RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000630659.2

BBS1-225, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 5 BASIC

Gene BBS1, Length 1,934 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-225	ENST00000630659	BEST1	O76090	585 aa		15.61	■□□□□ 0.09
BBS1-225	ENST00000630659	ENDOD1	O94919	500 aa		15.61	■□□□□ 0.09
BBS1-225	ENST00000630659	RAG1	P15918	1043 aa		15.61	■□□□□ 0.09
BBS1-225	ENST00000630659	BRCC3	P46736	316 aa		15.61	■□□□□ 0.09
BBS1-225	ENST00000630659	GPX6	P59796	221 aa		15.61	■□□□□ 0.09
BBS1-225	ENST00000630659	BFSP2	Q13515	415 aa		15.61	■□□□□ 0.09
BBS1-225	ENST00000630659	FASTKD3	Q14CZ7	662 aa	Known RBP	15.61	■□□□□ 0.09
BBS1-225	ENST00000630659	SCYL2	Q6P3W7	929 aa		15.61	■□□□□ 0.09
BBS1-225	ENST00000630659	CLEC20A	Q6ZU45	233 aa		15.61	■□□□□ 0.09
BBS1-225	ENST00000630659	KBTBD6	Q86V97	674 aa		15.61	■□□□□ 0.09
BBS1-225	ENST00000630659	KCNK16	Q96T55	309 aa		15.61	■□□□□ 0.09
BBS1-225	ENST00000630659	FTHL17	Q9BXU8	183 aa		15.61	■□□□□ 0.09
BBS1-225	ENST00000630659	FRMD8P1	Q9BZ68	369 aa	Predicted RBP	15.61	■□□□□ 0.09
BBS1-225	ENST00000630659	INIP	Q9NRY2	104 aa		15.61	■□□□□ 0.09
BBS1-225	ENST00000630659	DSE	Q9UL01	958 aa		15.61	■□□□□ 0.09
BBS1-225	ENST00000630659	TMEM98	Q9Y2Y6	226 aa		15.61	■□□□□ 0.09
BBS1-225	ENST00000630659		M0QZQ0	153 aa		15.6	■□□□□ 0.09
BBS1-225	ENST00000630659	CST8	O60676	142 aa		15.6	■□□□□ 0.09
BBS1-225	ENST00000630659	CLASP2	O75122	1294 aa	Known RBP	15.6	■□□□□ 0.09
BBS1-225	ENST00000630659	ITGAV	P06756	1048 aa		15.6	■□□□□ 0.09
BBS1-225	ENST00000630659	SRGAP2B	P0DMP2	458 aa		15.6	■□□□□ 0.09
BBS1-225	ENST00000630659	ZNF23	P17027	643 aa		15.6	■□□□□ 0.09
BBS1-225	ENST00000630659	VCP	P55072	806 aa	Known RBP	15.6	■□□□□ 0.09
BBS1-225	ENST00000630659	ADIG	Q0VDE8	80 aa		15.6	■□□□□ 0.09
BBS1-225	ENST00000630659	LRRC36	Q1X8D7	754 aa		15.6	■□□□□ 0.09
BBS1-225	ENST00000630659	PAN2	Q504Q3	1202 aa	Known RBP	15.6	■□□□□ 0.09
BBS1-225	ENST00000630659	POTEH	Q6S545	545 aa		15.6	■□□□□ 0.09
BBS1-225	ENST00000630659	FAM35A	Q86V20	835 aa		15.6	■□□□□ 0.09
BBS1-225	ENST00000630659	RFX6	Q8HWS3	928 aa		15.6	■□□□□ 0.09
BBS1-225	ENST00000630659	FAM126B	Q8IXS8	530 aa		15.6	■□□□□ 0.09
BBS1-225	ENST00000630659	PPIL6	Q8IXY8	311 aa		15.6	■□□□□ 0.09
BBS1-225	ENST00000630659	PQLC1	Q8N2U9	271 aa		15.6	■□□□□ 0.09
