RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296642.4

PGGT1B-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 552 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-201ENST00000296642 CETN1Q12798 172 aa8.04□□□□□ -1.12
PGGT1B-201ENST00000296642 ADAM9Q13443 819 aa8.04□□□□□ -1.12
PGGT1B-201ENST00000296642 CUL2Q13617 745 aa8.04□□□□□ -1.12
PGGT1B-201ENST00000296642 CNGA2Q16280 664 aa8.04□□□□□ -1.12
PGGT1B-201ENST00000296642 SKIDA1Q1XH10 827 aa8.04□□□□□ -1.12
PGGT1B-201ENST00000296642 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
PGGT1B-201ENST00000296642 LCLAT1Q6UWP7 414 aa8.04□□□□□ -1.12
PGGT1B-201ENST00000296642 CLEC18BQ6UXF7 455 aa8.04□□□□□ -1.12
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC35F3Q8IY50 421 aa8.04□□□□□ -1.12
PGGT1B-201ENST00000296642 PHACTR4Q8IZ21 702 aa8.04□□□□□ -1.12
PGGT1B-201ENST00000296642 CLEC18CQ8NCF0 446 aa8.04□□□□□ -1.12
PGGT1B-201ENST00000296642 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
PGGT1B-201ENST00000296642 ASB12Q8WXK4 309 aa8.04□□□□□ -1.12
PGGT1B-201ENST00000296642 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC39A13Q96H72 371 aa8.04□□□□□ -1.12
PGGT1B-201ENST00000296642 CCDC34Q96HJ3 373 aa8.04□□□□□ -1.12
PGGT1B-201ENST00000296642 BMFQ96LC9 184 aa8.04□□□□□ -1.12
PGGT1B-201ENST00000296642 NOX5Q96PH1 765 aa8.04□□□□□ -1.12
PGGT1B-201ENST00000296642 MED15Q96RN5 788 aa8.04□□□□□ -1.12
PGGT1B-201ENST00000296642 USP28Q96RU2 1077 aa8.04□□□□□ -1.12
PGGT1B-201ENST00000296642 MIS12Q9H081 205 aa8.04□□□□□ -1.12
PGGT1B-201ENST00000296642 LRRN3Q9H3W5 708 aa8.04□□□□□ -1.12
PGGT1B-201ENST00000296642 ST7Q9NRC1 585 aa8.04□□□□□ -1.12
PGGT1B-201ENST00000296642 GPR27Q9NS67 375 aa8.04□□□□□ -1.12
PGGT1B-201ENST00000296642 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
PGGT1B-201ENST00000296642 VPS4AQ9UN37 437 aa8.04□□□□□ -1.12
PGGT1B-201ENST00000296642 HS3ST2Q9Y278 367 aa8.04□□□□□ -1.12
PGGT1B-201ENST00000296642 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa8.03□□□□□ -1.12
PGGT1B-201ENST00000296642 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa8.03□□□□□ -1.12
PGGT1B-201ENST00000296642 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
PGGT1B-201ENST00000296642 TULP2O00295 520 aa8.03□□□□□ -1.12
PGGT1B-201ENST00000296642 O00370 1275 aa8.03□□□□□ -1.12
PGGT1B-201ENST00000296642 PRAMEF10O60809 474 aa8.03□□□□□ -1.12
PGGT1B-201ENST00000296642 RHOBTB3O94955 611 aa8.03□□□□□ -1.12
PGGT1B-201ENST00000296642 YEATS4O95619 227 aa8.03□□□□□ -1.12
PGGT1B-201ENST00000296642 ADRB3P13945 408 aa8.03□□□□□ -1.12
PGGT1B-201ENST00000296642 PNLIPP16233 465 aa8.03□□□□□ -1.12
PGGT1B-201ENST00000296642 ITGB7P26010 798 aa8.03□□□□□ -1.12
PGGT1B-201ENST00000296642 MAN1A1P33908 653 aa8.03□□□□□ -1.12
PGGT1B-201ENST00000296642 RGS7P49802 495 aa8.03□□□□□ -1.12
PGGT1B-201ENST00000296642 METAP1P53582 386 aa8.03□□□□□ -1.12
PGGT1B-201ENST00000296642 COPB1P53618 953 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
PGGT1B-201ENST00000296642 SNX16P57768 344 aa8.03□□□□□ -1.12
PGGT1B-201ENST00000296642 CDK17Q00537 523 aa8.03□□□□□ -1.12
PGGT1B-201ENST00000296642 PPP3CAQ08209 521 aa8.03□□□□□ -1.12
PGGT1B-201ENST00000296642 KLRB1Q12918 225 aa8.03□□□□□ -1.12
PGGT1B-201ENST00000296642 STK4Q13043 487 aa8.03□□□□□ -1.12
PGGT1B-201ENST00000296642 CUL4BQ13620 913 aa8.03□□□□□ -1.12
PGGT1B-201ENST00000296642 ARHGEF7Q14155 803 aa8.03□□□□□ -1.12
