RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299238.6

HPS6-201, Transcript of HPS6, biogenesis of lysosomal organelles complex 2 subunit 3, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene HPS6, Length 2,649 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS6-201ENST00000299238 K7EPI3 171 aa20.47■□□□□ 0.87
HPS6-201ENST00000299238 OCM2P0CE71 109 aa20.47■□□□□ 0.87
HPS6-201ENST00000299238 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
HPS6-201ENST00000299238 CPA3P15088 417 aa20.47■□□□□ 0.87
HPS6-201ENST00000299238 CYP2B6P20813 491 aa20.47■□□□□ 0.87
HPS6-201ENST00000299238 ALDH1A3P47895 512 aa20.47■□□□□ 0.87
HPS6-201ENST00000299238 SLC5A3P53794 718 aa20.47■□□□□ 0.87
HPS6-201ENST00000299238 C6orf52Q5T4I8 152 aa20.47■□□□□ 0.87
HPS6-201ENST00000299238 STXBP5Q5T5C0 1151 aa20.47■□□□□ 0.87
HPS6-201ENST00000299238 METTL21CQ5VZV1 264 aa20.47■□□□□ 0.87
HPS6-201ENST00000299238 WSCD1Q658N2 575 aa20.47■□□□□ 0.87
HPS6-201ENST00000299238 LZTR1Q8N653 840 aa20.47■□□□□ 0.87
HPS6-201ENST00000299238 SCAIQ8N9R8 606 aa20.47■□□□□ 0.87
HPS6-201ENST00000299238 RNF139Q8WU17 664 aa20.47■□□□□ 0.87
HPS6-201ENST00000299238 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
HPS6-201ENST00000299238 CYP4F11Q9HBI6 524 aa20.47■□□□□ 0.87
HPS6-201ENST00000299238 CACNG4Q9UBN1 327 aa20.47■□□□□ 0.87
HPS6-201ENST00000299238 TRPM7Q96QT4 1865 aa20.47■□□□□ 0.87
HPS6-201ENST00000299238 TPP1O14773 563 aa20.47■□□□□ 0.87
HPS6-201ENST00000299238 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
HPS6-201ENST00000299238 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
HPS6-201ENST00000299238 GLUD2P49448 558 aa20.47■□□□□ 0.87
HPS6-201ENST00000299238 STX3Q13277 289 aa20.47■□□□□ 0.87
HPS6-201ENST00000299238 CNGA3Q16281 694 aa20.47■□□□□ 0.87
HPS6-201ENST00000299238 ZNF423Q2M1K9 1284 aa20.47■□□□□ 0.87
HPS6-201ENST00000299238 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
HPS6-201ENST00000299238 PPM1JQ5JR12 505 aa20.47■□□□□ 0.87
HPS6-201ENST00000299238 BORAQ6PGQ7 559 aa20.47■□□□□ 0.87
HPS6-201ENST00000299238 DCDC5Q6ZRR9 648 aa20.47■□□□□ 0.87
HPS6-201ENST00000299238 PAQR9Q6ZVX9 377 aa20.47■□□□□ 0.87
HPS6-201ENST00000299238 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa20.47■□□□□ 0.87
HPS6-201ENST00000299238 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa20.47■□□□□ 0.87
HPS6-201ENST00000299238 ZNF696Q9H7X3 374 aa20.47■□□□□ 0.87
HPS6-201ENST00000299238 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
HPS6-201ENST00000299238 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
HPS6-201ENST00000299238 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
HPS6-201ENST00000299238 BPTFQ12830 3046 aa20.47■□□□□ 0.87
HPS6-201ENST00000299238 HOXC8P31273 242 aa20.46■□□□□ 0.87
HPS6-201ENST00000299238 NR1H2P55055 460 aa20.46■□□□□ 0.87
HPS6-201ENST00000299238 WASHC5Q12768 1159 aa20.46■□□□□ 0.87
HPS6-201ENST00000299238 ATP1A4Q13733 1029 aa20.46■□□□□ 0.87
HPS6-201ENST00000299238 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
HPS6-201ENST00000299238 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
HPS6-201ENST00000299238 ATG14Q6ZNE5 492 aa20.46■□□□□ 0.87
HPS6-201ENST00000299238 CLEC20AQ6ZU45 233 aa20.46■□□□□ 0.87
HPS6-201ENST00000299238 LPCAT2Q7L5N7 544 aa20.46■□□□□ 0.87
HPS6-201ENST00000299238 CCNYQ8ND76 341 aa20.46■□□□□ 0.87
HPS6-201ENST00000299238 ACMSDQ8TDX5 336 aa20.46■□□□□ 0.87
HPS6-201ENST00000299238 NPY6RQ99463 290 aa20.46■□□□□ 0.87
