RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384199.1

RNU6-1024P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1024, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1024P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1024P-201ENST00000384199 NAPSAO96009 420 aa-2.69□□□□□ -2.84
RNU6-1024P-201ENST00000384199 TFRCP02786 760 aaKnown RBP-2.69□□□□□ -2.84
RNU6-1024P-201ENST00000384199 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP-2.69□□□□□ -2.84
RNU6-1024P-201ENST00000384199 GP1BBP13224 206 aa-2.69□□□□□ -2.84
RNU6-1024P-201ENST00000384199 MAGP20916 626 aa-2.69□□□□□ -2.84
RNU6-1024P-201ENST00000384199 NME2P22392 152 aa-2.69□□□□□ -2.84
RNU6-1024P-201ENST00000384199 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP-2.69□□□□□ -2.84
RNU6-1024P-201ENST00000384199 TGFBR1P36897 503 aa-2.69□□□□□ -2.84
RNU6-1024P-201ENST00000384199 PIGAP37287 484 aa-2.69□□□□□ -2.84
RNU6-1024P-201ENST00000384199 ALDH9A1P49189 494 aa-2.69□□□□□ -2.84
RNU6-1024P-201ENST00000384199 YARSP54577 528 aaKnown RBP-2.69□□□□□ -2.84
RNU6-1024P-201ENST00000384199 PRKAA2P54646 552 aa-2.69□□□□□ -2.84
RNU6-1024P-201ENST00000384199 RPP30P78346 268 aaKnown RBP-2.69□□□□□ -2.84
RNU6-1024P-201ENST00000384199 PDE4DQ08499 809 aa-2.69□□□□□ -2.84
RNU6-1024P-201ENST00000384199 APOBRQ0VD83 1088 aa-2.69□□□□□ -2.84
RNU6-1024P-201ENST00000384199 NR1H3Q13133 447 aa-2.69□□□□□ -2.84
RNU6-1024P-201ENST00000384199 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP-2.69□□□□□ -2.84
RNU6-1024P-201ENST00000384199 UBE4AQ14139 1066 aa-2.69□□□□□ -2.84
RNU6-1024P-201ENST00000384199 ZNF528Q3MIS6 628 aa-2.69□□□□□ -2.84
RNU6-1024P-201ENST00000384199 C3orf36Q3SXR2 165 aa-2.69□□□□□ -2.84
RNU6-1024P-201ENST00000384199 C5orf47Q569G3 176 aa-2.69□□□□□ -2.84
RNU6-1024P-201ENST00000384199 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa-2.69□□□□□ -2.84
RNU6-1024P-201ENST00000384199 EEF1DP3Q658K8 133 aa-2.69□□□□□ -2.84
RNU6-1024P-201ENST00000384199 PDPK2PQ6A1A2 396 aa-2.69□□□□□ -2.84
RNU6-1024P-201ENST00000384199 BHLHB9Q6PI77 547 aa-2.69□□□□□ -2.84
RNU6-1024P-201ENST00000384199 FAM57BQ71RH2 274 aa-2.69□□□□□ -2.84
RNU6-1024P-201ENST00000384199 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa-2.69□□□□□ -2.84
RNU6-1024P-201ENST00000384199 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP-2.69□□□□□ -2.84
RNU6-1024P-201ENST00000384199 NT5DC4Q86YG4 428 aa-2.69□□□□□ -2.84
RNU6-1024P-201ENST00000384199 CADM3Q8N126 398 aa-2.69□□□□□ -2.84
RNU6-1024P-201ENST00000384199 PHTF2Q8N3S3 785 aa-2.69□□□□□ -2.84
RNU6-1024P-201ENST00000384199 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa-2.69□□□□□ -2.84
RNU6-1024P-201ENST00000384199 RNF169Q8NCN4 708 aa-2.69□□□□□ -2.84
RNU6-1024P-201ENST00000384199 SLC24A4Q8NFF2 622 aa-2.69□□□□□ -2.84
RNU6-1024P-201ENST00000384199 OR2L8Q8NGY9 312 aa-2.69□□□□□ -2.84
RNU6-1024P-201ENST00000384199 MRGPRDQ8TDS7 321 aa-2.69□□□□□ -2.84
RNU6-1024P-201ENST00000384199 TFAP2CQ92754 450 aa-2.69□□□□□ -2.84
RNU6-1024P-201ENST00000384199 CCDC74AQ96AQ1 378 aa-2.69□□□□□ -2.84
RNU6-1024P-201ENST00000384199 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP-2.69□□□□□ -2.84
RNU6-1024P-201ENST00000384199 PRAM1Q96QH2 718 aa-2.69□□□□□ -2.84
RNU6-1024P-201ENST00000384199 SNX18Q96RF0 628 aa-2.69□□□□□ -2.84
RNU6-1024P-201ENST00000384199 DSCC1Q9BVC3 393 aa-2.69□□□□□ -2.84
RNU6-1024P-201ENST00000384199 SCNM1Q9BWG6 230 aa-2.69□□□□□ -2.84
RNU6-1024P-201ENST00000384199 UBQLN3Q9H347 655 aa-2.69□□□□□ -2.84
RNU6-1024P-201ENST00000384199 SMOC1Q9H4F8 434 aa-2.69□□□□□ -2.84
RNU6-1024P-201ENST00000384199 ABCF3Q9NUQ8 709 aa-2.69□□□□□ -2.84
RNU6-1024P-201ENST00000384199 BTG4Q9NY30 223 aa-2.69□□□□□ -2.84
RNU6-1024P-201ENST00000384199 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP-2.69□□□□□ -2.84
RNU6-1024P-201ENST00000384199 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP-2.69□□□□□ -2.84
RNU6-1024P-201ENST00000384199 ERVW-1Q9UQF0 538 aa-2.69□□□□□ -2.84
RNU6-1024P-201ENST00000384199 EFR3BQ9Y2G0 817 aa-2.69□□□□□ -2.84
RNU6-1024P-201ENST00000384199 C22orf24Q9Y442 160 aa-2.69□□□□□ -2.84
RNU6-1024P-201ENST00000384199 PI4KAP42356 2102 aa-2.69□□□□□ -2.84
RNU6-1024P-201ENST00000384199 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP-2.69□□□□□ -2.84
