RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515159.5

SLC38A9-222, Transcript of solute carrier family 38 member 9, human

TSL 2

Gene SLC38A9, Length 3,509 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SLC38A9-222	ENST00000515159	KREMEN1	Q96MU8	473 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	OR52B2	Q96RD2	323 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	TM9SF2	Q99805	663 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	FERMT1	Q9BQL6	677 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	OR51B5	Q9H339	312 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	ST6GALNAC4	Q9H4F1	302 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159		Q9H521	79 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	ZNF395	Q9H8N7	513 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	MARCH7	Q9H992	704 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	ZNF556	Q9HAH1	456 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	SNTG2	Q9NY99	539 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	USE1	Q9NZ43	259 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	OPTC	Q9UBM4	332 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	FAM198A	Q9UFP1	575 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	CNOT6	Q9ULM6	557 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	SMCHD1	A6NHR9	2005 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159		A0A0U1RQF3	1178 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	METTL15	A6NJ78	407 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	MEI4	A8MW99	385 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	PSMD11	O00231	422 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	DSCR3	O14972	297 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	PROC	P04070	461 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	SNRPA	P09012	282 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	PSMC3	P17980	439 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	CCR10	P46092	362 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	RPS5	P46782	204 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	CDH15	P55291	814 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	GPC5	P78333	572 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	REL	Q04864	619 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	MAP2K5	Q13163	448 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	TRIP10	Q15642	601 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	CCDC6	Q16204	474 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	KYAT1	Q16773	422 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	ATF7IP2	Q5U623	682 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	ANKRD22	Q5VYY1	191 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	STEAP3	Q658P3	488 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	TTBK2	Q6IQ55	1244 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	PPP1R18	Q6NYC8	613 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	PADI6	Q6TGC4	694 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	CCDC149	Q6ZUS6	474 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	DGLUCY	Q7Z3D6	616 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	PCGF5	Q86SE9	256 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	PM20D2	Q8IYS1	436 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	BMPER	Q8N8U9	685 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	SLC44A5	Q8NCS7	719 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	MAPK15	Q8TD08	544 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	GRK7	Q8WTQ7	553 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	FAR1	Q8WVX9	515 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	HPS1	Q92902	700 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	FAM89A	Q96GI7	184 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	PHOX2B	Q99453	314 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	C1QTNF1	Q9BXJ1	281 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	RNF38	Q9H0F5	515 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	ZBTB26	Q9HCK0	441 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	FNIP2	Q9P278	1114 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	SEPT3	Q9UH03	358 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	VAV3	Q9UKW4	847 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	VPS4A	Q9UN37	437 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	GRID2	O43424	1007 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	ITGB3	P05106	788 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	ITGAM	P11215	1152 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	RALB	P11234	206 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	CDH1	P12830	882 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	EIF2AK2	P19525	551 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	LHCGR	P22888	699 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	CA8	P35219	290 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	FMO5	P49326	533 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	COPA	P53621	1224 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	PDIA2	Q13087	525 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	SQLE	Q14534	574 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	IRF3	Q14653	427 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	AOC3	Q16853	763 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	LETM2	Q2VYF4	491 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	C6orf132	Q5T0Z8	1188 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	MLIP	Q5VWP3	458 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	TATDN1	Q6P1N9	297 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	GALNT18	Q6P9A2	607 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	FKBP9P1	Q75LS8	142 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	STRADA	Q7RTN6	431 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	GPBP1	Q86WP2	473 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	SNX32	Q86XE0	403 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	ZNF677	Q86XU0	584 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	DNAJC10	Q8IXB1	793 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	SCML4	Q8N228	414 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	JPH3	Q8WXH2	748 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	LPGAT1	Q92604	370 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	DCPS	Q96C86	337 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	OR2A14	Q96R47	310 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	P2RX7	Q99572	595 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	SH2D3A	Q9BRG2	576 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	PAIP1	Q9H074	479 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	CAAP1	Q9H8G2	361 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	POLH	Q9Y253	713 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	AP4S1	Q9Y587	144 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	TNPO3	Q9Y5L0	923 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	COL5A2	P05997	1499 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	PMS2P1	A4D2B8	440 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	EVPLL	A8MZ36	301 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	EEF2K	O00418	725 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SLC38A9-222	ENST00000515159	PAPSS1	O43252	624 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68

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