RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460297.1

NME4-209, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 4, humanhuman

TSL 5

Gene NME4, Length 1,652 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME4-209ENST00000460297 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
NME4-209ENST00000460297 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
NME4-209ENST00000460297 NSMCE1Q8WV22 266 aa24.69■■□□□ 1.54
NME4-209ENST00000460297 GORASP1Q9BQQ3 440 aa24.69■■□□□ 1.54
NME4-209ENST00000460297 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
NME4-209ENST00000460297 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
NME4-209ENST00000460297 GBA3Q9H227 469 aa24.69■■□□□ 1.54
NME4-209ENST00000460297 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
NME4-209ENST00000460297 ANAPC5Q9UJX4 755 aa24.69■■□□□ 1.54
NME4-209ENST00000460297 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa24.69■■□□□ 1.54
NME4-209ENST00000460297 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa24.69■■□□□ 1.54
NME4-209ENST00000460297 CISD3P0C7P0 127 aa24.69■■□□□ 1.54
NME4-209ENST00000460297 NFKB1P19838 968 aa24.69■■□□□ 1.54
NME4-209ENST00000460297 MMP13P45452 471 aa24.69■■□□□ 1.54
NME4-209ENST00000460297 PARP6Q2NL67 630 aa24.69■■□□□ 1.54
NME4-209ENST00000460297 SYCP2LQ5T4T6 812 aa24.69■■□□□ 1.54
NME4-209ENST00000460297 PGBD5Q8N414 524 aa24.69■■□□□ 1.54
NME4-209ENST00000460297 CPA6Q8N4T0 437 aa24.69■■□□□ 1.54
NME4-209ENST00000460297 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP24.69■■□□□ 1.544e-7■■□□□ 11.5
NME4-209ENST00000460297 BBOF1Q8ND07 529 aa24.69■■□□□ 1.54
NME4-209ENST00000460297 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
NME4-209ENST00000460297 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
NME4-209ENST00000460297 RSPH14Q9UHP6 348 aa24.69■■□□□ 1.54
NME4-209ENST00000460297 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa24.69■■□□□ 1.54
NME4-209ENST00000460297 TULP3O75386 442 aa24.68■■□□□ 1.54
NME4-209ENST00000460297 SEMA5AQ13591 1074 aa24.68■■□□□ 1.54
NME4-209ENST00000460297 KCNJ11Q14654 390 aa24.68■■□□□ 1.54
NME4-209ENST00000460297 PPIL6Q8IXY8 311 aa24.68■■□□□ 1.54
NME4-209ENST00000460297 NAT8LQ8N9F0 302 aa24.68■■□□□ 1.54
NME4-209ENST00000460297 TTC8Q8TAM2 541 aa24.68■■□□□ 1.54
NME4-209ENST00000460297 ACDQ96AP0 544 aa24.68■■□□□ 1.54
NME4-209ENST00000460297 NT5MQ9NPB1 228 aa24.68■■□□□ 1.54
NME4-209ENST00000460297 TTLL3Q9Y4R7 772 aa24.68■■□□□ 1.54
NME4-209ENST00000460297 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa24.67■■□□□ 1.54
NME4-209ENST00000460297 FDFT1P37268 417 aa24.67■■□□□ 1.54
NME4-209ENST00000460297 DGKGP49619 791 aa24.67■■□□□ 1.54
NME4-209ENST00000460297 MORF4L2Q15014 288 aa24.67■■□□□ 1.54
NME4-209ENST00000460297 TMEM215Q68D42 235 aa24.67■■□□□ 1.54
NME4-209ENST00000460297 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa24.67■■□□□ 1.54
NME4-209ENST00000460297 PCGF5Q86SE9 256 aa24.67■■□□□ 1.54
NME4-209ENST00000460297 ADIPOR2Q86V24 386 aa24.67■■□□□ 1.54
NME4-209ENST00000460297 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP24.67■■□□□ 1.54
NME4-209ENST00000460297 GLOD4Q9HC38 313 aa24.67■■□□□ 1.54
NME4-209ENST00000460297 COL6A3P12111 3177 aa24.67■■□□□ 1.54
NME4-209ENST00000460297 MUSKO15146 869 aa24.66■■□□□ 1.54
NME4-209ENST00000460297 NEBLO76041 1014 aa24.66■■□□□ 1.54
NME4-209ENST00000460297 TMEM63AO94886 807 aa24.66■■□□□ 1.54
NME4-209ENST00000460297 MT-CO1P00395 513 aa24.66■■□□□ 1.54
NME4-209ENST00000460297 FAM153BP0C7A2 387 aa24.66■■□□□ 1.54
