RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551473.5

CS-228, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 797 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-228ENST00000551473 MACC1Q6ZN28 852 aa12.14□□□□□ -0.47
CS-228ENST00000551473 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa12.14□□□□□ -0.47
CS-228ENST00000551473 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa12.14□□□□□ -0.47
CS-228ENST00000551473 RBFAQ8N0V3 343 aa12.14□□□□□ -0.47
CS-228ENST00000551473 CCDC74AQ96AQ1 378 aa12.14□□□□□ -0.47
CS-228ENST00000551473 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa12.14□□□□□ -0.47
CS-228ENST00000551473 PSMB7Q99436 277 aa12.14□□□□□ -0.47
CS-228ENST00000551473 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP12.14□□□□□ -0.47
CS-228ENST00000551473 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP12.14□□□□□ -0.47
CS-228ENST00000551473 TMEM51Q9NW97 253 aa12.14□□□□□ -0.47
CS-228ENST00000551473 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP12.14□□□□□ -0.47
CS-228ENST00000551473 COX16Q9P0S2 106 aa12.14□□□□□ -0.47
CS-228ENST00000551473 GULP1Q9UBP9 304 aa12.14□□□□□ -0.47
CS-228ENST00000551473 HPSEQ9Y251 543 aa12.14□□□□□ -0.47
CS-228ENST00000551473 HS3ST4Q9Y661 456 aa12.14□□□□□ -0.47
CS-228ENST00000551473 WASF2Q9Y6W5 498 aa12.14□□□□□ -0.47
CS-228ENST00000551473 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa12.14□□□□□ -0.47
CS-228ENST00000551473 IGLON5A6NGN9 336 aa12.13□□□□□ -0.47
CS-228ENST00000551473 E5RJQ4 531 aa12.13□□□□□ -0.47
CS-228ENST00000551473 K7ERQ8 282 aa12.13□□□□□ -0.47
CS-228ENST00000551473 P4HA2O15460 535 aa12.13□□□□□ -0.47
CS-228ENST00000551473 HSF2BPO75031 334 aa12.13□□□□□ -0.47
CS-228ENST00000551473 CTSEP14091 401 aa12.13□□□□□ -0.47
CS-228ENST00000551473 TSHRP16473 764 aa12.13□□□□□ -0.47
CS-228ENST00000551473 FMO5P49326 533 aa12.13□□□□□ -0.47
CS-228ENST00000551473 ATP1A2P50993 1020 aa12.13□□□□□ -0.47
CS-228ENST00000551473 CCL7P80098 99 aa12.13□□□□□ -0.47
CS-228ENST00000551473 FOXK1P85037 733 aa12.13□□□□□ -0.47
CS-228ENST00000551473 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP12.13□□□□□ -0.47
CS-228ENST00000551473 C4orf17Q53FE4 359 aa12.13□□□□□ -0.47
CS-228ENST00000551473 EFHC1Q5JVL4 640 aa12.13□□□□□ -0.47
CS-228ENST00000551473 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP12.13□□□□□ -0.47
CS-228ENST00000551473 LRRC31Q6UY01 552 aa12.13□□□□□ -0.47
CS-228ENST00000551473 GKN2Q86XP6 184 aa12.13□□□□□ -0.47
CS-228ENST00000551473 DTX1Q86Y01 620 aa12.13□□□□□ -0.47
CS-228ENST00000551473 DEFB106AQ8N104 65 aa12.13□□□□□ -0.47
CS-228ENST00000551473 FAM26EQ8N5C1 309 aa12.13□□□□□ -0.47
CS-228ENST00000551473 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP12.13□□□□□ -0.47
CS-228ENST00000551473 SLC35C1Q96A29 364 aa12.13□□□□□ -0.47
CS-228ENST00000551473 SLC2A13Q96QE2 648 aa12.13□□□□□ -0.47
CS-228ENST00000551473 FUCA2Q9BTY2 467 aa12.13□□□□□ -0.47
CS-228ENST00000551473 FOXP3Q9BZS1 431 aa12.13□□□□□ -0.47
CS-228ENST00000551473 TNKS2Q9H2K2 1166 aa12.13□□□□□ -0.47
CS-228ENST00000551473 LRRN3Q9H3W5 708 aa12.13□□□□□ -0.47
CS-228ENST00000551473 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa12.13□□□□□ -0.47
CS-228ENST00000551473 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa12.13□□□□□ -0.47
CS-228ENST00000551473 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP12.12□□□□□ -0.47
CS-228ENST00000551473 TRPM6Q9BX84 2022 aa12.12□□□□□ -0.47