HPS6-201ENST00000299238 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa20.46■□□□□ 0.87
HPS6-201ENST00000299238 CCDC106Q9BWC9 280 aa20.46■□□□□ 0.87
HPS6-201ENST00000299238 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa20.46■□□□□ 0.87
HPS6-201ENST00000299238 THAP1Q9NVV9 213 aa20.46■□□□□ 0.87
HPS6-201ENST00000299238 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
HPS6-201ENST00000299238 PGAM1P18669 254 aa20.46■□□□□ 0.87
HPS6-201ENST00000299238 PSMB4P28070 264 aa20.46■□□□□ 0.87
HPS6-201ENST00000299238 ACADVLP49748 655 aa20.46■□□□□ 0.87
HPS6-201ENST00000299238 NDUFV1P49821 464 aa20.46■□□□□ 0.87
HPS6-201ENST00000299238 MBLAC2Q68D91 279 aa20.46■□□□□ 0.87
HPS6-201ENST00000299238 ZNF778Q96MU6 729 aa20.46■□□□□ 0.87
HPS6-201ENST00000299238 MED10Q9BTT4 135 aa20.46■□□□□ 0.87
HPS6-201ENST00000299238 LRRC4Q9HBW1 653 aa20.46■□□□□ 0.87
HPS6-201ENST00000299238 SOX13Q9UN79 622 aa20.46■□□□□ 0.87
HPS6-201ENST00000299238 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP20.46■□□□□ 0.87
HPS6-201ENST00000299238 BRCA2P51587 3418 aa20.45■□□□□ 0.86
HPS6-201ENST00000299238 MEIS3P2A8K0S8 358 aa20.45■□□□□ 0.86
HPS6-201ENST00000299238 NELFEP18615 380 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
HPS6-201ENST00000299238 PURAQ00577 322 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
HPS6-201ENST00000299238 CYTH1Q15438 398 aa20.45■□□□□ 0.86
HPS6-201ENST00000299238 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
HPS6-201ENST00000299238 KIAA0319Q5VV43 1072 aa20.45■□□□□ 0.86
HPS6-201ENST00000299238 AHI1Q8N157 1196 aa20.45■□□□□ 0.86
HPS6-201ENST00000299238 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa20.45■□□□□ 0.86
HPS6-201ENST00000299238 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
HPS6-201ENST00000299238 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
HPS6-201ENST00000299238 PRDM12Q9H4Q4 367 aa20.45■□□□□ 0.86
HPS6-201ENST00000299238 ZNF358Q9NW07 568 aa20.45■□□□□ 0.86
HPS6-201ENST00000299238 SYBUQ9NX95 663 aa20.45■□□□□ 0.86
HPS6-201ENST00000299238 PLK2Q9NYY3 685 aa20.45■□□□□ 0.86
HPS6-201ENST00000299238 USP12O75317 370 aa20.45■□□□□ 0.86
HPS6-201ENST00000299238 NOS2P35228 1153 aa20.45■□□□□ 0.86
HPS6-201ENST00000299238 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
HPS6-201ENST00000299238 SPIDRQ14159 915 aa20.45■□□□□ 0.86
HPS6-201ENST00000299238 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
HPS6-201ENST00000299238 NEPROQ6NW34 567 aa20.45■□□□□ 0.86
HPS6-201ENST00000299238 HPS6Q86YV9 775 aa20.45■□□□□ 0.86
HPS6-201ENST00000299238 ZNF567Q8N184 647 aa20.45■□□□□ 0.86
HPS6-201ENST00000299238 KCTD13Q8WZ19 329 aa20.45■□□□□ 0.86
HPS6-201ENST00000299238 TIMM22Q9Y584 194 aa20.45■□□□□ 0.86
HPS6-201ENST00000299238 NOX1Q9Y5S8 564 aa20.45■□□□□ 0.86
HPS6-201ENST00000299238 KCNK1O00180 336 aa20.44■□□□□ 0.86
HPS6-201ENST00000299238 GABRDO14764 452 aa20.44■□□□□ 0.86
HPS6-201ENST00000299238 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
HPS6-201ENST00000299238 PRKCGP05129 697 aa20.44■□□□□ 0.86
HPS6-201ENST00000299238 ERVK-10P10266 1014 aa20.44■□□□□ 0.86
HPS6-201ENST00000299238 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
HPS6-201ENST00000299238 PEX6Q13608 980 aa20.44■□□□□ 0.86
HPS6-201ENST00000299238 DPYSQ14117 519 aa20.44■□□□□ 0.86
HPS6-201ENST00000299238 SYPL2Q5VXT5 272 aa20.44■□□□□ 0.86
HPS6-201ENST00000299238 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.8 ms