BBS1-225	ENST00000630659	SLC25A41	Q8N5S1	370 aa		15.6	■□□□□ 0.09
BBS1-225	ENST00000630659	FBXO27	Q8NI29	283 aa		15.6	■□□□□ 0.09
BBS1-225	ENST00000630659	CENPI	Q92674	756 aa	Predicted RBP	15.6	■□□□□ 0.09
BBS1-225	ENST00000630659	NKD2	Q969F2	451 aa	Predicted RBP	15.6	■□□□□ 0.09
BBS1-225	ENST00000630659	HSPBAP1	Q96EW2	488 aa		15.6	■□□□□ 0.09
BBS1-225	ENST00000630659	FAM111A	Q96PZ2	611 aa		15.6	■□□□□ 0.09
BBS1-225	ENST00000630659	TBCB	Q99426	244 aa		15.6	■□□□□ 0.09
BBS1-225	ENST00000630659	CCT7	Q99832	543 aa		15.6	■□□□□ 0.09
BBS1-225	ENST00000630659	KLC2	Q9H0B6	622 aa		15.6	■□□□□ 0.09
BBS1-225	ENST00000630659	LRRC4	Q9HBW1	653 aa		15.6	■□□□□ 0.09
BBS1-225	ENST00000630659	STAU2	Q9NUL3	570 aa	Known RBP eCLIP	15.6	■□□□□ 0.09
BBS1-225	ENST00000630659	FASTKD2	Q9NYY8	710 aa	Known RBP eCLIP	15.6	■□□□□ 0.09
BBS1-225	ENST00000630659	UBAP1	Q9NZ09	502 aa		15.6	■□□□□ 0.09
BBS1-225	ENST00000630659	CDH22	Q9UJ99	828 aa		15.6	■□□□□ 0.09
BBS1-225	ENST00000630659	CLUH	O75153	1309 aa		15.6	■□□□□ 0.09
BBS1-225	ENST00000630659	ARHGEF37	A1IGU5	675 aa		15.6	■□□□□ 0.09
BBS1-225	ENST00000630659	EIF2S1	P05198	315 aa	Known RBP	15.6	■□□□□ 0.09
BBS1-225	ENST00000630659	PRDX6	P30041	224 aa		15.6	■□□□□ 0.09
BBS1-225	ENST00000630659	CDH6	P55285	790 aa		15.6	■□□□□ 0.09
BBS1-225	ENST00000630659	MAP3K7CL	P57077	242 aa		15.6	■□□□□ 0.09
BBS1-225	ENST00000630659	DYNLT1	P63172	113 aa		15.6	■□□□□ 0.09
BBS1-225	ENST00000630659	RELA	Q04206	551 aa		15.6	■□□□□ 0.09
BBS1-225	ENST00000630659	PDK2	Q15119	407 aa		15.6	■□□□□ 0.09
BBS1-225	ENST00000630659	BCL2A1	Q16548	175 aa		15.6	■□□□□ 0.09
BBS1-225	ENST00000630659	RABGAP1L	Q5R372	815 aa		15.6	■□□□□ 0.09
BBS1-225	ENST00000630659	TMEM53	Q6P2H8	277 aa		15.6	■□□□□ 0.09
BBS1-225	ENST00000630659	RNF111	Q6ZNA4	994 aa		15.6	■□□□□ 0.09
BBS1-225	ENST00000630659	SLC15A3	Q8IY34	581 aa		15.6	■□□□□ 0.09
BBS1-225	ENST00000630659	SCAI	Q8N9R8	606 aa		15.6	■□□□□ 0.09
BBS1-225	ENST00000630659	URGCP	Q8TCY9	931 aa		15.6	■□□□□ 0.09
BBS1-225	ENST00000630659	E2F7	Q96AV8	911 aa		15.6	■□□□□ 0.09
BBS1-225	ENST00000630659	CMTM5	Q96DZ9	223 aa		15.6	■□□□□ 0.09
BBS1-225	ENST00000630659	PCED1B	Q96HM7	432 aa		15.6	■□□□□ 0.09
BBS1-225	ENST00000630659	RTP3	Q9BQQ7	232 aa		15.6	■□□□□ 0.09
BBS1-225	ENST00000630659	ACBD6	Q9BR61	282 aa		15.6	■□□□□ 0.09
