RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000335007.9

PPP1CC-201, Transcript of protein phosphatase 1 catalytic subunit gamma, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PPP1CC, Length 2,559 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1CC-201ENST00000335007 TNFSF13BQ9Y275 285 aa20.5■□□□□ 0.87
PPP1CC-201ENST00000335007 PHIPQ8WWQ0 1821 aa20.5■□□□□ 0.87
PPP1CC-201ENST00000335007 A0A1W2PPW3 197 aa20.49■□□□□ 0.87
PPP1CC-201ENST00000335007 K7EPI3 171 aa20.49■□□□□ 0.87
PPP1CC-201ENST00000335007 NOL3O60936 208 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
PPP1CC-201ENST00000335007 AP2A1O95782 977 aa20.49■□□□□ 0.87
PPP1CC-201ENST00000335007 GNAO1P09471 354 aa20.49■□□□□ 0.87
PPP1CC-201ENST00000335007 MERTKQ12866 999 aa20.49■□□□□ 0.87
PPP1CC-201ENST00000335007 PMS2P3Q13401 168 aa20.49■□□□□ 0.87
PPP1CC-201ENST00000335007 OLIG2Q13516 323 aa20.49■□□□□ 0.87
PPP1CC-201ENST00000335007 RAB39AQ14964 217 aa20.49■□□□□ 0.87
PPP1CC-201ENST00000335007 FAM45BPQ6NSW5 357 aa20.49■□□□□ 0.87
PPP1CC-201ENST00000335007 PYROXD2Q8N2H3 581 aa20.49■□□□□ 0.87
PPP1CC-201ENST00000335007 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
PPP1CC-201ENST00000335007 FAM45AQ8TCE6 357 aa20.49■□□□□ 0.87
PPP1CC-201ENST00000335007 SLC35F5Q8WV83 523 aa20.49■□□□□ 0.87
PPP1CC-201ENST00000335007 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
PPP1CC-201ENST00000335007 B3GNT5Q9BYG0 378 aa20.49■□□□□ 0.87
PPP1CC-201ENST00000335007 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa20.49■□□□□ 0.87
PPP1CC-201ENST00000335007 TMEM181Q9P2C4 612 aa20.49■□□□□ 0.87
PPP1CC-201ENST00000335007 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
PPP1CC-201ENST00000335007 FADS3Q9Y5Q0 445 aa20.49■□□□□ 0.87
PPP1CC-201ENST00000335007 LCTP09848 1927 aa20.49■□□□□ 0.87
PPP1CC-201ENST00000335007 SAC3D1A6NKF1 404 aa20.49■□□□□ 0.87
PPP1CC-201ENST00000335007 TMEM233B4DJY2 109 aa20.49■□□□□ 0.87
PPP1CC-201ENST00000335007 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa20.49■□□□□ 0.87
PPP1CC-201ENST00000335007 DLX3O60479 287 aa20.49■□□□□ 0.87
PPP1CC-201ENST00000335007 FUCA1P04066 466 aa20.49■□□□□ 0.87
PPP1CC-201ENST00000335007 COLGALT2Q8IYK4 626 aa20.49■□□□□ 0.87
PPP1CC-201ENST00000335007 CCNYL1Q8N7R7 359 aa20.49■□□□□ 0.87
PPP1CC-201ENST00000335007 KCTD4Q8WVF5 259 aa20.49■□□□□ 0.87
PPP1CC-201ENST00000335007 MFSD3Q96ES6 412 aa20.49■□□□□ 0.87
PPP1CC-201ENST00000335007 TMEM9Q9P0T7 183 aa20.49■□□□□ 0.87
PPP1CC-201ENST00000335007 CROTQ9UKG9 612 aa20.49■□□□□ 0.87
PPP1CC-201ENST00000335007 TRIM64BA6NI03 449 aa20.48■□□□□ 0.87
PPP1CC-201ENST00000335007 TARM1B6A8C7 271 aa20.48■□□□□ 0.87
PPP1CC-201ENST00000335007 STAG3L1P0CL83 205 aa20.48■□□□□ 0.87
PPP1CC-201ENST00000335007 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
PPP1CC-201ENST00000335007 EPHX2P34913 555 aa20.48■□□□□ 0.87
PPP1CC-201ENST00000335007 USP10Q14694 798 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
PPP1CC-201ENST00000335007 MAP7D1Q3KQU3 841 aa20.48■□□□□ 0.87
PPP1CC-201ENST00000335007 AGKQ53H12 422 aa20.48■□□□□ 0.87
PPP1CC-201ENST00000335007 NANOGP8Q6NSW7 305 aa20.48■□□□□ 0.87
PPP1CC-201ENST00000335007 SLC26A9Q7LBE3 791 aa20.48■□□□□ 0.87
PPP1CC-201ENST00000335007 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa20.48■□□□□ 0.87
PPP1CC-201ENST00000335007 CBR4Q8N4T8 237 aa20.48■□□□□ 0.87
PPP1CC-201ENST00000335007 CASS4Q9NQ75 786 aa20.48■□□□□ 0.87
PPP1CC-201ENST00000335007 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa20.48■□□□□ 0.87
