RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000569573.1

E2F4-213, Transcript of E2F transcription factor 4, humanhuman

TSL 3

Gene E2F4, Length 849 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4-213ENST00000569573 I6L893 689 aaPredicted RBP26.1■■□□□ 1.77
E2F4-213ENST00000569573 RNF103O00237 685 aa26.1■■□□□ 1.77
E2F4-213ENST00000569573 SCAMP1O15126 338 aa26.1■■□□□ 1.77
E2F4-213ENST00000569573 USP12O75317 370 aa26.1■■□□□ 1.77
E2F4-213ENST00000569573 GP1BAP07359 652 aa26.1■■□□□ 1.77
E2F4-213ENST00000569573 ADRB3P13945 408 aa26.1■■□□□ 1.77
E2F4-213ENST00000569573 ITGB7P26010 798 aa26.1■■□□□ 1.77
E2F4-213ENST00000569573 SCNN1AP37088 669 aa26.1■■□□□ 1.77
E2F4-213ENST00000569573 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP26.1■■□□□ 1.77
E2F4-213ENST00000569573 GABREP78334 506 aa26.1■■□□□ 1.77
E2F4-213ENST00000569573 SGCGQ13326 291 aa26.1■■□□□ 1.77
E2F4-213ENST00000569573 MAN2A1Q16706 1144 aa26.1■■□□□ 1.77
E2F4-213ENST00000569573 BROXQ5VW32 411 aa26.1■■□□□ 1.77
E2F4-213ENST00000569573 FAM114A1Q8IWE2 563 aa26.1■■□□□ 1.77
E2F4-213ENST00000569573 FAM71AQ8IYT1 594 aa26.1■■□□□ 1.77
E2F4-213ENST00000569573 ZYG11BQ9C0D3 744 aa26.1■■□□□ 1.77
E2F4-213ENST00000569573 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP26.1■■□□□ 1.77
E2F4-213ENST00000569573 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa26.09■■□□□ 1.77
E2F4-213ENST00000569573 GOLGA8SH3BPF8 625 aa26.09■■□□□ 1.77
E2F4-213ENST00000569573 K7ESM1 405 aa26.09■■□□□ 1.77
E2F4-213ENST00000569573 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP26.09■■□□□ 1.77
E2F4-213ENST00000569573 MYF5P13349 255 aa26.09■■□□□ 1.77
E2F4-213ENST00000569573 L1CAMP32004 1257 aa26.09■■□□□ 1.77
E2F4-213ENST00000569573 CARD16Q5EG05 197 aa26.09■■□□□ 1.77
E2F4-213ENST00000569573 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP26.09■■□□□ 1.77
E2F4-213ENST00000569573 DRC7Q8IY82 874 aa26.09■■□□□ 1.77
E2F4-213ENST00000569573 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP26.09■■□□□ 1.77
E2F4-213ENST00000569573 MAPK15Q8TD08 544 aa26.09■■□□□ 1.77
E2F4-213ENST00000569573 HAPLN3Q96S86 360 aa26.09■■□□□ 1.77
E2F4-213ENST00000569573 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa26.09■■□□□ 1.77
E2F4-213ENST00000569573 NEMP1O14524 444 aa26.08■■□□□ 1.77
E2F4-213ENST00000569573 FPGTO14772 594 aa26.08■■□□□ 1.77
E2F4-213ENST00000569573 CSO75390 466 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.77
E2F4-213ENST00000569573 NEBLO76041 1014 aa26.08■■□□□ 1.77
E2F4-213ENST00000569573 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP26.08■■□□□ 1.77
E2F4-213ENST00000569573 CYP11B1P15538 503 aa26.08■■□□□ 1.77
E2F4-213ENST00000569573 RABIFP47224 123 aa26.08■■□□□ 1.77
E2F4-213ENST00000569573 GABRB2P47870 512 aa26.08■■□□□ 1.77
E2F4-213ENST00000569573 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP26.08■■□□□ 1.77
E2F4-213ENST00000569573 TAF3Q5VWG9 929 aa26.08■■□□□ 1.77
E2F4-213ENST00000569573 CDCP2Q5VXM1 449 aa26.08■■□□□ 1.77
E2F4-213ENST00000569573 ZSCAN30Q86W11 494 aa26.08■■□□□ 1.77
E2F4-213ENST00000569573 PARGQ86W56 976 aa26.08■■□□□ 1.77
E2F4-213ENST00000569573 XYLT1Q86Y38 959 aa26.08■■□□□ 1.77
E2F4-213ENST00000569573 IRF2BP1Q8IU81 584 aa26.08■■□□□ 1.77
E2F4-213ENST00000569573 FAM181AQ8N9Y4 354 aa26.08■■□□□ 1.77
E2F4-213ENST00000569573 BMFQ96LC9 184 aa26.08■■□□□ 1.77
E2F4-213ENST00000569573 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.77
E2F4-213ENST00000569573 FADS3Q9Y5Q0 445 aa26.08■■□□□ 1.77
E2F4-213ENST00000569573 POM121BA6NF01 834 aa26.07■■□□□ 1.76
