RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000335007.9

PPP1CC-201, Transcript of protein phosphatase 1 catalytic subunit gamma, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PPP1CC, Length 2,559 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1CC-201ENST00000335007 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
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PPP1CC-201ENST00000335007 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
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PPP1CC-201ENST00000335007 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP20.44■□□□□ 0.867e-20■■■■□ 25.5
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PPP1CC-201ENST00000335007 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
PPP1CC-201ENST00000335007 C1orf50Q9BV19 199 aa20.44■□□□□ 0.86
PPP1CC-201ENST00000335007 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
PPP1CC-201ENST00000335007 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
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PPP1CC-201ENST00000335007 CLOCKO15516 846 aa20.43■□□□□ 0.86
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