RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639482.1

SPIN3-222, Transcript of spindlin family member 3, human

TSL 3

Gene SPIN3, Length 3,719 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPIN3-222	ENST00000639482	GCAT	O75600	419 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SPIN3-222	ENST00000639482	GABBR2	O75899	941 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SPIN3-222	ENST00000639482	SLC26A2	P50443	739 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SPIN3-222	ENST00000639482	SERPINB8	P50452	374 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SPIN3-222	ENST00000639482	CAP1	Q01518	475 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SPIN3-222	ENST00000639482	GRM3	Q14832	879 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SPIN3-222	ENST00000639482	POU6F1	Q14863	301 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SPIN3-222	ENST00000639482	MAP7D1	Q3KQU3	841 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SPIN3-222	ENST00000639482	AGK	Q53H12	422 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SPIN3-222	ENST00000639482	DEFB106A	Q8N104	65 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SPIN3-222	ENST00000639482	FAM47B	Q8NA70	645 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SPIN3-222	ENST00000639482	SERBP1	Q8NC51	408 aa	Known RBP eCLIP	10.2	□□□□□ -0.78
SPIN3-222	ENST00000639482	OR9I1	Q8NGQ6	314 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SPIN3-222	ENST00000639482	PHF21B	Q96EK2	531 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SPIN3-222	ENST00000639482	VPS39	Q96JC1	886 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SPIN3-222	ENST00000639482	GCOM2	Q9BZD3	368 aa	Predicted RBP	10.2	□□□□□ -0.78
SPIN3-222	ENST00000639482	C6orf203	Q9P0P8	240 aa	Predicted RBP	10.2	□□□□□ -0.78
SPIN3-222	ENST00000639482	PLOD2	O00469	737 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SPIN3-222	ENST00000639482	HDAC3	O15379	428 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SPIN3-222	ENST00000639482	GPC4	O75487	556 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SPIN3-222	ENST00000639482	MYC	P01106	439 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
SPIN3-222	ENST00000639482	RPL14	P50914	215 aa	Known RBP	10.19	□□□□□ -0.78
SPIN3-222	ENST00000639482	NIPAL4	Q0D2K0	466 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SPIN3-222	ENST00000639482	DCTN2	Q13561	401 aa	Known RBP	10.19	□□□□□ -0.78
SPIN3-222	ENST00000639482	SEMA5A	Q13591	1074 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SPIN3-222	ENST00000639482	GRM2	Q14416	872 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SPIN3-222	ENST00000639482	ACBD5	Q5T8D3	534 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
SPIN3-222	ENST00000639482	CXCL17	Q6UXB2	119 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SPIN3-222	ENST00000639482	KCNMB4	Q86W47	210 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SPIN3-222	ENST00000639482	LINC01465	Q8N7H1	131 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SPIN3-222	ENST00000639482	SLC45A3	Q96JT2	553 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SPIN3-222	ENST00000639482	XPR1	Q9UBH6	696 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SPIN3-222	ENST00000639482	MORF4L1	Q9UBU8	362 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SPIN3-222	ENST00000639482	C7orf72	A4D263	438 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SPIN3-222	ENST00000639482		M0QYT0	321 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SPIN3-222	ENST00000639482	PDLIM1	O00151	329 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SPIN3-222	ENST00000639482	CLDN5	O00501	218 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SPIN3-222	ENST00000639482	TPSB2	P20231	275 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SPIN3-222	ENST00000639482	LMO2	P25791	158 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SPIN3-222	ENST00000639482	SEPT6	Q14141	434 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SPIN3-222	ENST00000639482	TPSAB1	Q15661	275 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SPIN3-222	ENST00000639482	TMEM259	Q4ZIN3	620 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SPIN3-222	ENST00000639482	KLC3	Q6P597	504 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SPIN3-222	ENST00000639482	CHST15	Q7LFX5	561 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
SPIN3-222	ENST00000639482	LRRC43	Q8N309	656 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SPIN3-222	ENST00000639482	RNF169	Q8NCN4	708 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SPIN3-222	ENST00000639482	CXorf38	Q8TB03	319 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SPIN3-222	ENST00000639482	ITFG2	Q969R8	447 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SPIN3-222	ENST00000639482	QKI	Q96PU8	341 aa	Known RBP eCLIP	10.19	□□□□□ -0.78