RNU6-1024P-201ENST00000384199 RNF123Q5XPI4 1314 aa-2.69□□□□□ -2.84
RNU6-1024P-201ENST00000384199 SALL1Q9NSC2 1324 aa-2.69□□□□□ -2.84
RNU6-1024P-201ENST00000384199 CUBNO60494 3623 aa-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-1024P-201ENST00000384199 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-1024P-201ENST00000384199 CADP27708 2225 aa-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-1024P-201ENST00000384199 CCDC168Q8NDH2 2452 aa-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-1024P-201ENST00000384199 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-1024P-201ENST00000384199 FAM90A27PA6NNH2 459 aa-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-1024P-201ENST00000384199 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-1024P-201ENST00000384199 NRP1O14786 923 aa-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-1024P-201ENST00000384199 MTSS1O43312 755 aa-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-1024P-201ENST00000384199 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-1024P-201ENST00000384199 IGHG3P01860 377 aa-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-1024P-201ENST00000384199 ACADLP28330 430 aa-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-1024P-201ENST00000384199 MAP2K2P36507 400 aa-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-1024P-201ENST00000384199 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-1024P-201ENST00000384199 RAG2P55895 527 aa-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-1024P-201ENST00000384199 PRDX4Q13162 271 aa-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-1024P-201ENST00000384199 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-1024P-201ENST00000384199 ZNF234Q14588 700 aa-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-1024P-201ENST00000384199 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-1024P-201ENST00000384199 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-1024P-201ENST00000384199 RAET1GQ6H3X3 334 aa-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-1024P-201ENST00000384199 PARM1Q6UWI2 310 aa-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-1024P-201ENST00000384199 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-1024P-201ENST00000384199 RANBP10Q6VN20 620 aa-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-1024P-201ENST00000384199 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-1024P-201ENST00000384199 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-1024P-201ENST00000384199 CARM1Q86X55 608 aa-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-1024P-201ENST00000384199 PALB2Q86YC2 1186 aa-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-1024P-201ENST00000384199 KIAA0825Q8IV33 1275 aa-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-1024P-201ENST00000384199 CCDC36Q8IYA8 594 aa-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-1024P-201ENST00000384199 ZNF645Q8N7E2 425 aa-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-1024P-201ENST00000384199 MCPH1Q8NEM0 835 aa-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-1024P-201ENST00000384199 MIPOL1Q8TD10 442 aa-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-1024P-201ENST00000384199 TMEM174Q8WUU8 243 aa-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-1024P-201ENST00000384199 SLC17A9Q9BYT1 436 aa-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-1024P-201ENST00000384199 TBC1D2Q9BYX2 928 aa-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-1024P-201ENST00000384199 ENKD1Q9H0I2 346 aa-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-1024P-201ENST00000384199 LRWD1Q9UFC0 647 aa-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-1024P-201ENST00000384199 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-1024P-201ENST00000384199 CHIC2Q9UKJ5 165 aa-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-1024P-201ENST00000384199 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-1024P-201ENST00000384199 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-1024P-201ENST00000384199 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-1024P-201ENST00000384199 ITPR1Q14643 2758 aa-2.71□□□□□ -2.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.6 ms