RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429595.1

PTPRK-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRK, Length 558 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-211ENST00000429595 ARHGAP40Q5TG30 622 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRK-211ENST00000429595 TSHZ3Q63HK5 1081 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRK-211ENST00000429595 TBC1D10CQ8IV04 446 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRK-211ENST00000429595 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PTPRK-211ENST00000429595 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PTPRK-211ENST00000429595 LINC01465Q8N7H1 131 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRK-211ENST00000429595 FAM184AQ8NB25 1140 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRK-211ENST00000429595 OR14C36Q8NHC7 312 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF461Q8TAF7 563 aa6.69□□□□□ -1.34
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PTPRK-211ENST00000429595 INSL5Q9Y5Q6 135 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRK-211ENST00000429595 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRK-211ENST00000429595 EML5Q05BV3 1969 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRK-211ENST00000429595 CASTOR2A6NHX0 329 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRK-211ENST00000429595 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRK-211ENST00000429595 CBFA2T3O75081 653 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRK-211ENST00000429595 FKBP9O95302 570 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRK-211ENST00000429595 FOSP01100 380 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
PTPRK-211ENST00000429595 AFPP02771 609 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
PTPRK-211ENST00000429595 AKAP5P24588 427 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRK-211ENST00000429595 AXLP30530 894 aa6.66□□□□□ -1.34
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