BBS1-225	ENST00000630659	C11orf84	Q9BUA3	381 aa	Predicted RBP	15.6	■□□□□ 0.09
BBS1-225	ENST00000630659	CALN1	Q9BXU9	219 aa		15.6	■□□□□ 0.09
BBS1-225	ENST00000630659	NRDE2	Q9H7Z3	1164 aa		15.6	■□□□□ 0.09
BBS1-225	ENST00000630659	PALMD	Q9NP74	551 aa		15.6	■□□□□ 0.09
BBS1-225	ENST00000630659	RRN3	Q9NYV6	651 aa		15.6	■□□□□ 0.09
BBS1-225	ENST00000630659	CNOT11	Q9UKZ1	510 aa	Known RBP	15.6	■□□□□ 0.09
BBS1-225	ENST00000630659	DNAH12	Q6ZR08	3092 aa		15.59	■□□□□ 0.09
BBS1-225	ENST00000630659	SDR42E2	A6NKP2	422 aa		15.59	■□□□□ 0.09
BBS1-225	ENST00000630659		H0YJX3	145 aa		15.59	■□□□□ 0.09
BBS1-225	ENST00000630659	COPE	O14579	308 aa		15.59	■□□□□ 0.09
BBS1-225	ENST00000630659	ITM2A	O43736	263 aa		15.59	■□□□□ 0.09
BBS1-225	ENST00000630659	HAL	P42357	657 aa		15.59	■□□□□ 0.09
BBS1-225	ENST00000630659	TUBA4A	P68366	448 aa		15.59	■□□□□ 0.09
BBS1-225	ENST00000630659	MRPS5	P82675	430 aa	Known RBP	15.59	■□□□□ 0.09
BBS1-225	ENST00000630659	OASL	Q15646	514 aa	Known RBP	15.59	■□□□□ 0.09
BBS1-225	ENST00000630659	NOMO2	Q5JPE7	1267 aa		15.59	■□□□□ 0.09
BBS1-225	ENST00000630659	CLLU1OS	Q5K130	101 aa		15.59	■□□□□ 0.09
BBS1-225	ENST00000630659	SIX6OS1	Q8N1H7	587 aa		15.59	■□□□□ 0.09
BBS1-225	ENST00000630659	SLC35B2	Q8TB61	432 aa		15.59	■□□□□ 0.09
BBS1-225	ENST00000630659	HASPIN	Q8TF76	798 aa		15.59	■□□□□ 0.09
BBS1-225	ENST00000630659	SUSD3	Q96L08	255 aa		15.59	■□□□□ 0.09
BBS1-225	ENST00000630659	GCNA	Q96QF7	691 aa		15.59	■□□□□ 0.09
BBS1-225	ENST00000630659	SMO	Q99835	787 aa		15.59	■□□□□ 0.09
BBS1-225	ENST00000630659	NUF2	Q9BZD4	464 aa		15.59	■□□□□ 0.09
BBS1-225	ENST00000630659	PAK6	Q9NQU5	681 aa	Predicted RBP	15.59	■□□□□ 0.09
BBS1-225	ENST00000630659	SCHIP1	Q9P0W5	487 aa	Predicted RBP	15.59	■□□□□ 0.09
BBS1-225	ENST00000630659	SIRPG	Q9P1W8	387 aa		15.59	■□□□□ 0.09
BBS1-225	ENST00000630659	IGSF9	Q9P2J2	1179 aa		15.59	■□□□□ 0.09
BBS1-225	ENST00000630659	FARP1	Q9Y4F1	1045 aa	Predicted RBP	15.59	■□□□□ 0.09
BBS1-225	ENST00000630659	AP4B1	Q9Y6B7	739 aa		15.59	■□□□□ 0.09
BBS1-225	ENST00000630659	CENPF	P49454	3210 aa		15.59	■□□□□ 0.09
BBS1-225	ENST00000630659	PRR5-ARHGAP8	B1AHC4	643 aa		15.58	■□□□□ 0.09
BBS1-225	ENST00000630659	MDM4	O15151	490 aa		15.58	■□□□□ 0.09

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