RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493792.1

TRAPPC12-222, Transcript of trafficking protein particle complex 12, human

TSL 2

Gene TRAPPC12, Length 567 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TRAPPC12-222	ENST00000493792	UVRAG	Q9P2Y5	699 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TRAPPC12-222	ENST00000493792	MBD1	Q9UIS9	605 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
TRAPPC12-222	ENST00000493792	NENF	Q9UMX5	172 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TRAPPC12-222	ENST00000493792	NCKAP1	Q9Y2A7	1128 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TRAPPC12-222	ENST00000493792	THADA	Q6YHU6	1953 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TRAPPC12-222	ENST00000493792	CKAP5	Q14008	2032 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TRAPPC12-222	ENST00000493792	ATXN2	Q99700	1313 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
TRAPPC12-222	ENST00000493792	DOCK4	Q8N1I0	1966 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TRAPPC12-222	ENST00000493792	SPAAR	A0A1B0GVQ0	90 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TRAPPC12-222	ENST00000493792	MEI4	A8MW99	385 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TRAPPC12-222	ENST00000493792	EIF3CL	B5ME19	914 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
TRAPPC12-222	ENST00000493792		H3BRJ5	948 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TRAPPC12-222	ENST00000493792	MID1	O15344	667 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TRAPPC12-222	ENST00000493792	BUB1	O43683	1085 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TRAPPC12-222	ENST00000493792	IPO7	O95373	1038 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
TRAPPC12-222	ENST00000493792	SRC	P12931	536 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TRAPPC12-222	ENST00000493792	TCF4	P15884	667 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TRAPPC12-222	ENST00000493792	GOT1	P17174	413 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TRAPPC12-222	ENST00000493792	IL1R2	P27930	398 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TRAPPC12-222	ENST00000493792	OXTR	P30559	389 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TRAPPC12-222	ENST00000493792	CYLC1	P35663	651 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
TRAPPC12-222	ENST00000493792	MAGEA1	P43355	309 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TRAPPC12-222	ENST00000493792	TPMT	P51580	245 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TRAPPC12-222	ENST00000493792	SEMA3B	Q13214	749 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TRAPPC12-222	ENST00000493792	KRT81	Q14533	505 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TRAPPC12-222	ENST00000493792	ELAVL3	Q14576	367 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
TRAPPC12-222	ENST00000493792	SPA17	Q15506	151 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TRAPPC12-222	ENST00000493792	CST6	Q15828	149 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TRAPPC12-222	ENST00000493792	POM121L1P	Q3SYA9	428 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TRAPPC12-222	ENST00000493792	SPDYC	Q5MJ68	293 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TRAPPC12-222	ENST00000493792	LYSMD4	Q5XG99	296 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TRAPPC12-222	ENST00000493792	C19orf48	Q6RUI8	117 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TRAPPC12-222	ENST00000493792	RFX8	Q6ZV50	586 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TRAPPC12-222	ENST00000493792	DSG4	Q86SJ6	1040 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TRAPPC12-222	ENST00000493792	NLRP14	Q86W24	1093 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TRAPPC12-222	ENST00000493792	RGL4	Q8IZJ4	473 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TRAPPC12-222	ENST00000493792	FRS2	Q8WU20	508 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TRAPPC12-222	ENST00000493792	OR8D1	Q8WZ84	308 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TRAPPC12-222	ENST00000493792	PTPRN2	Q92932	1015 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TRAPPC12-222	ENST00000493792	ARHGEF2	Q92974	986 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
TRAPPC12-222	ENST00000493792	CELF6	Q96J87	481 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
TRAPPC12-222	ENST00000493792	CCDC114	Q96M63	670 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TRAPPC12-222	ENST00000493792	EIF3C	Q99613	913 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
TRAPPC12-222	ENST00000493792	OMD	Q99983	421 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TRAPPC12-222	ENST00000493792	GPR174	Q9BXC1	333 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TRAPPC12-222	ENST00000493792	RSPH9	Q9H1X1	276 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
TRAPPC12-222	ENST00000493792	TNKS2	Q9H2K2	1166 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TRAPPC12-222	ENST00000493792	RETREG1	Q9H6L5	497 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TRAPPC12-222	ENST00000493792	OSGEP	Q9NPF4	335 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TRAPPC12-222	ENST00000493792	LUC7L	Q9NQ29	371 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
