RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613122.4

CTDP1-208, Transcript of CTD phosphatase subunit 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDP1, Length 5,866 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDP1-208ENST00000613122 TCP10LQ8TDR4 215 aa20.46■□□□□ 0.87
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CTDP1-208ENST00000613122 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
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CTDP1-208ENST00000613122 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
CTDP1-208ENST00000613122 TUSC3Q13454 348 aa20.46■□□□□ 0.87
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CTDP1-208ENST00000613122 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa20.44■□□□□ 0.86
CTDP1-208ENST00000613122 UMPSP11172 480 aa20.44■□□□□ 0.86
CTDP1-208ENST00000613122 PSMC3P17980 439 aa20.44■□□□□ 0.86
CTDP1-208ENST00000613122 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
CTDP1-208ENST00000613122 CDK16Q00536 496 aa20.44■□□□□ 0.86
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CTDP1-208ENST00000613122 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
CTDP1-208ENST00000613122 GPR152Q8TDT2 470 aa20.44■□□□□ 0.86
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CTDP1-208ENST00000613122 CHST7Q9NS84 486 aa20.44■□□□□ 0.86
CTDP1-208ENST00000613122 ZNF541Q9H0D2 1346 aa20.44■□□□□ 0.86
CTDP1-208ENST00000613122 CYP1A2P05177 515 aa20.44■□□□□ 0.86
CTDP1-208ENST00000613122 SLURP2P0DP57 97 aa20.44■□□□□ 0.86
CTDP1-208ENST00000613122 EEF1DP3Q658K8 133 aa20.44■□□□□ 0.86
CTDP1-208ENST00000613122 MAB21L3Q8N8X9 362 aa20.44■□□□□ 0.86
CTDP1-208ENST00000613122 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
CTDP1-208ENST00000613122 NACC2Q96BF6 587 aa20.44■□□□□ 0.86
CTDP1-208ENST00000613122 SYT17Q9BSW7 474 aa20.44■□□□□ 0.86
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