RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436282.1

TOP3B-206, Transcript of DNA topoisomerase III beta, humanhuman

TSL 2

Gene TOP3B, Length 2,890 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3B-206ENST00000436282 DNAI2Q9GZS0 605 aa15.12■□□□□ 0.01
TOP3B-206ENST00000436282 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa15.12■□□□□ 0.01
TOP3B-206ENST00000436282 TANC1Q9C0D5 1861 aa15.12■□□□□ 0.01
TOP3B-206ENST00000436282 E7ENX8 843 aa15.12■□□□□ 0.01
TOP3B-206ENST00000436282 PDHXO00330 501 aa15.12■□□□□ 0.01
TOP3B-206ENST00000436282 CD97P48960 835 aa15.12■□□□□ 0.01
TOP3B-206ENST00000436282 CCNA1P78396 465 aa15.12■□□□□ 0.01
TOP3B-206ENST00000436282 CATSPER4Q7RTX7 472 aa15.12■□□□□ 0.01
TOP3B-206ENST00000436282 GPR141Q7Z602 305 aa15.12■□□□□ 0.01
TOP3B-206ENST00000436282 LZTR1Q8N653 840 aa15.12■□□□□ 0.01
TOP3B-206ENST00000436282 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP15.12■□□□□ 0.01
TOP3B-206ENST00000436282 MFSD3Q96ES6 412 aa15.12■□□□□ 0.01
TOP3B-206ENST00000436282 GPR22Q99680 433 aa15.12■□□□□ 0.01
TOP3B-206ENST00000436282 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP15.12■□□□□ 0.01
TOP3B-206ENST00000436282 CASS4Q9NQ75 786 aa15.12■□□□□ 0.01
TOP3B-206ENST00000436282 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP15.12■□□□□ 0.01
TOP3B-206ENST00000436282 BLOC1S6Q9UL45 172 aa15.12■□□□□ 0.01
TOP3B-206ENST00000436282 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa15.11■□□□□ 0.01
TOP3B-206ENST00000436282 HEATR9A2RTY3 570 aa15.11■□□□□ 0.01
TOP3B-206ENST00000436282 TRPC5OSA6NMA1 111 aa15.11■□□□□ 0.01
TOP3B-206ENST00000436282 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP15.11■□□□□ 0.01
TOP3B-206ENST00000436282 TRIM24O15164 1050 aa15.11■□□□□ 0.01
TOP3B-206ENST00000436282 PDGFRBP09619 1106 aa15.11■□□□□ 0.01
TOP3B-206ENST00000436282 GRM3Q14832 879 aa15.11■□□□□ 0.01
TOP3B-206ENST00000436282 FAM131BQ86XD5 332 aa15.11■□□□□ 0.01
TOP3B-206ENST00000436282 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP15.11■□□□□ 0.01
TOP3B-206ENST00000436282 DNAAF3Q8N9W5 541 aa15.11■□□□□ 0.01
TOP3B-206ENST00000436282 KDM1BQ8NB78 822 aa15.11■□□□□ 0.01
TOP3B-206ENST00000436282 SHCBP1Q8NEM2 672 aa15.11■□□□□ 0.01
TOP3B-206ENST00000436282 RNF139Q8WU17 664 aa15.11■□□□□ 0.01
TOP3B-206ENST00000436282 LPGAT1Q92604 370 aa15.11■□□□□ 0.01
TOP3B-206ENST00000436282 CIB1Q99828 191 aa15.11■□□□□ 0.01
TOP3B-206ENST00000436282 VTA1Q9NP79 307 aa15.11■□□□□ 0.01
TOP3B-206ENST00000436282 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP15.11■□□□□ 0.01
TOP3B-206ENST00000436282 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP15.11■□□□□ 0.01
TOP3B-206ENST00000436282 SARDHQ9UL12 918 aa15.11■□□□□ 0.01
TOP3B-206ENST00000436282 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa15.11■□□□□ 0.01
TOP3B-206ENST00000436282 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP15.11■□□□□ 0.01
TOP3B-206ENST00000436282 TRIM64CA6NLI5 447 aa15.11■□□□□ 0.01
TOP3B-206ENST00000436282 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP15.11■□□□□ 0.01
TOP3B-206ENST00000436282 GLRBP48167 497 aa15.11■□□□□ 0.01
TOP3B-206ENST00000436282 ESRRGP62508 458 aa15.11■□□□□ 0.01
TOP3B-206ENST00000436282 CBX3Q13185 183 aa15.11■□□□□ 0.01
TOP3B-206ENST00000436282 STX5Q13190 355 aa15.11■□□□□ 0.01
TOP3B-206ENST00000436282 KCTD21Q4G0X4 260 aa15.11■□□□□ 0.01
TOP3B-206ENST00000436282 MARCH8Q5T0T0 291 aa15.11■□□□□ 0.01
TOP3B-206ENST00000436282 ISOC1Q96CN7 298 aa15.11■□□□□ 0.01
TOP3B-206ENST00000436282 EFHD1Q9BUP0 239 aa15.11■□□□□ 0.01
TOP3B-206ENST00000436282 CDHR5Q9HBB8 845 aa15.11■□□□□ 0.01
