RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246024.6

TMX4-201, Transcript of thioredoxin related transmembrane protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMX4, Length 6,169 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMX4-201ENST00000246024 FAM92AA1XBS5 289 aa13.58□□□□□ -0.23
TMX4-201ENST00000246024 PDE9AO76083 593 aa13.58□□□□□ -0.23
TMX4-201ENST00000246024 CASP5P51878 434 aa13.58□□□□□ -0.23
TMX4-201ENST00000246024 RABGGTBP53611 331 aa13.58□□□□□ -0.23
TMX4-201ENST00000246024 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa13.58□□□□□ -0.23
TMX4-201ENST00000246024 SPANXN3Q5MJ09 141 aa13.58□□□□□ -0.23
TMX4-201ENST00000246024 PGBD2Q6P3X8 592 aa13.58□□□□□ -0.23
TMX4-201ENST00000246024 ZNF563Q8TA94 476 aa13.58□□□□□ -0.23
TMX4-201ENST00000246024 DGCR6LQ9BY27 220 aa13.58□□□□□ -0.23
TMX4-201ENST00000246024 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa13.58□□□□□ -0.23
TMX4-201ENST00000246024 ATAD3AQ9NVI7 634 aa13.58□□□□□ -0.23
TMX4-201ENST00000246024 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa13.58□□□□□ -0.23
TMX4-201ENST00000246024 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP13.58□□□□□ -0.23
TMX4-201ENST00000246024 PIK3CDO00329 1044 aa13.58□□□□□ -0.24
TMX4-201ENST00000246024 FFAR3O14843 346 aa13.58□□□□□ -0.24
TMX4-201ENST00000246024 GPR42O15529 346 aa13.58□□□□□ -0.24
TMX4-201ENST00000246024 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP13.58□□□□□ -0.24
TMX4-201ENST00000246024 IGFALSP35858 605 aa13.58□□□□□ -0.24
TMX4-201ENST00000246024 LIN54Q6MZP7 749 aa13.58□□□□□ -0.24
TMX4-201ENST00000246024 NEK5Q6P3R8 708 aa13.58□□□□□ -0.24
TMX4-201ENST00000246024 CNSTQ6PJW8 725 aa13.58□□□□□ -0.24
TMX4-201ENST00000246024 RASAL3Q86YV0 1011 aa13.58□□□□□ -0.24
TMX4-201ENST00000246024 LZTR1Q8N653 840 aa13.58□□□□□ -0.24
TMX4-201ENST00000246024 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP13.58□□□□□ -0.24
TMX4-201ENST00000246024 KLRG1Q96E93 195 aa13.58□□□□□ -0.24
TMX4-201ENST00000246024 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa13.58□□□□□ -0.24
TMX4-201ENST00000246024 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa13.58□□□□□ -0.24
TMX4-201ENST00000246024 TBC1D3EA0A087X179 549 aa13.58□□□□□ -0.24
TMX4-201ENST00000246024 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa13.58□□□□□ -0.24
TMX4-201ENST00000246024 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP13.58□□□□□ -0.24
TMX4-201ENST00000246024 TBC1D3LB9A6J9 549 aa13.58□□□□□ -0.24
TMX4-201ENST00000246024 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP13.58□□□□□ -0.24
TMX4-201ENST00000246024 TBC1D3HP0C7X1 549 aa13.58□□□□□ -0.24
TMX4-201ENST00000246024 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP13.58□□□□□ -0.24
TMX4-201ENST00000246024 RPL9P32969 192 aaKnown RBP13.58□□□□□ -0.24
TMX4-201ENST00000246024 KLHL12Q53G59 568 aa13.58□□□□□ -0.24
TMX4-201ENST00000246024 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa13.58□□□□□ -0.24
TMX4-201ENST00000246024 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa13.58□□□□□ -0.24
TMX4-201ENST00000246024 C16orf46Q6P387 395 aa13.58□□□□□ -0.24
TMX4-201ENST00000246024 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP13.58□□□□□ -0.24
TMX4-201ENST00000246024 C12orf29Q8N999 325 aa13.58□□□□□ -0.24
TMX4-201ENST00000246024 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP13.58□□□□□ -0.24
TMX4-201ENST00000246024 IKZF4Q9H2S9 585 aa13.58□□□□□ -0.24
TMX4-201ENST00000246024 TLE6Q9H808 572 aa13.58□□□□□ -0.24
TMX4-201ENST00000246024 KCNH1O95259 989 aa13.58□□□□□ -0.24
TMX4-201ENST00000246024 PIRTP0C851 137 aa13.58□□□□□ -0.24
TMX4-201ENST00000246024 SEC13P55735 322 aa13.58□□□□□ -0.24
TMX4-201ENST00000246024 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa13.58□□□□□ -0.24