PPP1CC-201ENST00000335007 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
PPP1CC-201ENST00000335007 MAGEB16A2A368 324 aa20.48■□□□□ 0.87
PPP1CC-201ENST00000335007 MRASO14807 208 aa20.48■□□□□ 0.87
PPP1CC-201ENST00000335007 XPOTO43592 962 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
PPP1CC-201ENST00000335007 SNAP91O60641 907 aa20.48■□□□□ 0.87
PPP1CC-201ENST00000335007 RAD17O75943 681 aa20.48■□□□□ 0.87
PPP1CC-201ENST00000335007 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
PPP1CC-201ENST00000335007 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
PPP1CC-201ENST00000335007 SAT1P21673 171 aa20.48■□□□□ 0.87
PPP1CC-201ENST00000335007 FSTL1Q12841 308 aa20.48■□□□□ 0.87
PPP1CC-201ENST00000335007 SLC36A3Q495N2 470 aa20.48■□□□□ 0.87
PPP1CC-201ENST00000335007 FGD3Q5JSP0 725 aa20.48■□□□□ 0.87
PPP1CC-201ENST00000335007 OGFOD2Q6N063 350 aa20.48■□□□□ 0.87
PPP1CC-201ENST00000335007 XKR5Q6UX68 686 aa20.48■□□□□ 0.87
PPP1CC-201ENST00000335007 HACD2Q6Y1H2 254 aa20.48■□□□□ 0.87
PPP1CC-201ENST00000335007 EXOC8Q8IYI6 725 aa20.48■□□□□ 0.87
PPP1CC-201ENST00000335007 CPNE9Q8IYJ1 553 aa20.48■□□□□ 0.87
PPP1CC-201ENST00000335007 HMGCLL1Q8TB92 370 aa20.48■□□□□ 0.87
PPP1CC-201ENST00000335007 CANT1Q8WVQ1 401 aa20.48■□□□□ 0.87
PPP1CC-201ENST00000335007 XPR1Q9UBH6 696 aa20.48■□□□□ 0.87
PPP1CC-201ENST00000335007 TMEM247A6NEH6 219 aa20.47■□□□□ 0.87
PPP1CC-201ENST00000335007 DLGAP1O14490 977 aa20.47■□□□□ 0.87
PPP1CC-201ENST00000335007 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
PPP1CC-201ENST00000335007 USP12O75317 370 aa20.47■□□□□ 0.87
PPP1CC-201ENST00000335007 E2F6O75461 281 aa20.47■□□□□ 0.87
PPP1CC-201ENST00000335007 CDH3P22223 829 aa20.47■□□□□ 0.87
PPP1CC-201ENST00000335007 GRIA3P42263 894 aa20.47■□□□□ 0.87
PPP1CC-201ENST00000335007 KCNC4Q03721 635 aa20.47■□□□□ 0.87
PPP1CC-201ENST00000335007 TMEM26Q6ZUK4 368 aa20.47■□□□□ 0.87
PPP1CC-201ENST00000335007 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa20.47■□□□□ 0.87
PPP1CC-201ENST00000335007 FAR2Q96K12 515 aa20.47■□□□□ 0.87
PPP1CC-201ENST00000335007 NEURL2Q9BR09 285 aa20.47■□□□□ 0.87
PPP1CC-201ENST00000335007 SLC25A23Q9BV35 468 aa20.47■□□□□ 0.87
PPP1CC-201ENST00000335007 RHOJQ9H4E5 214 aa20.47■□□□□ 0.87
PPP1CC-201ENST00000335007 PRDM12Q9H4Q4 367 aa20.47■□□□□ 0.87
PPP1CC-201ENST00000335007 ASB7Q9H672 318 aa20.47■□□□□ 0.87
PPP1CC-201ENST00000335007 GTSE1Q9NYZ3 720 aa20.47■□□□□ 0.87
PPP1CC-201ENST00000335007 FZD10Q9ULW2 581 aa20.47■□□□□ 0.87
PPP1CC-201ENST00000335007 RLFQ13129 1914 aa20.47■□□□□ 0.87
PPP1CC-201ENST00000335007 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
PPP1CC-201ENST00000335007 GABBR2O75899 941 aa20.47■□□□□ 0.87
PPP1CC-201ENST00000335007 SLC35E2BP0CK96 405 aa20.47■□□□□ 0.87
PPP1CC-201ENST00000335007 ATP1A4Q13733 1029 aa20.47■□□□□ 0.87
PPP1CC-201ENST00000335007 DCAF6Q58WW2 860 aa20.47■□□□□ 0.87
PPP1CC-201ENST00000335007 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
PPP1CC-201ENST00000335007 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
PPP1CC-201ENST00000335007 ERO1BQ86YB8 467 aa20.47■□□□□ 0.87
PPP1CC-201ENST00000335007 NETO2Q8NC67 525 aa20.47■□□□□ 0.87
PPP1CC-201ENST00000335007 MTMR14Q8NCE2 650 aa20.47■□□□□ 0.87
PPP1CC-201ENST00000335007 TRIM15Q9C019 465 aa20.47■□□□□ 0.87
PPP1CC-201ENST00000335007 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa20.47■□□□□ 0.87
PPP1CC-201ENST00000335007 CD320Q9NPF0 282 aa20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.7 ms