TRAPPC12-222	ENST00000493792	TMEM74B	Q9NUR3	256 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TRAPPC12-222	ENST00000493792	DONSON	Q9NYP3	566 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TRAPPC12-222	ENST00000493792	USP36	Q9P275	1121 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
TRAPPC12-222	ENST00000493792	ZNF212	Q9UDV6	495 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TRAPPC12-222	ENST00000493792	EVL	Q9UI08	416 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
TRAPPC12-222	ENST00000493792	NEU3	Q9UQ49	428 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TRAPPC12-222	ENST00000493792	FCF1	Q9Y324	198 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
TRAPPC12-222	ENST00000493792	GON4L	Q3T8J9	2241 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TRAPPC12-222	ENST00000493792		A0A1W2PP55	124 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TRAPPC12-222	ENST00000493792	FAM47DP	A6NHR8	397 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TRAPPC12-222	ENST00000493792	UPK3BL1	B0FP48	263 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TRAPPC12-222	ENST00000493792	RASA4B	C9J798	803 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TRAPPC12-222	ENST00000493792	UPK3BL2	E5RIL1	263 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TRAPPC12-222	ENST00000493792	DFFA	O00273	331 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TRAPPC12-222	ENST00000493792	RASA4	O43374	803 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TRAPPC12-222	ENST00000493792	SMAD6	O43541	496 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
TRAPPC12-222	ENST00000493792	ATP9B	O43861	1147 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TRAPPC12-222	ENST00000493792	RNASEH2A	O75792	299 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
TRAPPC12-222	ENST00000493792	PROSC	O94903	275 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TRAPPC12-222	ENST00000493792	ZIC2	O95409	532 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
TRAPPC12-222	ENST00000493792	ADH1B	P00325	375 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TRAPPC12-222	ENST00000493792	RARA	P10276	462 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TRAPPC12-222	ENST00000493792	TNNT1	P13805	278 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TRAPPC12-222	ENST00000493792	ERCC2	P18074	760 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TRAPPC12-222	ENST00000493792	SLC8A1	P32418	973 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TRAPPC12-222	ENST00000493792	HTR7	P34969	479 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TRAPPC12-222	ENST00000493792	PTGER3	P43115	390 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TRAPPC12-222	ENST00000493792	NOP2	P46087	812 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
TRAPPC12-222	ENST00000493792	SERPINH1	P50454	418 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
TRAPPC12-222	ENST00000493792	CDH6	P55285	790 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TRAPPC12-222	ENST00000493792	FAM193A	P78312	1265 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TRAPPC12-222	ENST00000493792	ZBTB16	Q05516	673 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TRAPPC12-222	ENST00000493792	ZNF33A	Q06730	810 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TRAPPC12-222	ENST00000493792	SLC20A2	Q08357	652 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TRAPPC12-222	ENST00000493792	SFSWAP	Q12872	951 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
TRAPPC12-222	ENST00000493792	BOLA3	Q53S33	107 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TRAPPC12-222	ENST00000493792	ARTN	Q5T4W7	220 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TRAPPC12-222	ENST00000493792	TXNRD3NB	Q6F5E7	133 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TRAPPC12-222	ENST00000493792	C22orf39	Q6P5X5	142 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TRAPPC12-222	ENST00000493792	METTL3	Q86U44	580 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
TRAPPC12-222	ENST00000493792	PDZD3	Q86UT5	571 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TRAPPC12-222	ENST00000493792	PSTK	Q8IV42	348 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
TRAPPC12-222	ENST00000493792	RHOT2	Q8IXI1	618 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TRAPPC12-222	ENST00000493792	RYBP	Q8N488	228 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
TRAPPC12-222	ENST00000493792	HDDC3	Q8N4P3	179 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TRAPPC12-222	ENST00000493792	CHCHD4	Q8N4Q1	142 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TRAPPC12-222	ENST00000493792	NIPA2	Q8N8Q9	360 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TRAPPC12-222	ENST00000493792	SLC35G2	Q8TBE7	412 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TRAPPC12-222	ENST00000493792	RFFL	Q8WZ73	363 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TRAPPC12-222	ENST00000493792	SNX19	Q92543	992 aa		10.62	□□□□□ -0.71

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