TMX4-201ENST00000246024 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP13.58□□□□□ -0.24
TMX4-201ENST00000246024 LMAN2LQ9H0V9 348 aa13.58□□□□□ -0.24
TMX4-201ENST00000246024 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP13.58□□□□□ -0.24
TMX4-201ENST00000246024 CD248Q9HCU0 757 aa13.58□□□□□ -0.24
TMX4-201ENST00000246024 MBD2Q9UBB5 411 aa13.58□□□□□ -0.24
TMX4-201ENST00000246024 COPG2Q9UBF2 871 aa13.58□□□□□ -0.24
TMX4-201ENST00000246024 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP13.58□□□□□ -0.24
TMX4-201ENST00000246024 TRHDEQ9UKU6 1024 aa13.58□□□□□ -0.24
TMX4-201ENST00000246024 CDH9Q9ULB4 789 aa13.58□□□□□ -0.24
TMX4-201ENST00000246024 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa13.58□□□□□ -0.24
TMX4-201ENST00000246024 STX16O14662 325 aa13.58□□□□□ -0.24
TMX4-201ENST00000246024 GCATO75600 419 aa13.58□□□□□ -0.24
TMX4-201ENST00000246024 FAM58BPP0C7Q3 252 aa13.58□□□□□ -0.24
TMX4-201ENST00000246024 PFKFB4Q16877 469 aa13.58□□□□□ -0.24
TMX4-201ENST00000246024 FAM187BQ17R55 369 aa13.58□□□□□ -0.24
TMX4-201ENST00000246024 POU5F2Q8N7G0 328 aa13.58□□□□□ -0.24
TMX4-201ENST00000246024 UBE2E3Q969T4 207 aa13.58□□□□□ -0.24
TMX4-201ENST00000246024 RABGEF1Q9UJ41 708 aa13.58□□□□□ -0.24
TMX4-201ENST00000246024 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP13.57□□□□□ -0.24
TMX4-201ENST00000246024 PRKCZQ05513 592 aa13.57□□□□□ -0.24
TMX4-201ENST00000246024 MCL1Q07820 350 aa13.57□□□□□ -0.24
TMX4-201ENST00000246024 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP13.57□□□□□ -0.24
TMX4-201ENST00000246024 ERGIC2Q96RQ1 377 aa13.57□□□□□ -0.24
TMX4-201ENST00000246024 CPNE1Q99829 537 aa13.57□□□□□ -0.24
TMX4-201ENST00000246024 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa13.57□□□□□ -0.24
TMX4-201ENST00000246024 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP13.57□□□□□ -0.24
TMX4-201ENST00000246024 USP2O75604 605 aaPredicted RBP13.57□□□□□ -0.24
TMX4-201ENST00000246024 NEK3P51956 506 aa13.57□□□□□ -0.24
TMX4-201ENST00000246024 OAZ1P54368 228 aa13.57□□□□□ -0.24
TMX4-201ENST00000246024 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa13.57□□□□□ -0.24
TMX4-201ENST00000246024 VPS35Q96QK1 796 aa13.57□□□□□ -0.24
TMX4-201ENST00000246024 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP13.57□□□□□ -0.24
TMX4-201ENST00000246024 BMP7P18075 431 aa13.57□□□□□ -0.24
TMX4-201ENST00000246024 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP13.57□□□□□ -0.24
TMX4-201ENST00000246024 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP13.57□□□□□ -0.24
TMX4-201ENST00000246024 PUDPQ08623 228 aa13.57□□□□□ -0.24
TMX4-201ENST00000246024 HECTD3Q5T447 861 aa13.57□□□□□ -0.24
TMX4-201ENST00000246024 NPNTQ6UXI9 565 aa13.57□□□□□ -0.24
TMX4-201ENST00000246024 GPR135Q8IZ08 494 aa13.57□□□□□ -0.24
TMX4-201ENST00000246024 CFAP52Q8N1V2 620 aa13.57□□□□□ -0.24
TMX4-201ENST00000246024 STK40Q8N2I9 435 aa13.57□□□□□ -0.24
TMX4-201ENST00000246024 ALG9Q9H6U8 611 aa13.57□□□□□ -0.24
TMX4-201ENST00000246024 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP13.57□□□□□ -0.24
TMX4-201ENST00000246024 SERPINE1P05121 402 aa13.57□□□□□ -0.24
TMX4-201ENST00000246024 TTI2Q6NXR4 508 aa13.57□□□□□ -0.24
TMX4-201ENST00000246024 MZT2AQ6P582 158 aa13.57□□□□□ -0.24
TMX4-201ENST00000246024 MOXD1Q6UVY6 613 aa13.57□□□□□ -0.24
TMX4-201ENST00000246024 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa13.57□□□□□ -0.24
TMX4-201ENST00000246024 ZNF410Q86VK4 478 aa13.57□□□□□ -0.24
TMX4-201ENST00000246024 ABRAQ8N0Z2 381 aa13.57□□□□□ -0.24
TMX4-201ENST00000246024 TSPAN14Q8NG11 270 aa13.57□□□□□ -0.24
TMX4-201ENST00000246024 SCLYQ96I15 445 aa13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.1 ms