RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000309641.10

PDE4D-201, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 2,025 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-201ENST00000309641 CCDC114Q96M63 670 aa9.21□□□□□ -0.94
PDE4D-201ENST00000309641 CFAP54Q96N23 3096 aa9.21□□□□□ -0.94
PDE4D-201ENST00000309641 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP9.21□□□□□ -0.947e-7■■■■■ 35.3
PDE4D-201ENST00000309641 OSBPL9Q96SU4 736 aa9.21□□□□□ -0.94
PDE4D-201ENST00000309641 SEMA3CQ99985 751 aa9.21□□□□□ -0.94
PDE4D-201ENST00000309641 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.94
PDE4D-201ENST00000309641 FBRSQ9HAH7 460 aa9.21□□□□□ -0.94
PDE4D-201ENST00000309641 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.94
PDE4D-201ENST00000309641 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.94
PDE4D-201ENST00000309641 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa9.21□□□□□ -0.94
PDE4D-201ENST00000309641 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa9.21□□□□□ -0.94
PDE4D-201ENST00000309641 SPAG17Q6Q759 2223 aa9.2□□□□□ -0.94
PDE4D-201ENST00000309641 DOCK9Q9BZ29 2069 aa9.2□□□□□ -0.94
PDE4D-201ENST00000309641 ANKRD36A6QL64 1941 aa9.2□□□□□ -0.94
PDE4D-201ENST00000309641 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP9.2□□□□□ -0.94
PDE4D-201ENST00000309641 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa9.2□□□□□ -0.94
PDE4D-201ENST00000309641 PRR23AA6NEV1 266 aa9.2□□□□□ -0.94
PDE4D-201ENST00000309641 FAM47DPA6NHR8 397 aa9.2□□□□□ -0.94
PDE4D-201ENST00000309641 PRNPP04156 253 aa9.2□□□□□ -0.94
PDE4D-201ENST00000309641 PRKCGP05129 697 aa9.2□□□□□ -0.94
PDE4D-201ENST00000309641 MMP2P08253 660 aa9.2□□□□□ -0.94
PDE4D-201ENST00000309641 CD68P34810 354 aaPredicted RBP9.2□□□□□ -0.94
PDE4D-201ENST00000309641 PTPN5P54829 565 aa9.2□□□□□ -0.94
PDE4D-201ENST00000309641 TAS2R38P59533 333 aa9.2□□□□□ -0.94
PDE4D-201ENST00000309641 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP9.2□□□□□ -0.94
PDE4D-201ENST00000309641 SEMG2Q02383 582 aa9.2□□□□□ -0.94
PDE4D-201ENST00000309641 ITKQ08881 620 aa9.2□□□□□ -0.94
PDE4D-201ENST00000309641 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP9.2□□□□□ -0.94
PDE4D-201ENST00000309641 SNX1Q13596 522 aa9.2□□□□□ -0.94
PDE4D-201ENST00000309641 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa9.2□□□□□ -0.94
PDE4D-201ENST00000309641 AGBL4Q5VU57 503 aa9.2□□□□□ -0.94
PDE4D-201ENST00000309641 NCEH1Q6PIU2 408 aa9.2□□□□□ -0.94
PDE4D-201ENST00000309641 GDPD4Q6W3E5 623 aa9.2□□□□□ -0.94
PDE4D-201ENST00000309641 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
PDE4D-201ENST00000309641 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
PDE4D-201ENST00000309641 DSG4Q86SJ6 1040 aa9.2□□□□□ -0.94
PDE4D-201ENST00000309641 TMEFF1Q8IYR6 380 aa9.2□□□□□ -0.94
PDE4D-201ENST00000309641 ZNF567Q8N184 647 aa9.2□□□□□ -0.94
PDE4D-201ENST00000309641 NSMCE1Q8WV22 266 aa9.2□□□□□ -0.94
PDE4D-201ENST00000309641 FATE1Q969F0 183 aa9.2□□□□□ -0.94
PDE4D-201ENST00000309641 SMIM14Q96QK8 99 aa9.2□□□□□ -0.94
PDE4D-201ENST00000309641 PRRX2Q99811 253 aa9.2□□□□□ -0.94
PDE4D-201ENST00000309641 OMDQ99983 421 aa9.2□□□□□ -0.94
PDE4D-201ENST00000309641 GPR174Q9BXC1 333 aa9.2□□□□□ -0.94
PDE4D-201ENST00000309641 USP29Q9HBJ7 922 aa9.2□□□□□ -0.94
PDE4D-201ENST00000309641 GGT7Q9UJ14 662 aa9.2□□□□□ -0.94
PDE4D-201ENST00000309641 SNX12Q9UMY4 172 aa9.2□□□□□ -0.94
PDE4D-201ENST00000309641 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa9.2□□□□□ -0.94
