RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000323977.7

MRE11-202, Transcript of MRE11 homolog, double strand break repair nuclease, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene MRE11, Length 2,588 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRE11-202ENST00000323977 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
MRE11-202ENST00000323977 DNAJB9Q9UBS3 223 aa4.56□□□□□ -1.68
MRE11-202ENST00000323977 ZMYM5Q9UJ78 669 aa4.56□□□□□ -1.68
MRE11-202ENST00000323977 PCDHA7Q9UN72 937 aa4.56□□□□□ -1.68
MRE11-202ENST00000323977 LHX6Q9UPM6 363 aa4.56□□□□□ -1.68
MRE11-202ENST00000323977 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
MRE11-202ENST00000323977 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa4.56□□□□□ -1.68
MRE11-202ENST00000323977 H7C0C1 242 aa4.55□□□□□ -1.68
MRE11-202ENST00000323977 PGRMC2O15173 223 aa4.55□□□□□ -1.68
MRE11-202ENST00000323977 DAPK3O43293 454 aa4.55□□□□□ -1.68
MRE11-202ENST00000323977 HCRTR2O43614 444 aa4.55□□□□□ -1.68
MRE11-202ENST00000323977 GMFGO60234 142 aa4.55□□□□□ -1.68
MRE11-202ENST00000323977 PDE5AO76074 875 aa4.55□□□□□ -1.68
MRE11-202ENST00000323977 ITGA2BP08514 1039 aa4.55□□□□□ -1.68
MRE11-202ENST00000323977 ERVK-10P10266 1014 aa4.55□□□□□ -1.68
MRE11-202ENST00000323977 PDE6AP16499 860 aa4.55□□□□□ -1.68
MRE11-202ENST00000323977 GNA11P29992 359 aa4.55□□□□□ -1.68
MRE11-202ENST00000323977 RGS2P41220 211 aa4.55□□□□□ -1.68
MRE11-202ENST00000323977 GSSP48637 474 aa4.55□□□□□ -1.68
MRE11-202ENST00000323977 PRIM2P49643 509 aa4.55□□□□□ -1.68
MRE11-202ENST00000323977 CASP4P49662 377 aa4.55□□□□□ -1.68
MRE11-202ENST00000323977 PPP5CP53041 499 aa4.55□□□□□ -1.68
MRE11-202ENST00000323977 ARFIP2P53365 341 aa4.55□□□□□ -1.68
MRE11-202ENST00000323977 TAS2R40P59535 323 aa4.55□□□□□ -1.68
MRE11-202ENST00000323977 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP4.55□□□□□ -1.68
MRE11-202ENST00000323977 CREB5Q02930 508 aa4.55□□□□□ -1.68
MRE11-202ENST00000323977 RELAQ04206 551 aa4.55□□□□□ -1.68
MRE11-202ENST00000323977 ELP6Q0PNE2 266 aa4.55□□□□□ -1.68
MRE11-202ENST00000323977 LSAMPQ13449 338 aa4.55□□□□□ -1.68
MRE11-202ENST00000323977 DYRK1AQ13627 763 aa4.55□□□□□ -1.68
MRE11-202ENST00000323977 SURF1Q15526 300 aa4.55□□□□□ -1.68
MRE11-202ENST00000323977 GRIK5Q16478 980 aa4.55□□□□□ -1.68
MRE11-202ENST00000323977 RTN1Q16799 776 aa4.55□□□□□ -1.68
MRE11-202ENST00000323977 PFKFB4Q16877 469 aa4.55□□□□□ -1.68
MRE11-202ENST00000323977 DNAL1Q4LDG9 190 aa4.55□□□□□ -1.68
MRE11-202ENST00000323977 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa4.55□□□□□ -1.68
MRE11-202ENST00000323977 C10orf120Q5SQS8 335 aa4.55□□□□□ -1.68
MRE11-202ENST00000323977 ADGRF1Q5T601 910 aa4.55□□□□□ -1.68
MRE11-202ENST00000323977 C1orf146Q5VVC0 180 aa4.55□□□□□ -1.68
MRE11-202ENST00000323977 KRT40Q6A162 431 aa4.55□□□□□ -1.68
MRE11-202ENST00000323977 DENND5AQ6IQ26 1287 aa4.55□□□□□ -1.68
MRE11-202ENST00000323977 LAYNQ6UX15 382 aa4.55□□□□□ -1.68
MRE11-202ENST00000323977 SLC36A4Q6YBV0 504 aa4.55□□□□□ -1.68
MRE11-202ENST00000323977 TAS2R42Q7RTR8 314 aa4.55□□□□□ -1.68
MRE11-202ENST00000323977 KRT25Q7Z3Z0 450 aa4.55□□□□□ -1.68
MRE11-202ENST00000323977 GPR141Q7Z602 305 aa4.55□□□□□ -1.68
MRE11-202ENST00000323977 THAP5Q7Z6K1 395 aa4.55□□□□□ -1.68
MRE11-202ENST00000323977 LRRTM4Q86VH4 590 aa4.55□□□□□ -1.68
MRE11-202ENST00000323977 TRIM59Q8IWR1 403 aa4.55□□□□□ -1.68
MRE11-202ENST00000323977 CCDC105Q8IYK2 499 aa4.55□□□□□ -1.68
