RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000218686.1

Trappc6b-207, Transcript of Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

TSL 3 BASIC

Gene Trappc6b, Length 785 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ankrd2Q9WV06 328 aa22.04■■□□□ 1.12
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Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Iqcj-Schip1A0A088MLT8 559 aa22.03■■□□□ 1.12
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Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Mllt3A2AM29 569 aa22.03■■□□□ 1.12
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ccdc8D3YZV8 685 aa22.03■■□□□ 1.12
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Fam46aD3Z5S8 447 aa22.03■■□□□ 1.12
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 F6Y6L6 278 aa22.03■■□□□ 1.12
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Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Nlrp4aQ8BU40 982 aa22.03■■□□□ 1.12
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Mpp7Q8BVD5 576 aa22.03■■□□□ 1.12
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Lrrc25Q8K1T1 297 aa22.03■■□□□ 1.12
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ttc39cQ8VE09 580 aa22.03■■□□□ 1.12
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Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Klra1P20937 262 aa22.02■■□□□ 1.12
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Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ttyh2Q3TH73 532 aa22.02■■□□□ 1.12
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Plcl1Q3USB7 1096 aa22.02■■□□□ 1.12
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Fbxo39Q5NBU5 443 aa22.02■■□□□ 1.12
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Vav2Q60992 868 aa22.02■■□□□ 1.12
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Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Rimbp2Q80U40 1072 aa22.02■■□□□ 1.12
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Cdcp2Q8BQH6 427 aa22.02■■□□□ 1.12
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ccz1Q8C1Y8 480 aa22.02■■□□□ 1.12
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Leng8Q8CBY3 785 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Nup58Q8R332 587 aa22.02■■□□□ 1.12
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Clptm1Q8VBZ3 664 aa22.02■■□□□ 1.12
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Zfp617Q91WM0 559 aa22.02■■□□□ 1.12
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Gtf2ird2Q99NI3 936 aa22.02■■□□□ 1.12
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 D930007J09RikQ9D2K6 131 aa22.02■■□□□ 1.12
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Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ppm1dQ9QZ67 598 aa22.02■■□□□ 1.12
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Map3k14Q9WUL6 942 aa22.02■■□□□ 1.12
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Lipo2D3YY49 398 aa22.01■■□□□ 1.11
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Gm14496K7N5U4 849 aa22.01■■□□□ 1.11
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ebf2O08792 575 aa22.01■■□□□ 1.11
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Per2O54943 1257 aa22.01■■□□□ 1.11
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 IlkO55222 452 aa22.01■■□□□ 1.11
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Qsox2Q3TMX7 692 aa22.01■■□□□ 1.11
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Tcf4Q60722 670 aa22.01■■□□□ 1.11
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Pde1aQ61481 565 aa22.01■■□□□ 1.11
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 SpopQ6ZWS8 374 aa22.01■■□□□ 1.11
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Wfikkn2Q7TQN3 571 aa22.01■■□□□ 1.11
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Arhgap12Q8C0D4 838 aa22.01■■□□□ 1.11
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 PvrQ8K094 408 aa22.01■■□□□ 1.11
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Brd8Q8R3B7 951 aa22.01■■□□□ 1.11
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Olfr1411Q8VFC4 323 aa22.01■■□□□ 1.11
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Caskin2Q8VHK1 1201 aa22.01■■□□□ 1.11
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ubqln5Q9D4I8 510 aa22.01■■□□□ 1.11
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Cpne8Q9DC53 577 aa22.01■■□□□ 1.11
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Slc23a2Q9EPR4 648 aa22.01■■□□□ 1.11
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Gm20671F6TVX7 576 aa22■■□□□ 1.11
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Trappc6b-207ENSMUST00000218686 GhrhrP32082 423 aa22■■□□□ 1.11
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Slc16a1P53986 493 aa22■■□□□ 1.11
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Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Kcnd1Q03719 651 aa22■■□□□ 1.11
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Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Efr3bQ6ZQ18 817 aa22■■□□□ 1.11
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Rhot1Q8BG51 631 aa22■■□□□ 1.11
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Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Trub1Q8C0D0 338 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Sh3rf3Q8C120 878 aa22■■□□□ 1.11
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Pomgnt1Q91X88 660 aa22■■□□□ 1.11
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Pcdhb6Q91XZ4 772 aa22■■□□□ 1.11
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Vangl2Q91ZD4 521 aa22■■□□□ 1.11
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ak5Q920P5 562 aa22■■□□□ 1.11
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 TardbpQ921F2 414 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 PmpcbQ9CXT8 489 aa22■■□□□ 1.11
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ovca2Q9D7E3 225 aa22■■□□□ 1.11
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ahctf1Q8CJF7 2243 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Itpr3P70227 2670 aa21.99■■□□□ 1.11
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Rhox3fA2ANE1 215 aa21.99■■□□□ 1.11
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Abhd12bG3UZN6 359 aa21.99■■□□□ 1.11
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Akap1O08715 857 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Bcl6P41183 707 aa21.99■■□□□ 1.11
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