SPIN3-222	ENST00000639482	SLC29A1	Q99808	456 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SPIN3-222	ENST00000639482	SENP6	Q9GZR1	1112 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
SPIN3-222	ENST00000639482	PIF1	Q9H611	641 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SPIN3-222	ENST00000639482	EFCAB1	Q9HAE3	211 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SPIN3-222	ENST00000639482		G3V2L1	256 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SPIN3-222	ENST00000639482	CNTF	P26441	200 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SPIN3-222	ENST00000639482	NDUFV1	P49821	464 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SPIN3-222	ENST00000639482	ENTPD1	P49961	510 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SPIN3-222	ENST00000639482	MCCD1	P59942	119 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
SPIN3-222	ENST00000639482	LCLAT1	Q6UWP7	414 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SPIN3-222	ENST00000639482	DENND6A	Q8IWF6	608 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SPIN3-222	ENST00000639482	MARVELD2	Q8N4S9	558 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SPIN3-222	ENST00000639482	SLC2A14	Q8TDB8	520 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SPIN3-222	ENST00000639482	SIKE1	Q9BRV8	207 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SPIN3-222	ENST00000639482	MRPS26	Q9BYN8	205 aa	Known RBP	10.19	□□□□□ -0.78
SPIN3-222	ENST00000639482	MTMR10	Q9NXD2	777 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SPIN3-222	ENST00000639482	EGFL7	Q9UHF1	273 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SPIN3-222	ENST00000639482		E7ENX8	843 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SPIN3-222	ENST00000639482	RECQL4	O94761	1208 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SPIN3-222	ENST00000639482	NMBR	P28336	390 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SPIN3-222	ENST00000639482	PPARG	P37231	505 aa	Predicted RBP	10.18	□□□□□ -0.78
SPIN3-222	ENST00000639482	HARS2	P49590	506 aa	Known RBP	10.18	□□□□□ -0.78
SPIN3-222	ENST00000639482	RBP5	P82980	135 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SPIN3-222	ENST00000639482	ADIG	Q0VDE8	80 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SPIN3-222	ENST00000639482	PPP1R3A	Q16821	1122 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SPIN3-222	ENST00000639482	ZNF423	Q2M1K9	1284 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SPIN3-222	ENST00000639482	PAN2	Q504Q3	1202 aa	Known RBP	10.18	□□□□□ -0.78
SPIN3-222	ENST00000639482	RYBP	Q8N488	228 aa	Predicted RBP	10.18	□□□□□ -0.78
SPIN3-222	ENST00000639482	ACMSD	Q8TDX5	336 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SPIN3-222	ENST00000639482	RNF139	Q8WU17	664 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SPIN3-222	ENST00000639482	KHSRP	Q92945	711 aa	Known RBP eCLIP	10.18	□□□□□ -0.78
SPIN3-222	ENST00000639482	WNT8B	Q93098	351 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SPIN3-222	ENST00000639482	FTHL17	Q9BXU8	183 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SPIN3-222	ENST00000639482	NDUFA13	Q9P0J0	144 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SPIN3-222	ENST00000639482	RIMS3	Q9UJD0	308 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SPIN3-222	ENST00000639482	DMTF1	Q9Y222	760 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SPIN3-222	ENST00000639482	AP4S1	Q9Y587	144 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SPIN3-222	ENST00000639482	COPG1	Q9Y678	874 aa	Known RBP	10.18	□□□□□ -0.78
SPIN3-222	ENST00000639482	RNF103-CHMP3	A0A140T963	221 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SPIN3-222	ENST00000639482	TNPO2	O14787	897 aa	Known RBP	10.18	□□□□□ -0.78
SPIN3-222	ENST00000639482	GAS2	O43903	313 aa	Known RBP	10.18	□□□□□ -0.78
SPIN3-222	ENST00000639482	JCHAIN	P01591	159 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SPIN3-222	ENST00000639482	CASP2	P42575	452 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SPIN3-222	ENST00000639482	MAGEA3	P43357	314 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SPIN3-222	ENST00000639482	MPP1	Q00013	466 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SPIN3-222	ENST00000639482	CRHR2	Q13324	411 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SPIN3-222	ENST00000639482	MFSD10	Q14728	455 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SPIN3-222	ENST00000639482	ANKDD1A	Q495B1	522 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SPIN3-222	ENST00000639482	DUS1L	Q6P1R4	473 aa	Known RBP	10.18	□□□□□ -0.78
SPIN3-222	ENST00000639482	KLHL35	Q6PF15	583 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SPIN3-222	ENST00000639482	TIFAB	Q6ZNK6	161 aa		10.18	□□□□□ -0.78

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