MRE11-202ENST00000323977 ADSSL1Q8N142 457 aa4.55□□□□□ -1.68
MRE11-202ENST00000323977 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
MRE11-202ENST00000323977 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
MRE11-202ENST00000323977 PSD4Q8NDX1 1056 aa4.55□□□□□ -1.68
MRE11-202ENST00000323977 BBS1Q8NFJ9 593 aa4.55□□□□□ -1.68
MRE11-202ENST00000323977 SLC35G2Q8TBE7 412 aa4.55□□□□□ -1.68
MRE11-202ENST00000323977 FAM71BQ8TC56 605 aa4.55□□□□□ -1.68
MRE11-202ENST00000323977 CAPSLQ8WWF8 208 aa4.55□□□□□ -1.68
MRE11-202ENST00000323977 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
MRE11-202ENST00000323977 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP4.55□□□□□ -1.68
MRE11-202ENST00000323977 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
MRE11-202ENST00000323977 GBP5Q96PP8 586 aa4.55□□□□□ -1.68
MRE11-202ENST00000323977 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
MRE11-202ENST00000323977 HAPLN3Q96S86 360 aa4.55□□□□□ -1.68
MRE11-202ENST00000323977 DMRTA2Q96SC8 542 aa4.55□□□□□ -1.68
MRE11-202ENST00000323977 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
MRE11-202ENST00000323977 CENPKQ9BS16 269 aa4.55□□□□□ -1.68
MRE11-202ENST00000323977 EFHD1Q9BUP0 239 aa4.55□□□□□ -1.68
MRE11-202ENST00000323977 NUP58Q9BVL2 599 aa4.55□□□□□ -1.68
MRE11-202ENST00000323977 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa4.55□□□□□ -1.68
MRE11-202ENST00000323977 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
MRE11-202ENST00000323977 DPEP3Q9H4B8 488 aa4.55□□□□□ -1.68
MRE11-202ENST00000323977 C17orf75Q9HAS0 396 aa4.55□□□□□ -1.68
MRE11-202ENST00000323977 PARVAQ9NVD7 372 aa4.55□□□□□ -1.68
MRE11-202ENST00000323977 ZSCAN32Q9NX65 697 aa4.55□□□□□ -1.68
MRE11-202ENST00000323977 STMN3Q9NZ72 180 aa4.55□□□□□ -1.68
MRE11-202ENST00000323977 WHRNQ9P202 907 aa4.55□□□□□ -1.68
MRE11-202ENST00000323977 KLHL3Q9UH77 587 aa4.55□□□□□ -1.68
MRE11-202ENST00000323977 TSPYL4Q9UJ04 414 aa4.55□□□□□ -1.68
MRE11-202ENST00000323977 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
MRE11-202ENST00000323977 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa4.55□□□□□ -1.68
MRE11-202ENST00000323977 OTOFQ9HC10 1997 aa4.55□□□□□ -1.68
MRE11-202ENST00000323977 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa4.55□□□□□ -1.68
MRE11-202ENST00000323977 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa4.55□□□□□ -1.68
MRE11-202ENST00000323977 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa4.55□□□□□ -1.68
MRE11-202ENST00000323977 OPLAHO14841 1288 aa4.55□□□□□ -1.68
MRE11-202ENST00000323977 TO15178 435 aa4.55□□□□□ -1.68
MRE11-202ENST00000323977 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
MRE11-202ENST00000323977 UFL1O94874 794 aa4.55□□□□□ -1.68
MRE11-202ENST00000323977 PCDH8O95206 1070 aa4.55□□□□□ -1.68
MRE11-202ENST00000323977 MT-CO1P00395 513 aa4.55□□□□□ -1.68
MRE11-202ENST00000323977 CSTAP01040 98 aa4.55□□□□□ -1.68
MRE11-202ENST00000323977 IL1AP01583 271 aa4.55□□□□□ -1.68
MRE11-202ENST00000323977 ZCCHC18P0CG32 403 aa4.55□□□□□ -1.68
MRE11-202ENST00000323977 MLNP12872 115 aa4.55□□□□□ -1.68
MRE11-202ENST00000323977 CKMT2P17540 419 aa4.55□□□□□ -1.68
MRE11-202ENST00000323977 AHCYP23526 432 aa4.55□□□□□ -1.68
MRE11-202ENST00000323977 PCSK1P29120 753 aa4.55□□□□□ -1.68
MRE11-202ENST00000323977 TYK2P29597 1187 aa4.55□□□□□ -1.68
MRE11-202ENST00000323977 CDH6P55285 790 aa4.55□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.5 ms