PDE4D-201ENST00000309641 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa9.2□□□□□ -0.94
PDE4D-201ENST00000309641 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa9.2□□□□□ -0.94
PDE4D-201ENST00000309641 THADAQ6YHU6 1953 aa9.19□□□□□ -0.94
PDE4D-201ENST00000309641 DMXL1Q9Y485 3027 aa9.19□□□□□ -0.94
PDE4D-201ENST00000309641 C16orf96A6NNT2 1141 aa9.19□□□□□ -0.94
PDE4D-201ENST00000309641 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa9.19□□□□□ -0.94
PDE4D-201ENST00000309641 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
PDE4D-201ENST00000309641 SPINT1O43278 529 aa9.19□□□□□ -0.94
PDE4D-201ENST00000309641 ZNF217O75362 1048 aa9.19□□□□□ -0.94
PDE4D-201ENST00000309641 ADH1BP00325 375 aa9.19□□□□□ -0.94
PDE4D-201ENST00000309641 IGLV3-19P01714 112 aa9.19□□□□□ -0.94
PDE4D-201ENST00000309641 ABL2P42684 1182 aa9.19□□□□□ -0.94
PDE4D-201ENST00000309641 PTGER3P43115 390 aa9.19□□□□□ -0.94
PDE4D-201ENST00000309641 GDF10P55107 478 aa9.19□□□□□ -0.94
PDE4D-201ENST00000309641 ZBTB16Q05516 673 aa9.19□□□□□ -0.94
PDE4D-201ENST00000309641 TRAF2Q12933 501 aa9.19□□□□□ -0.94
PDE4D-201ENST00000309641 XRCC4Q13426 336 aa9.19□□□□□ -0.94
PDE4D-201ENST00000309641 TEX44Q53QW1 395 aa9.19□□□□□ -0.94
PDE4D-201ENST00000309641 ZNF805Q5CZA5 627 aa9.19□□□□□ -0.94
PDE4D-201ENST00000309641 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
PDE4D-201ENST00000309641 PRR23BQ6ZRT6 265 aa9.19□□□□□ -0.94
PDE4D-201ENST00000309641 ARMCX6Q7L4S7 300 aa9.19□□□□□ -0.94
PDE4D-201ENST00000309641 PRUNE1Q86TP1 453 aa9.19□□□□□ -0.94
PDE4D-201ENST00000309641 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa9.19□□□□□ -0.94
PDE4D-201ENST00000309641 RASGEF1CQ8N431 466 aa9.19□□□□□ -0.94
PDE4D-201ENST00000309641 SPATA22Q8NHS9 363 aa9.19□□□□□ -0.94
PDE4D-201ENST00000309641 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa9.19□□□□□ -0.94
PDE4D-201ENST00000309641 HTR3CQ8WXA8 447 aa9.19□□□□□ -0.94
PDE4D-201ENST00000309641 FAM131CQ96AQ9 280 aa9.19□□□□□ -0.94
PDE4D-201ENST00000309641 NUDCD1Q96RS6 583 aa9.19□□□□□ -0.94
PDE4D-201ENST00000309641 TMEM121Q9BTD3 319 aa9.19□□□□□ -0.94
PDE4D-201ENST00000309641 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
PDE4D-201ENST00000309641 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
PDE4D-201ENST00000309641 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
PDE4D-201ENST00000309641 ITM2BQ9Y287 266 aa9.19□□□□□ -0.94
PDE4D-201ENST00000309641 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa9.19□□□□□ -0.94
PDE4D-201ENST00000309641 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa9.19□□□□□ -0.94
PDE4D-201ENST00000309641 BPTFQ12830 3046 aa9.19□□□□□ -0.94
PDE4D-201ENST00000309641 A0A0U1RQS6 177 aa9.19□□□□□ -0.94
PDE4D-201ENST00000309641 HACD1B0YJ81 288 aa9.19□□□□□ -0.94
PDE4D-201ENST00000309641 KCNN4O15554 427 aa9.19□□□□□ -0.94
PDE4D-201ENST00000309641 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
PDE4D-201ENST00000309641 PDHA1P08559 390 aa9.19□□□□□ -0.94
PDE4D-201ENST00000309641 ITGB7P26010 798 aa9.19□□□□□ -0.94
PDE4D-201ENST00000309641 CD6P30203 668 aa9.19□□□□□ -0.94
PDE4D-201ENST00000309641 CD86P42081 329 aa9.19□□□□□ -0.94
PDE4D-201ENST00000309641 CSNK1DP48730 415 aa9.19□□□□□ -0.94
PDE4D-201ENST00000309641 ADPRHP54922 357 aa9.19□□□□□ -0.94
PDE4D-201ENST00000309641 NHLH1Q02575 133 aa9.19□□□□□ -0.94
PDE4D-201ENST00000309641 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
PDE4D-201ENST00000309641 ZNF33AQ06730 810 aa9.19□□□□□ -0.94
PDE4D-201ENST00000309641 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.2 ms