RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426951.5

RBM39-211, Transcript of RNA binding motif protein 39, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RBM39, Length 840 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39-211ENST00000426951 GPR68Q15743 365 aa4.56□□□□□ -1.68
RBM39-211ENST00000426951 MANEAQ5SRI9 462 aa4.56□□□□□ -1.68
RBM39-211ENST00000426951 ZNF425Q6IV72 752 aa4.56□□□□□ -1.68
RBM39-211ENST00000426951 TRIM74Q86UV6 250 aa4.56□□□□□ -1.68
RBM39-211ENST00000426951 TRIM73Q86UV7 250 aa4.56□□□□□ -1.68
RBM39-211ENST00000426951 MON1AQ86VX9 555 aa4.56□□□□□ -1.68
RBM39-211ENST00000426951 FAM217AQ8IXS0 508 aa4.56□□□□□ -1.68
RBM39-211ENST00000426951 FAM185AQ8N0U4 392 aa4.56□□□□□ -1.68
RBM39-211ENST00000426951 MMP21Q8N119 569 aa4.56□□□□□ -1.68
RBM39-211ENST00000426951 TMEM199Q8N511 208 aa4.56□□□□□ -1.68
RBM39-211ENST00000426951 IL17REQ8NFR9 667 aa4.56□□□□□ -1.68
RBM39-211ENST00000426951 RAB40AQ8WXH6 277 aa4.56□□□□□ -1.68
RBM39-211ENST00000426951 HSPH1Q92598 858 aa4.56□□□□□ -1.68
RBM39-211ENST00000426951 ZBTB10Q96DT7 871 aa4.56□□□□□ -1.68
RBM39-211ENST00000426951 ELP4Q96EB1 424 aa4.56□□□□□ -1.68
RBM39-211ENST00000426951 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
RBM39-211ENST00000426951 EYA3Q99504 573 aa4.56□□□□□ -1.68
RBM39-211ENST00000426951 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa4.56□□□□□ -1.68
RBM39-211ENST00000426951 MAP6D1Q9H9H5 199 aa4.56□□□□□ -1.68
RBM39-211ENST00000426951 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
RBM39-211ENST00000426951 GRHL1Q9NZI5 618 aa4.56□□□□□ -1.68
RBM39-211ENST00000426951 PGAP2Q9UHJ9 254 aa4.56□□□□□ -1.68
RBM39-211ENST00000426951 TBX20Q9UMR3 447 aa4.56□□□□□ -1.68
RBM39-211ENST00000426951 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa4.55□□□□□ -1.68
RBM39-211ENST00000426951 A6NLC8 198 aa4.55□□□□□ -1.68
RBM39-211ENST00000426951 SOCS2O14508 198 aa4.55□□□□□ -1.68
RBM39-211ENST00000426951 CEP104O60308 925 aa4.55□□□□□ -1.68
RBM39-211ENST00000426951 GUCY1B2O75343 617 aa4.55□□□□□ -1.68
RBM39-211ENST00000426951 TULP3O75386 442 aa4.55□□□□□ -1.68
RBM39-211ENST00000426951 EPN2O95208 641 aa4.55□□□□□ -1.68
RBM39-211ENST00000426951 UNGP13051 313 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
RBM39-211ENST00000426951 DPP6P42658 865 aa4.55□□□□□ -1.68
RBM39-211ENST00000426951 LIFRP42702 1097 aa4.55□□□□□ -1.68
RBM39-211ENST00000426951 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
RBM39-211ENST00000426951 CDH15P55291 814 aa4.55□□□□□ -1.68
RBM39-211ENST00000426951 RPP30P78346 268 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
RBM39-211ENST00000426951 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP4.55□□□□□ -1.682e-54■■■□□ 17.5
RBM39-211ENST00000426951 PKP1Q13835 747 aa4.55□□□□□ -1.68
RBM39-211ENST00000426951 RPE65Q16518 533 aa4.55□□□□□ -1.68
RBM39-211ENST00000426951 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa4.55□□□□□ -1.68
RBM39-211ENST00000426951 TBC1D9BQ66K14 1250 aa4.55□□□□□ -1.68
RBM39-211ENST00000426951 C1QL2Q7Z5L3 287 aa4.55□□□□□ -1.68
RBM39-211ENST00000426951 HORMAD2Q8N7B1 307 aa4.55□□□□□ -1.68
RBM39-211ENST00000426951 PAF1Q8N7H5 531 aa4.55□□□□□ -1.68
RBM39-211ENST00000426951 MPLKIPQ8TAP9 179 aa4.55□□□□□ -1.68
RBM39-211ENST00000426951 ST8SIA4Q92187 359 aa4.55□□□□□ -1.68
RBM39-211ENST00000426951 SLC25A28Q96A46 364 aa4.55□□□□□ -1.68
RBM39-211ENST00000426951 TMEM79Q9BSE2 394 aa4.55□□□□□ -1.68
RBM39-211ENST00000426951 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
RBM39-211ENST00000426951 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa4.55□□□□□ -1.68