NME4-209ENST00000460297 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP24.66■■□□□ 1.54
NME4-209ENST00000460297 MAGEA6P43360 314 aa24.66■■□□□ 1.54
NME4-209ENST00000460297 SLC6A11P48066 632 aa24.66■■□□□ 1.54
NME4-209ENST00000460297 MAXP61244 160 aa24.66■■□□□ 1.54
NME4-209ENST00000460297 MESP2Q0VG99 397 aa24.66■■□□□ 1.54
NME4-209ENST00000460297 NR1H3Q13133 447 aa24.66■■□□□ 1.54
NME4-209ENST00000460297 BRD3Q15059 726 aa24.66■■□□□ 1.54
NME4-209ENST00000460297 GEN1Q17RS7 908 aa24.66■■□□□ 1.54
NME4-209ENST00000460297 AAK1Q2M2I8 961 aa24.66■■□□□ 1.54
NME4-209ENST00000460297 FAM153CQ494X1 144 aa24.66■■□□□ 1.54
NME4-209ENST00000460297 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP24.66■■□□□ 1.54
NME4-209ENST00000460297 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP24.66■■□□□ 1.54
NME4-209ENST00000460297 CHFRQ96EP1 664 aa24.66■■□□□ 1.54
NME4-209ENST00000460297 FAM129AQ9BZQ8 928 aa24.66■■□□□ 1.54
NME4-209ENST00000460297 FAM153AQ9UHL3 310 aa24.66■■□□□ 1.54
NME4-209ENST00000460297 CCDC151A5D8V7 595 aa24.66■■□□□ 1.54
NME4-209ENST00000460297 APRTP07741 180 aa24.66■■□□□ 1.54
NME4-209ENST00000460297 GJA4P35212 333 aa24.66■■□□□ 1.54
NME4-209ENST00000460297 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP24.66■■□□□ 1.54
NME4-209ENST00000460297 CAV1Q03135 178 aa24.66■■□□□ 1.54
NME4-209ENST00000460297 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP24.66■■□□□ 1.54
NME4-209ENST00000460297 CYTH1Q15438 398 aa24.66■■□□□ 1.54
NME4-209ENST00000460297 BRD9Q9H8M2 597 aa24.66■■□□□ 1.54
NME4-209ENST00000460297 LIMD1Q9UGP4 676 aa24.66■■□□□ 1.54
NME4-209ENST00000460297 SHOC2Q9UQ13 582 aa24.66■■□□□ 1.54
NME4-209ENST00000460297 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa24.66■■□□□ 1.54
NME4-209ENST00000460297 MYO10Q9HD67 2058 aa24.65■■□□□ 1.54
NME4-209ENST00000460297 TFF2Q03403 129 aa24.65■■□□□ 1.54
NME4-209ENST00000460297 DMC1Q14565 340 aa24.65■■□□□ 1.54
NME4-209ENST00000460297 ZNF235Q14590 738 aa24.65■■□□□ 1.54
NME4-209ENST00000460297 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP24.65■■□□□ 1.54
NME4-209ENST00000460297 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP24.65■■□□□ 1.54
NME4-209ENST00000460297 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP24.65■■□□□ 1.54
NME4-209ENST00000460297 RETSATQ6NUM9 610 aa24.65■■□□□ 1.54
NME4-209ENST00000460297 HOOK3Q86VS8 718 aa24.65■■□□□ 1.54
NME4-209ENST00000460297 AHI1Q8N157 1196 aa24.65■■□□□ 1.54
NME4-209ENST00000460297 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP24.65■■□□□ 1.54
NME4-209ENST00000460297 EXOC4Q96A65 974 aa24.65■■□□□ 1.54
NME4-209ENST00000460297 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP24.65■■□□□ 1.54
NME4-209ENST00000460297 PWWP2AQ96N64 755 aa24.65■■□□□ 1.54
NME4-209ENST00000460297 PSKH2Q96QS6 385 aa24.65■■□□□ 1.54
NME4-209ENST00000460297 FCRL5Q96RD9 977 aa24.65■■□□□ 1.54
NME4-209ENST00000460297 FMO2Q99518 471 aa24.65■■□□□ 1.54
NME4-209ENST00000460297 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP24.65■■□□□ 1.54
NME4-209ENST00000460297 KCNK12Q9HB15 430 aa24.65■■□□□ 1.54
NME4-209ENST00000460297 SEPT3Q9UH03 358 aa24.65■■□□□ 1.54
NME4-209ENST00000460297 K7ERQ8 282 aa24.64■■□□□ 1.53
NME4-209ENST00000460297 TMCC1O94876 653 aa24.64■■□□□ 1.53
NME4-209ENST00000460297 OPRD1P41143 372 aa24.64■■□□□ 1.53
NME4-209ENST00000460297 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa24.64■■□□□ 1.53
NME4-209ENST00000460297 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa24.64■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.7 ms