9UQM7 478 aa2.77□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa2.77□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 USP17L23D6RBM5 183 aa2.76□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 TACC1O75410 805 aa2.76□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 MTA2O94776 668 aa2.76□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 SPARCP09486 303 aa2.76□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 ACADMP11310 421 aa2.76□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 MYF6P23409 242 aa2.76□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 TTKP33981 857 aa2.76□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 AVPR1AP37288 418 aa2.76□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 HARS2P49590 506 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 OLR1P78380 273 aa2.76□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa2.76□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 PRKG2Q13237 762 aa2.76□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 ERV3-1Q14264 604 aa2.76□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 VEPH1Q14D04 833 aa2.76□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 SHBQ15464 509 aa2.76□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 DPCR1Q3MIW9 517 aa2.76□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 MANEAQ5SRI9 462 aa2.76□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 ASPHD1Q5U4P2 390 aa2.76□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 SPATA1Q5VX52 437 aa2.76□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 HAUS3Q68CZ6 603 aa2.76□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 HMBOX1Q6NT76 420 aa2.76□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa2.76□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 SLC2A7Q6PXP3 512 aa2.76□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 SARM1Q6SZW1 724 aa2.76□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 KLHL24Q6TFL4 600 aa2.76□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 PARM1Q6UWI2 310 aa2.76□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 CLEC4GQ6UXB4 293 aa2.76□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 MOB3CQ70IA8 216 aa2.76□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa2.76□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 PIP4P1Q86T03 277 aa2.76□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 GPAT4Q86UL3 456 aa2.76□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 DENND6AQ8IWF6 608 aa2.76□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 LRRC57Q8N9N7 239 aa2.76□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 TMEM174Q8WUU8 243 aa2.76□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 SLC35F5Q8WV83 523 aa2.76□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 LPAR1Q92633 364 aa2.76□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 SNAPC3Q92966 411 aa2.76□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 SMARCE1Q969G3 411 aa2.76□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 STRA6Q9BX79 667 aa2.76□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa2.76□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 KLHL31Q9H511 634 aa2.76□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 AAMDCQ9H7C9 122 aa2.76□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa2.76□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 KRT84Q9NSB2 600 aa2.76□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa2.76□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 ANKRD10Q9NXR5 420 aa2.76□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 EHD2Q9NZN4 543 aa2.76□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 SWAP70Q9UH65 585 aa2.76□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa2.76□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 SCINQ9Y6U3 715 aa2.76□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 STMND1H3BQB6 276 aa2.75□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 ADAM10O14672 748 aa2.75□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 TIPRLO75663 272 aa2.75□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 EPN2O95208 641 aa2.75□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 TFP02787 698 aa2.75□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 CHRNB1P11230 501 aa2.75□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 CD72P21854 359 aa2.75□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 CHATP28329 748 aa2.75□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 CDAP32320 146 aa2.75□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 KCNJ4P48050 445 aa2.75□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 CDH12P55289 794 aa2.75□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
SNORD56.1-201ENST00000362913 FAM27E3Q08E93 113 aa2.75□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.6 ms