RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485459.5

RABGGTB-210, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 788 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-210ENST00000485459 ARSBP15848 533 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-210ENST00000485459 CAPN2P17655 700 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-210ENST00000485459 CHRNB2P17787 502 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-210ENST00000485459 TNFRSF8P28908 595 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-210ENST00000485459 TYK2P29597 1187 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-210ENST00000485459 SERPINF1P36955 418 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-210ENST00000485459 PCYT1AP49585 367 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-210ENST00000485459 CDK7P50613 346 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-210ENST00000485459 GXYLT1Q4G148 440 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-210ENST00000485459 TTC22Q5TAA0 569 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-210ENST00000485459 C20orf194Q5TEA3 1177 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-210ENST00000485459 MTFR2Q6P444 385 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-210ENST00000485459 RRAGAQ7L523 313 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-210ENST00000485459 RNF144BQ7Z419 303 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-210ENST00000485459 PDCL2Q8N4E4 241 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-210ENST00000485459 HORMAD2Q8N7B1 307 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-210ENST00000485459 SMRP1Q8NCR6 262 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-210ENST00000485459 ENGASEQ8NFI3 743 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-210ENST00000485459 SLC2A12Q8TD20 617 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-210ENST00000485459 ELP5Q8TE02 316 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-210ENST00000485459 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-210ENST00000485459 NPAS1Q99742 590 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-210ENST00000485459 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-210ENST00000485459 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-210ENST00000485459 WNT16Q9UBV4 365 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-210ENST00000485459 KDM5BQ9UGL1 1544 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-210ENST00000485459 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-210ENST00000485459 CHD1O14646 1710 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-210ENST00000485459 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-210ENST00000485459 TMEM247A6NEH6 219 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-210ENST00000485459 F5H423 210 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-210ENST00000485459 SPRY3O43610 288 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-210ENST00000485459 LIASO43766 372 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-210ENST00000485459 TMCC1O94876 653 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-210ENST00000485459 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-210ENST00000485459 PLA2G2AP14555 144 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-210ENST00000485459 SELENOVP59797 346 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-210ENST00000485459 LTBQ06643 244 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-210ENST00000485459 LMOD3Q0VAK6 560 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-210ENST00000485459 PDCLQ13371 301 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-210ENST00000485459 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-210ENST00000485459 PLK5Q496M5 336 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-210ENST00000485459 FNBP1LQ5T0N5 605 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-210ENST00000485459 LIN54Q6MZP7 749 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-210ENST00000485459 PALB2Q86YC2 1186 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-210ENST00000485459 PRR26Q8N8Z3 221 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-210ENST00000485459 VPS37AQ8NEZ2 397 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-210ENST00000485459 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-210ENST00000485459 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-210ENST00000485459 CTAGE1Q96RT6 745 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-210ENST00000485459 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-210ENST00000485459 ZNF700Q9H0M5 742 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-210ENST00000485459 ACAD9Q9H845 621 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-210ENST00000485459 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-210ENST00000485459 Q9N2J8 555 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-210ENST00000485459 PLCB1Q9NQ66 1216 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-210ENST00000485459 TMLHEQ9NVH6 421 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-210ENST00000485459 TMEM248Q9NWD8 314 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-210ENST00000485459 OGFRQ9NZT2 677 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-210ENST00000485459 CDH22Q9UJ99 828 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-210ENST00000485459 KCND3Q9UK17 655 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-210ENST00000485459 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-210ENST00000485459 SYNJ1O43426 1573 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-210ENST00000485459 NLRP1Q9C000 1473 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-210ENST00000485459 SCAPERQ9BY12 1400 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-210ENST00000485459 NINLQ9Y2I6 1382 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-210ENST00000485459 NPIPB13A6NJU9 1138 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-210ENST00000485459 NPIPB5A8MRT5 1133 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-210ENST00000485459 NPIPB4C9JG80 1138 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-210ENST00000485459 INAFM1C9JVW0 142 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-210ENST00000485459 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-210ENST00000485459 RGS14O43566 566 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-210ENST00000485459 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-210ENST00000485459 CSTBP04080 98 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-210ENST00000485459 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-210ENST00000485459 FCGR2AP12318 317 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-210ENST00000485459 CYP4B1P13584 511 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-210ENST00000485459 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-210ENST00000485459 AVPR1AP37288 418 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-210ENST00000485459 HTR3AP46098 478 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-210ENST00000485459 PNLIPRP1P54315 467 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-210ENST00000485459 ZP1P60852 638 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-210ENST00000485459 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-210ENST00000485459 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-210ENST00000485459 GPS2Q13227 327 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-210ENST00000485459 BLMHQ13867 455 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-210ENST00000485459 CCDC38Q502W7 563 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-210ENST00000485459 LRRC24Q50LG9 513 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-210ENST00000485459 FSCBQ5H9T9 825 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-210ENST00000485459 GORABQ5T7V8 394 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-210ENST00000485459 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-210ENST00000485459 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-210ENST00000485459 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-210ENST00000485459 FSIP1Q8NA03 581 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-210ENST00000485459 KDM1BQ8NB78 822 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-210ENST00000485459 RUBCNQ92622 972 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-210ENST00000485459 GOLGA1Q92805 767 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-210ENST00000485459 ZNF333Q96JL9 665 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-210ENST00000485459 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-210ENST00000485459 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 72 ms