RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 CLCN6P51797 869 aa26.22■■□□□ 1.79
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CAPNS1-211ENST00000590874 EXOC3L4Q17RC7 722 aa26.22■■□□□ 1.79
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM259Q4ZIN3 620 aa26.22■■□□□ 1.79
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF542PQ5EBM4 170 aa26.22■■□□□ 1.79
CAPNS1-211ENST00000590874 ARSIQ5FYB1 569 aa26.22■■□□□ 1.79
CAPNS1-211ENST00000590874 BRMS1LQ5PSV4 323 aa26.22■■□□□ 1.79
CAPNS1-211ENST00000590874 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP26.22■■□□□ 1.79
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CAPNS1-211ENST00000590874 APOLD1Q96LR9 279 aa26.22■■□□□ 1.79
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CAPNS1-211ENST00000590874 SIX2Q9NPC8 291 aa26.22■■□□□ 1.79
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CAPNS1-211ENST00000590874 IL36AQ9UHA7 158 aa26.22■■□□□ 1.79
CAPNS1-211ENST00000590874 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa26.21■■□□□ 1.79
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CAPNS1-211ENST00000590874 U3KQA8 63 aa26.21■■□□□ 1.79
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CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP26.2■■□□□ 1.78
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CAPNS1-211ENST00000590874 GPR27Q9NS67 375 aa26.2■■□□□ 1.78
CAPNS1-211ENST00000590874 RRN3Q9NYV6 651 aa26.2■■□□□ 1.78
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CAPNS1-211ENST00000590874 A6NNZ2 444 aa26.19■■□□□ 1.78
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CAPNS1-211ENST00000590874 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa26.19■■□□□ 1.78
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CAPNS1-211ENST00000590874 K7ESM1 405 aa26.18■■□□□ 1.78
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CAPNS1-211ENST00000590874 OR1E1P30953 314 aa26.18■■□□□ 1.78
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CAPNS1-211ENST00000590874 GABREP78334 506 aa26.18■■□□□ 1.78
CAPNS1-211ENST00000590874 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP26.18■■□□□ 1.78
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CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF843Q8N446 348 aa26.18■■□□□ 1.78
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM181AQ8N9Y4 354 aa26.18■■□□□ 1.78
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF248Q8NDW4 579 aa26.18■■□□□ 1.78
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CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF212Q9UDV6 495 aa26.18■■□□□ 1.78
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CAPNS1-211ENST00000590874 ADRB3P13945 408 aa26.17■■□□□ 1.78
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CAPNS1-211ENST00000590874 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP26.17■■□□□ 1.78
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CAPNS1-211ENST00000590874 SPON2Q9BUD6 331 aa26.17■■□□□ 1.78
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC17A9Q9BYT1 436 aa26.17■■□□□ 1.78
CAPNS1-211ENST00000590874 OSBPL2Q9H1P3 480 aa26.17■■□□□ 1.78
CAPNS1-211ENST00000590874 FADS3Q9Y5Q0 445 aa26.17■■□□□ 1.78
CAPNS1-211ENST00000590874 NEMP2A6NFY4 417 aa26.16■■□□□ 1.78
CAPNS1-211ENST00000590874 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP26.16■■□□□ 1.78
CAPNS1-211ENST00000590874 F9P00740 461 aa26.16■■□□□ 1.78
CAPNS1-211ENST00000590874 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP26.16■■□□□ 1.78
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