RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000253754.7

PDLIM4-201, Transcript of PDZ and LIM domain 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDLIM4, Length 2,282 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM4-201ENST00000253754 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa18.94■□□□□ 0.62
PDLIM4-201ENST00000253754 J3KR12 359 aa18.94■□□□□ 0.62
PDLIM4-201ENST00000253754 PSMD3O43242 534 aa18.94■□□□□ 0.62
PDLIM4-201ENST00000253754 HOXA2O43364 376 aa18.94■□□□□ 0.62
PDLIM4-201ENST00000253754 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP18.94■□□□□ 0.62
PDLIM4-201ENST00000253754 PSEN1P49768 467 aa18.94■□□□□ 0.62
PDLIM4-201ENST00000253754 SEPT6Q14141 434 aa18.94■□□□□ 0.62
PDLIM4-201ENST00000253754 IKBKEQ14164 716 aa18.94■□□□□ 0.62
PDLIM4-201ENST00000253754 CNGA3Q16281 694 aa18.94■□□□□ 0.62
PDLIM4-201ENST00000253754 ANO4Q32M45 955 aa18.94■□□□□ 0.62
PDLIM4-201ENST00000253754 MIB1Q86YT6 1006 aa18.94■□□□□ 0.62
PDLIM4-201ENST00000253754 SLC25A41Q8N5S1 370 aa18.94■□□□□ 0.62
PDLIM4-201ENST00000253754 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP18.94■□□□□ 0.62
PDLIM4-201ENST00000253754 PNPLA1Q8N8W4 532 aa18.94■□□□□ 0.62
PDLIM4-201ENST00000253754 HMCESQ96FZ2 354 aa18.94■□□□□ 0.62
PDLIM4-201ENST00000253754 SLC39A13Q96H72 371 aa18.94■□□□□ 0.62
PDLIM4-201ENST00000253754 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa18.94■□□□□ 0.62
PDLIM4-201ENST00000253754 RHOJQ9H4E5 214 aa18.94■□□□□ 0.62
PDLIM4-201ENST00000253754 TLR6Q9Y2C9 796 aa18.94■□□□□ 0.62
PDLIM4-201ENST00000253754 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa18.94■□□□□ 0.62
PDLIM4-201ENST00000253754 TCAF1Q9Y4C2 921 aa18.94■□□□□ 0.62
PDLIM4-201ENST00000253754 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa18.94■□□□□ 0.62
PDLIM4-201ENST00000253754 KRT36O76013 467 aa18.94■□□□□ 0.62
PDLIM4-201ENST00000253754 NEBLO76041 1014 aa18.94■□□□□ 0.62
PDLIM4-201ENST00000253754 PEX11BO96011 259 aa18.94■□□□□ 0.62
PDLIM4-201ENST00000253754 HMBSP08397 361 aa18.94■□□□□ 0.62
PDLIM4-201ENST00000253754 SBK3P0C264 359 aa18.94■□□□□ 0.62
PDLIM4-201ENST00000253754 SLC35E2BP0CK96 405 aa18.94■□□□□ 0.62
PDLIM4-201ENST00000253754 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP18.94■□□□□ 0.62
PDLIM4-201ENST00000253754 SLC11A1P49279 550 aa18.94■□□□□ 0.62
PDLIM4-201ENST00000253754 CSRP3P50461 194 aa18.94■□□□□ 0.62
PDLIM4-201ENST00000253754 ERFP50548 548 aa18.94■□□□□ 0.62
PDLIM4-201ENST00000253754 GEMP55040 296 aa18.94■□□□□ 0.62
PDLIM4-201ENST00000253754 TBX4P57082 545 aa18.94■□□□□ 0.62
PDLIM4-201ENST00000253754 CTXN3Q4LDR2 81 aa18.94■□□□□ 0.62
PDLIM4-201ENST00000253754 MS4A13Q5J8X5 152 aa18.94■□□□□ 0.62
PDLIM4-201ENST00000253754 POU5F2Q8N7G0 328 aa18.94■□□□□ 0.62
PDLIM4-201ENST00000253754 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP18.94■□□□□ 0.62
PDLIM4-201ENST00000253754 KCTD4Q8WVF5 259 aa18.94■□□□□ 0.62
PDLIM4-201ENST00000253754 GPR62Q9BZJ7 368 aa18.94■□□□□ 0.62
PDLIM4-201ENST00000253754 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa18.94■□□□□ 0.62
PDLIM4-201ENST00000253754 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP18.94■□□□□ 0.62
PDLIM4-201ENST00000253754 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP18.94■□□□□ 0.62
PDLIM4-201ENST00000253754 AP3B1O00203 1094 aa18.93■□□□□ 0.62
PDLIM4-201ENST00000253754 SIN3BO75182 1162 aa18.93■□□□□ 0.62
PDLIM4-201ENST00000253754 HSPA4LO95757 839 aa18.93■□□□□ 0.62
PDLIM4-201ENST00000253754 HTR7P34969 479 aa18.93■□□□□ 0.62
PDLIM4-201ENST00000253754 SLC1A2P43004 574 aa18.93■□□□□ 0.62
PDLIM4-201ENST00000253754 FAM171A1Q5VUB5 890 aa18.93■□□□□ 0.62