E2F4-213ENST00000569573 PES1O00541 588 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
E2F4-213ENST00000569573 GIMD1P0DJR0 217 aa26.07■■□□□ 1.76
E2F4-213ENST00000569573 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP26.07■■□□□ 1.76
E2F4-213ENST00000569573 FLT3P36888 993 aa26.07■■□□□ 1.76
E2F4-213ENST00000569573 GNA12Q03113 381 aa26.07■■□□□ 1.76
E2F4-213ENST00000569573 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP26.07■■□□□ 1.76
E2F4-213ENST00000569573 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
E2F4-213ENST00000569573 FAM131BQ86XD5 332 aa26.07■■□□□ 1.76
E2F4-213ENST00000569573 MLKLQ8NB16 471 aa26.07■■□□□ 1.76
E2F4-213ENST00000569573 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP26.07■■□□□ 1.76
E2F4-213ENST00000569573 IFI44Q8TCB0 444 aa26.07■■□□□ 1.76
E2F4-213ENST00000569573 CFAP57Q96MR6 1250 aa26.07■■□□□ 1.76
E2F4-213ENST00000569573 TM6SF2Q9BZW4 377 aa26.07■■□□□ 1.76
E2F4-213ENST00000569573 NDST4Q9H3R1 872 aa26.07■■□□□ 1.76
E2F4-213ENST00000569573 CAAP1Q9H8G2 361 aa26.07■■□□□ 1.76
E2F4-213ENST00000569573 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa26.07■■□□□ 1.76
E2F4-213ENST00000569573 HECAQ9UBI9 543 aaPredicted RBP26.07■■□□□ 1.76
E2F4-213ENST00000569573 TRPM6Q9BX84 2022 aa26.07■■□□□ 1.76
E2F4-213ENST00000569573 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa26.06■■□□□ 1.76
E2F4-213ENST00000569573 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa26.06■■□□□ 1.76
E2F4-213ENST00000569573 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP26.06■■□□□ 1.76
E2F4-213ENST00000569573 CSF2P04141 144 aa26.06■■□□□ 1.76
E2F4-213ENST00000569573 NME1P15531 152 aaKnown RBP26.06■■□□□ 1.76
E2F4-213ENST00000569573 ETFBP38117 255 aa26.06■■□□□ 1.76
E2F4-213ENST00000569573 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP26.06■■□□□ 1.76
E2F4-213ENST00000569573 FZD2Q14332 565 aa26.06■■□□□ 1.76
E2F4-213ENST00000569573 C2CD6Q53TS8 623 aa26.06■■□□□ 1.76
E2F4-213ENST00000569573 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa26.06■■□□□ 1.76
E2F4-213ENST00000569573 CPED1A4D0V7 1026 aa26.05■■□□□ 1.76
E2F4-213ENST00000569573 AP1G1O43747 822 aa26.05■■□□□ 1.76
E2F4-213ENST00000569573 ZMPSTE24O75844 475 aa26.05■■□□□ 1.76
E2F4-213ENST00000569573 C1QL1O75973 258 aa26.05■■□□□ 1.76
E2F4-213ENST00000569573 LSSP48449 732 aa26.05■■□□□ 1.76
E2F4-213ENST00000569573 UCNP55089 124 aa26.05■■□□□ 1.76
E2F4-213ENST00000569573 TMPRSS3P57727 454 aa26.05■■□□□ 1.76
E2F4-213ENST00000569573 ARF5P84085 180 aa26.05■■□□□ 1.76
E2F4-213ENST00000569573 FGL2Q14314 439 aa26.05■■□□□ 1.76
E2F4-213ENST00000569573 VWA3BQ502W6 1294 aa26.05■■□□□ 1.76
E2F4-213ENST00000569573 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP26.05■■□□□ 1.76
E2F4-213ENST00000569573 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP26.05■■□□□ 1.76
E2F4-213ENST00000569573 IL12RB2Q99665 862 aa26.05■■□□□ 1.76
E2F4-213ENST00000569573 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP26.04■■□□□ 1.76
E2F4-213ENST00000569573 RAD51BO15315 384 aa26.04■■□□□ 1.76
E2F4-213ENST00000569573 AQP9O43315 295 aa26.04■■□□□ 1.76
E2F4-213ENST00000569573 TSPAN6O43657 245 aa26.04■■□□□ 1.76
E2F4-213ENST00000569573 LSM8O95777 96 aaKnown RBP26.04■■□□□ 1.76
E2F4-213ENST00000569573 JUNDP17535 347 aa26.04■■□□□ 1.76
E2F4-213ENST00000569573 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP26.04■■□□□ 1.76
E2F4-213ENST00000569573 ERVPABLB-1P60509 514 aa26.04■■□□□ 1.76
E2F4-213ENST00000569573 ATP11AP98196 1134 aa26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.9 ms