TOP3B-206ENST00000436282 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa15.11■□□□□ 0.01
TOP3B-206ENST00000436282 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP15.11■□□□□ 0.01
TOP3B-206ENST00000436282 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP15.11■□□□□ 0.01
TOP3B-206ENST00000436282 TARM1B6A8C7 271 aa15.1■□□□□ 0.01
TOP3B-206ENST00000436282 PLOD2O00469 737 aa15.1■□□□□ 0.01
TOP3B-206ENST00000436282 SDHDO14521 159 aa15.1■□□□□ 0.01
TOP3B-206ENST00000436282 SMPD1P17405 629 aa15.1■□□□□ 0.01
TOP3B-206ENST00000436282 CDH15P55291 814 aa15.1■□□□□ 0.01
TOP3B-206ENST00000436282 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP15.1■□□□□ 0.01
TOP3B-206ENST00000436282 C16orf72Q14CZ0 275 aa15.1■□□□□ 0.01
TOP3B-206ENST00000436282 MAPRE2Q15555 327 aa15.1■□□□□ 0.01
TOP3B-206ENST00000436282 HMBOX1Q6NT76 420 aa15.1■□□□□ 0.01
TOP3B-206ENST00000436282 GPR180Q86V85 440 aa15.1■□□□□ 0.01
TOP3B-206ENST00000436282 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP15.1■□□□□ 0.01
TOP3B-206ENST00000436282 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP15.1■□□□□ 0.01
TOP3B-206ENST00000436282 PELI3Q8N2H9 469 aa15.1■□□□□ 0.01
TOP3B-206ENST00000436282 OR6J1Q8NGC5 347 aa15.1■□□□□ 0.01
TOP3B-206ENST00000436282 OSMRQ99650 979 aa15.1■□□□□ 0.01
TOP3B-206ENST00000436282 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP15.1■□□□□ 0.01
TOP3B-206ENST00000436282 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP15.1■□□□□ 0.01
TOP3B-206ENST00000436282 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP15.1■□□□□ 0.01
TOP3B-206ENST00000436282 A0A087WXM4 84 aa15.1■□□□□ 0.01
TOP3B-206ENST00000436282 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP15.1■□□□□ 0.01
TOP3B-206ENST00000436282 AKAP5P24588 427 aa15.1■□□□□ 0.01
TOP3B-206ENST00000436282 ADORA2BP29275 332 aa15.1■□□□□ 0.01
TOP3B-206ENST00000436282 LRP8Q14114 963 aa15.1■□□□□ 0.01
TOP3B-206ENST00000436282 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP15.1■□□□□ 0.01
TOP3B-206ENST00000436282 DGKDQ16760 1214 aa15.1■□□□□ 0.01
TOP3B-206ENST00000436282 ZBED5Q49AG3 693 aa15.1■□□□□ 0.01
TOP3B-206ENST00000436282 NHSL2Q5HYW2 709 aa15.1■□□□□ 0.01
TOP3B-206ENST00000436282 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa15.1■□□□□ 0.01
TOP3B-206ENST00000436282 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP15.1■□□□□ 0.01
TOP3B-206ENST00000436282 FAM47BQ8NA70 645 aa15.1■□□□□ 0.01
TOP3B-206ENST00000436282 KCTD4Q8WVF5 259 aa15.1■□□□□ 0.01
TOP3B-206ENST00000436282 PBXIP1Q96AQ6 731 aa15.1■□□□□ 0.01
TOP3B-206ENST00000436282 DPEP3Q9H4B8 488 aa15.1■□□□□ 0.01
TOP3B-206ENST00000436282 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP15.1■□□□□ 0.01
TOP3B-206ENST00000436282 MRGBPQ9NV56 204 aa15.1■□□□□ 0.01
TOP3B-206ENST00000436282 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa15.1■□□□□ 0.01
TOP3B-206ENST00000436282 HACD3Q9P035 362 aa15.1■□□□□ 0.01
TOP3B-206ENST00000436282 KLK14Q9P0G3 267 aa15.1■□□□□ 0.01
TOP3B-206ENST00000436282 EBF1Q9UH73 591 aa15.1■□□□□ 0.01
TOP3B-206ENST00000436282 NME7Q9Y5B8 376 aa15.1■□□□□ 0.01
TOP3B-206ENST00000436282 MAGEB16A2A368 324 aa15.1■□□□□ 0.01
TOP3B-206ENST00000436282 KCNK1O00180 336 aa15.1■□□□□ 0.01
TOP3B-206ENST00000436282 DLX3O60479 287 aa15.1■□□□□ 0.01
TOP3B-206ENST00000436282 LCP1P13796 627 aa15.1■□□□□ 0.01
TOP3B-206ENST00000436282 SLC12A1Q13621 1099 aa15.1■□□□□ 0.01
TOP3B-206ENST00000436282 USP10Q14694 798 aaKnown RBP15.1■□□□□ 0.01
TOP3B-206ENST00000436282 KYAT1Q16773 422 aa15.1■□□□□ 0.01
TOP3B-206ENST00000436282 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.5 ms