PDLIM4-201ENST00000253754 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP18.93■□□□□ 0.62
PDLIM4-201ENST00000253754 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP18.93■□□□□ 0.62
PDLIM4-201ENST00000253754 CEP97Q8IW35 865 aa18.93■□□□□ 0.62
PDLIM4-201ENST00000253754 ZNF683Q8IZ20 524 aa18.93■□□□□ 0.62
PDLIM4-201ENST00000253754 TMEM151AQ8N4L1 468 aa18.93■□□□□ 0.62
PDLIM4-201ENST00000253754 VWCEQ96DN2 955 aa18.93■□□□□ 0.62
PDLIM4-201ENST00000253754 FAM161BQ96MY7 647 aa18.93■□□□□ 0.62
PDLIM4-201ENST00000253754 SIKE1Q9BRV8 207 aa18.93■□□□□ 0.62
PDLIM4-201ENST00000253754 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP18.93■□□□□ 0.62
PDLIM4-201ENST00000253754 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP18.93■□□□□ 0.62
PDLIM4-201ENST00000253754 MAN1C1Q9NR34 630 aa18.93■□□□□ 0.62
PDLIM4-201ENST00000253754 PLA2G4CQ9UP65 541 aa18.93■□□□□ 0.62
PDLIM4-201ENST00000253754 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa18.93■□□□□ 0.62
PDLIM4-201ENST00000253754 VWA8A3KMH1 1905 aa18.93■□□□□ 0.62
PDLIM4-201ENST00000253754 AURKAO14965 403 aa18.93■□□□□ 0.62
PDLIM4-201ENST00000253754 CHRNGP07510 517 aa18.93■□□□□ 0.62
PDLIM4-201ENST00000253754 EN2P19622 333 aaPredicted RBP18.93■□□□□ 0.62
PDLIM4-201ENST00000253754 WNT3AP56704 352 aa18.93■□□□□ 0.62
PDLIM4-201ENST00000253754 SESN3P58005 492 aa18.93■□□□□ 0.62
PDLIM4-201ENST00000253754 IHHQ14623 411 aa18.93■□□□□ 0.62
PDLIM4-201ENST00000253754 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP18.93■□□□□ 0.62
PDLIM4-201ENST00000253754 TMPRSS6Q8IU80 811 aa18.93■□□□□ 0.62
PDLIM4-201ENST00000253754 SHKBP1Q8TBC3 707 aa18.93■□□□□ 0.62
PDLIM4-201ENST00000253754 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP18.93■□□□□ 0.62
PDLIM4-201ENST00000253754 C8orf48Q96LL4 319 aa18.93■□□□□ 0.62
PDLIM4-201ENST00000253754 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP18.93■□□□□ 0.62
PDLIM4-201ENST00000253754 CRISPLD1Q9H336 500 aa18.93■□□□□ 0.62
PDLIM4-201ENST00000253754 NT5MQ9NPB1 228 aa18.93■□□□□ 0.62
PDLIM4-201ENST00000253754 DNAJC28Q9NX36 388 aa18.93■□□□□ 0.62
PDLIM4-201ENST00000253754 TLK1Q9UKI8 766 aa18.93■□□□□ 0.62
PDLIM4-201ENST00000253754 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP18.93■□□□□ 0.62
PDLIM4-201ENST00000253754 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa18.93■□□□□ 0.62
PDLIM4-201ENST00000253754 MYLKQ15746 1914 aa18.92■□□□□ 0.62
PDLIM4-201ENST00000253754 ITGB8P26012 769 aa18.92■□□□□ 0.62
PDLIM4-201ENST00000253754 ITKQ08881 620 aa18.92■□□□□ 0.62
PDLIM4-201ENST00000253754 SLC10A7Q0GE19 358 aa18.92■□□□□ 0.62
PDLIM4-201ENST00000253754 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP18.92■□□□□ 0.62
PDLIM4-201ENST00000253754 CNKSR3Q6P9H4 555 aa18.92■□□□□ 0.62
PDLIM4-201ENST00000253754 RANBP10Q6VN20 620 aa18.92■□□□□ 0.62
PDLIM4-201ENST00000253754 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP18.92■□□□□ 0.62
PDLIM4-201ENST00000253754 MAPK15Q8TD08 544 aa18.92■□□□□ 0.62
PDLIM4-201ENST00000253754 IGSF8Q969P0 613 aa18.92■□□□□ 0.62
PDLIM4-201ENST00000253754 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP18.92■□□□□ 0.62
PDLIM4-201ENST00000253754 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP18.92■□□□□ 0.62
PDLIM4-201ENST00000253754 COG4Q9H9E3 785 aa18.92■□□□□ 0.62
PDLIM4-201ENST00000253754 TRIM13O60858 407 aa18.91■□□□□ 0.62
PDLIM4-201ENST00000253754 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP18.91■□□□□ 0.62
PDLIM4-201ENST00000253754 AOC1P19801 751 aa18.91■□□□□ 0.62
PDLIM4-201ENST00000253754 MXRA7P84157 204 aa18.91■□□□□ 0.62
PDLIM4-201ENST00000253754 RCN1Q15293 331 aa18.91■□□□□ 0.62
PDLIM4-201ENST00000253754 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.7 ms