PGGT1B-201ENST00000296642 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
PGGT1B-201ENST00000296642 TMEM259Q4ZIN3 620 aa8.03□□□□□ -1.12
PGGT1B-201ENST00000296642 FHL5Q5TD97 284 aa8.03□□□□□ -1.12
PGGT1B-201ENST00000296642 TCERG1LQ5VWI1 586 aa8.03□□□□□ -1.12
PGGT1B-201ENST00000296642 SEL1L3Q68CR1 1132 aa8.03□□□□□ -1.12
PGGT1B-201ENST00000296642 RETSATQ6NUM9 610 aa8.03□□□□□ -1.12
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PGGT1B-201ENST00000296642 SLC35F5Q8WV83 523 aa8.03□□□□□ -1.12
PGGT1B-201ENST00000296642 USP7Q93009 1102 aa8.03□□□□□ -1.12
PGGT1B-201ENST00000296642 CCDC74AQ96AQ1 378 aa8.03□□□□□ -1.12
PGGT1B-201ENST00000296642 EPAS1Q99814 870 aa8.03□□□□□ -1.12
PGGT1B-201ENST00000296642 FEM1AQ9BSK4 669 aa8.03□□□□□ -1.12
PGGT1B-201ENST00000296642 FUCA2Q9BTY2 467 aa8.03□□□□□ -1.12
PGGT1B-201ENST00000296642 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
PGGT1B-201ENST00000296642 KCTD10Q9H3F6 313 aa8.03□□□□□ -1.12
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM204AQ9H8W3 233 aa8.03□□□□□ -1.12
PGGT1B-201ENST00000296642 POPDC2Q9HBU9 364 aa8.03□□□□□ -1.12
PGGT1B-201ENST00000296642 KCNK4Q9NYG8 393 aa8.03□□□□□ -1.12
PGGT1B-201ENST00000296642 USP25Q9UHP3 1055 aa8.03□□□□□ -1.12
PGGT1B-201ENST00000296642 GGT7Q9UJ14 662 aa8.03□□□□□ -1.12
PGGT1B-201ENST00000296642 POM121BA6NF01 834 aa8.02□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 CETN3O15182 167 aa8.02□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 YY2O15391 372 aa8.02□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 CNTN5O94779 1100 aa8.02□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 RASGRP1O95267 797 aa8.02□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 RHOCP08134 193 aa8.02□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 SRCP12931 536 aa8.02□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 GLB1P16278 677 aa8.02□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 TSHRP16473 764 aa8.02□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 L1CAMP32004 1257 aa8.02□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 PDX1P52945 283 aa8.02□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 CDH4P55283 916 aa8.02□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 PFN3P60673 137 aa8.02□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC20A2Q08357 652 aa8.02□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 BIRC2Q13490 618 aa8.02□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 C1orf61Q13536 156 aa8.02□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 CLCA4Q14CN2 919 aa8.02□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 IGFBP7Q16270 282 aa8.02□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 C1orf220Q5T0J3 134 aa8.02□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 PHF19Q5T6S3 580 aa8.02□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 PMF1Q6P1K2 205 aa8.02□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 LRRC31Q6UY01 552 aa8.02□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 MACC1Q6ZN28 852 aa8.02□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 TAC4Q86UU9 113 aa8.02□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 DTX1Q86Y01 620 aa8.02□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 CCNJLQ8IV13 435 aa8.02□□□□□ -1.13
PGGT1B-201ENST00000296642 TEX19Q8NA77 164 aa8.02□□□□□ -1.13
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