RBM39-211ENST00000426951 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa4.55□□□□□ -1.68
RBM39-211ENST00000426951 RNF146Q9NTX7 359 aa4.55□□□□□ -1.68
RBM39-211ENST00000426951 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa4.55□□□□□ -1.68
RBM39-211ENST00000426951 CNPY2Q9Y2B0 182 aa4.55□□□□□ -1.68
RBM39-211ENST00000426951 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa4.54□□□□□ -1.68
RBM39-211ENST00000426951 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
RBM39-211ENST00000426951 SERPINC1P01008 464 aa4.54□□□□□ -1.68
RBM39-211ENST00000426951 TMEM191BP0C7N4 346 aa4.54□□□□□ -1.68
RBM39-211ENST00000426951 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP4.54□□□□□ -1.68
RBM39-211ENST00000426951 ME3Q16798 604 aa4.54□□□□□ -1.68
RBM39-211ENST00000426951 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa4.54□□□□□ -1.68
RBM39-211ENST00000426951 CCDC70Q6NSX1 233 aa4.54□□□□□ -1.68
RBM39-211ENST00000426951 IL20RBQ6UXL0 311 aa4.54□□□□□ -1.68
RBM39-211ENST00000426951 COLCA1Q6ZS62 124 aa4.54□□□□□ -1.68
RBM39-211ENST00000426951 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa4.54□□□□□ -1.68
RBM39-211ENST00000426951 KDM1BQ8NB78 822 aa4.54□□□□□ -1.68
RBM39-211ENST00000426951 TNIP2Q8NFZ5 429 aa4.54□□□□□ -1.68
RBM39-211ENST00000426951 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
RBM39-211ENST00000426951 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
RBM39-211ENST00000426951 RNF125Q96EQ8 232 aa4.54□□□□□ -1.68
RBM39-211ENST00000426951 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
RBM39-211ENST00000426951 APOPT1Q96IL0 206 aa4.54□□□□□ -1.68
RBM39-211ENST00000426951 NLRP4Q96MN2 994 aa4.54□□□□□ -1.68
RBM39-211ENST00000426951 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
RBM39-211ENST00000426951 MPHOSPH8Q99549 860 aa4.54□□□□□ -1.68
RBM39-211ENST00000426951 B3GNT4Q9C0J1 378 aa4.54□□□□□ -1.68
RBM39-211ENST00000426951 TASP1Q9H6P5 420 aa4.54□□□□□ -1.68
RBM39-211ENST00000426951 FZD3Q9NPG1 666 aa4.54□□□□□ -1.68
RBM39-211ENST00000426951 UBN1Q9NPG3 1134 aa4.54□□□□□ -1.68
RBM39-211ENST00000426951 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa4.54□□□□□ -1.68
RBM39-211ENST00000426951 POT1Q9NUX5 634 aa4.54□□□□□ -1.68
RBM39-211ENST00000426951 TBC1D14Q9P2M4 693 aa4.54□□□□□ -1.68
RBM39-211ENST00000426951 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa4.54□□□□□ -1.68
RBM39-211ENST00000426951 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa4.53□□□□□ -1.68
RBM39-211ENST00000426951 FAM157AC9JC47 383 aa4.53□□□□□ -1.68
RBM39-211ENST00000426951 STMND1H3BQB6 276 aa4.53□□□□□ -1.68
RBM39-211ENST00000426951 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
RBM39-211ENST00000426951 MDM4O15151 490 aa4.53□□□□□ -1.68
RBM39-211ENST00000426951 RNMTO43148 476 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
RBM39-211ENST00000426951 SLC25A17O43808 307 aa4.53□□□□□ -1.68
RBM39-211ENST00000426951 SYF2O95926 243 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
RBM39-211ENST00000426951 FGF2P09038 288 aa4.53□□□□□ -1.68
RBM39-211ENST00000426951 PSG1P11464 419 aa4.53□□□□□ -1.68
RBM39-211ENST00000426951 ATP1A3P13637 1013 aa4.53□□□□□ -1.68
RBM39-211ENST00000426951 TNFRSF1BP20333 461 aa4.53□□□□□ -1.68
RBM39-211ENST00000426951 YWHAQP27348 245 aa4.53□□□□□ -1.68
RBM39-211ENST00000426951 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
RBM39-211ENST00000426951 GPD2P43304 727 aa4.53□□□□□ -1.68
RBM39-211ENST00000426951 NR4A2P43354 598 aa4.53□□□□□ -1.68
RBM39-211ENST00000426951 ARSFP54793 590 aa4.53□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.1 ms