CS-228ENST00000551473 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa12.12□□□□□ -0.47
CS-228ENST00000551473 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa12.12□□□□□ -0.47
CS-228ENST00000551473 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP12.12□□□□□ -0.47
CS-228ENST00000551473 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP12.12□□□□□ -0.47
CS-228ENST00000551473 PRAMEF10O60809 474 aa12.12□□□□□ -0.47
CS-228ENST00000551473 PAGE1O75459 146 aa12.12□□□□□ -0.47
CS-228ENST00000551473 ADCY5O95622 1261 aa12.12□□□□□ -0.47
CS-228ENST00000551473 HGFP14210 728 aa12.12□□□□□ -0.47
CS-228ENST00000551473 CASRP41180 1078 aa12.12□□□□□ -0.47
CS-228ENST00000551473 DNA2P51530 1060 aa12.12□□□□□ -0.47
CS-228ENST00000551473 SNX16P57768 344 aa12.12□□□□□ -0.47
CS-228ENST00000551473 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP12.12□□□□□ -0.47
CS-228ENST00000551473 LRRC63Q05C16 580 aa12.12□□□□□ -0.47
CS-228ENST00000551473 KCNAB2Q13303 367 aa12.12□□□□□ -0.47
CS-228ENST00000551473 CARD16Q5EG05 197 aa12.12□□□□□ -0.47
CS-228ENST00000551473 TPRG1LQ5T0D9 272 aa12.12□□□□□ -0.47
CS-228ENST00000551473 LINGO4Q6UY18 593 aa12.12□□□□□ -0.47
CS-228ENST00000551473 ZNF783Q6ZMS7 281 aa12.12□□□□□ -0.47
CS-228ENST00000551473 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP12.12□□□□□ -0.47
CS-228ENST00000551473 VASH2Q86V25 355 aa12.12□□□□□ -0.47
CS-228ENST00000551473 ATL2Q8NHH9 583 aa12.12□□□□□ -0.47
CS-228ENST00000551473 CATSPER2Q96P56 530 aa12.12□□□□□ -0.47
CS-228ENST00000551473 EDEM3Q9BZQ6 932 aa12.12□□□□□ -0.47
CS-228ENST00000551473 CLPBQ9H078 707 aa12.12□□□□□ -0.47
CS-228ENST00000551473 SIK2Q9H0K1 926 aa12.12□□□□□ -0.47
CS-228ENST00000551473 EPN3Q9H201 632 aa12.12□□□□□ -0.47
CS-228ENST00000551473 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP12.12□□□□□ -0.47
CS-228ENST00000551473 RMND1Q9NWS8 449 aa12.12□□□□□ -0.47
CS-228ENST00000551473 RRN3Q9NYV6 651 aa12.12□□□□□ -0.47
CS-228ENST00000551473 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa12.11□□□□□ -0.47
CS-228ENST00000551473 A0A1W2PQM1 296 aa12.11□□□□□ -0.47
CS-228ENST00000551473 CLEC18AA5D8T8 446 aa12.11□□□□□ -0.47
CS-228ENST00000551473 STMND1H3BQB6 276 aa12.11□□□□□ -0.47
CS-228ENST00000551473 KRT5P13647 590 aa12.11□□□□□ -0.47
CS-228ENST00000551473 PNLIPP16233 465 aa12.11□□□□□ -0.47
CS-228ENST00000551473 HTR1BP28222 390 aa12.11□□□□□ -0.47
CS-228ENST00000551473 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP12.11□□□□□ -0.47
CS-228ENST00000551473 CCR10P46092 362 aa12.11□□□□□ -0.47
CS-228ENST00000551473 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP12.11□□□□□ -0.47
CS-228ENST00000551473 PEX5P50542 639 aa12.11□□□□□ -0.47
CS-228ENST00000551473 IRAK1P51617 712 aa12.11□□□□□ -0.47
CS-228ENST00000551473 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP12.11□□□□□ -0.47
CS-228ENST00000551473 NME3Q13232 169 aa12.11□□□□□ -0.47
CS-228ENST00000551473 PDCLQ13371 301 aa12.11□□□□□ -0.47
CS-228ENST00000551473 CLCA4Q14CN2 919 aa12.11□□□□□ -0.47
CS-228ENST00000551473 COBLL1Q53SF7 1204 aa12.11□□□□□ -0.47
CS-228ENST00000551473 BRMS1LQ5PSV4 323 aa12.11□□□□□ -0.47
CS-228ENST00000551473 DENND1BQ6P3S1 775 aa12.11□□□□□ -0.47
CS-228ENST00000551473 CLEC18BQ6UXF7 455 aa12.11□□□□□ -0.47
CS-228ENST00000551473 KRBA2Q6ZNG9 492 aa12.11□□□□□ -0.47
CS-228ENST00000551473 ZFAND4Q86XD8 727 aa12.11□□□□□ -0.47
CS-228ENST00000551473 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.3 ms