Protein–RNA interactions for Protein: D3YZV8

Ccdc8, Coiled-coil domain-containing protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc8D3YZV8 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC38.69■■■■□ 3.78
Ccdc8D3YZV8 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Ccdc8D3YZV8 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Ccdc8D3YZV8 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Ccdc8D3YZV8 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Ccdc8D3YZV8 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
Ccdc8D3YZV8 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3.01
Ccdc8D3YZV8 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
Ccdc8D3YZV8 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
Ccdc8D3YZV8 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Ccdc8D3YZV8 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Ccdc8D3YZV8 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Ccdc8D3YZV8 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
Ccdc8D3YZV8 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
Ccdc8D3YZV8 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Ccdc8D3YZV8 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
Ccdc8D3YZV8 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Ccdc8D3YZV8 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Ccdc8D3YZV8 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Ccdc8D3YZV8 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Ccdc8D3YZV8 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Ccdc8D3YZV8 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Ccdc8D3YZV8 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Ccdc8D3YZV8 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
Ccdc8D3YZV8 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Ccdc8D3YZV8 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Ccdc8D3YZV8 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
Ccdc8D3YZV8 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Ccdc8D3YZV8 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC31.41■■■□□ 2.62
Ccdc8D3YZV8 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
Ccdc8D3YZV8 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Ccdc8D3YZV8 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Ccdc8D3YZV8 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
Ccdc8D3YZV8 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Ccdc8D3YZV8 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
Ccdc8D3YZV8 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Ccdc8D3YZV8 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Ccdc8D3YZV8 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
Ccdc8D3YZV8 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Ccdc8D3YZV8 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Ccdc8D3YZV8 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Ccdc8D3YZV8 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Ccdc8D3YZV8 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Ccdc8D3YZV8 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
Ccdc8D3YZV8 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
Ccdc8D3YZV8 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Ccdc8D3YZV8 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Ccdc8D3YZV8 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Ccdc8D3YZV8 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Ccdc8D3YZV8 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Ccdc8D3YZV8 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Ccdc8D3YZV8 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Ccdc8D3YZV8 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Ccdc8D3YZV8 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Ccdc8D3YZV8 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
Ccdc8D3YZV8 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Ccdc8D3YZV8 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
Ccdc8D3YZV8 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Ccdc8D3YZV8 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Ccdc8D3YZV8 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Ccdc8D3YZV8 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Ccdc8D3YZV8 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
Ccdc8D3YZV8 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Ccdc8D3YZV8 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Ccdc8D3YZV8 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Ccdc8D3YZV8 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Ccdc8D3YZV8 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Ccdc8D3YZV8 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Ccdc8D3YZV8 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ccdc8D3YZV8 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
Ccdc8D3YZV8 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ccdc8D3YZV8 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ccdc8D3YZV8 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ccdc8D3YZV8 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Ccdc8D3YZV8 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Ccdc8D3YZV8 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ccdc8D3YZV8 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
Ccdc8D3YZV8 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ccdc8D3YZV8 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ccdc8D3YZV8 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Ccdc8D3YZV8 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ccdc8D3YZV8 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Ccdc8D3YZV8 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ccdc8D3YZV8 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Ccdc8D3YZV8 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ccdc8D3YZV8 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ccdc8D3YZV8 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ccdc8D3YZV8 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Ccdc8D3YZV8 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Ccdc8D3YZV8 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ccdc8D3YZV8 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ccdc8D3YZV8 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ccdc8D3YZV8 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ccdc8D3YZV8 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ccdc8D3YZV8 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ccdc8D3YZV8 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ccdc8D3YZV8 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ccdc8D3YZV8 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ccdc8D3YZV8 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ccdc8D3YZV8 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms