RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000618610.1

PTPRT-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 3,230 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-211ENST00000618610 HLA-DRAP01903 254 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 FYNP06241 537 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 APRTP07741 180 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 GNA15P30679 374 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 CAP2P40123 477 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 CDKN2BP42772 138 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 TRPC1P48995 793 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 SEPHS1P49903 392 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 GPC3P51654 580 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 GALNT2Q10471 571 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 DPYSL3Q14195 570 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 PCLAFQ15004 111 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 SPCS2Q15005 226 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 PPP1R3AQ16821 1122 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 SMU1Q2TAY7 513 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 TFDP3Q5H9I0 405 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 FSCBQ5H9T9 825 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 CEP78Q5JTW2 689 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 BSPRYQ5W0U4 402 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 MON1BQ7L1V2 547 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 RFX6Q8HWS3 928 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 C17orf80Q9BSJ5 609 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 MROQ9BYG7 248 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 SORCS3Q9UPU3 1222 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 TEX264Q9Y6I9 313 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 ZNF541Q9H0D2 1346 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 MICAL3Q7RTP6 2002 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 CCDC162PA2VCL2 907 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 E7ESA3 106 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 CCNE2O96020 404 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 ICAM1P05362 532 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 ITGAVP06756 1048 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 CHRNGP07510 517 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 KCNA2P16389 499 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 MPSTP25325 297 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 GRIA1P42261 906 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 AP3M2P53677 418 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 RAB15P59190 212 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 KRT76Q01546 638 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 CREB5Q02930 508 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 MMRN1Q13201 1228 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 C16orf89Q6UX73 402 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 SPNS2Q8IVW8 549 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 C12orf56Q8IXR9 622 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 LGI2Q8N0V4 545 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 GOLM1Q8NBJ4 401 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 SLC35B2Q8TB61 432 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 HM13Q8TCT9 377 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 FIG4Q92562 907 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 LPGAT1Q92604 370 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 SGF29Q96ES7 293 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 MAGED4Q96JG8 741 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 GLT1D1Q96MS3 346 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 SLC39A3Q9BRY0 314 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 CALN1Q9BXU9 219 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 DGCR6LQ9BY27 220 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 PLAC1Q9HBJ0 212 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 MYOZ2Q9NPC6 264 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 TCF7L2Q9NQB0 619 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 GGA3Q9NZ52 723 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 TMEM216Q9P0N5 145 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 MEN1O00255 615 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 TPP1O14773 563 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 JUNP05412 331 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 MAPTP10636 758 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 RALBP11234 206 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 DCKP27707 260 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 RABGGTBP53611 331 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 NHSL2Q5HYW2 709 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP8.31□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 SIGIRRQ6IA17 410 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 B3GNT9Q6UX72 402 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 NAPRTQ6XQN6 538 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 GK5Q6ZS86 529 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 CMC1Q7Z7K0 106 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 FEZF2Q8TBJ5 459 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 SLCO4A1Q96BD0 722 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 OLFM1Q99784 485 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 MRIQ9BWK5 157 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 GDAP2Q9NXN4 497 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 COQ3Q9NZJ6 369 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 HES2Q9Y543 173 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 V9GYQ6 96 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 KCNU1A8MYU2 1149 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 ACOT8O14734 319 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 USP12O75317 370 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRT-211ENST00000618610 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
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