RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589528.1

ACTN4-211, Transcript of actinin alpha 4, humanhuman

TSL 2

Gene ACTN4, Length 441 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN4-211ENST00000589528 TAS2R38P59533 333 aa15.62■□□□□ 0.09
ACTN4-211ENST00000589528 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP15.62■□□□□ 0.091e-6■■■■□ 22.6
ACTN4-211ENST00000589528 GCNT1Q02742 428 aa15.62■□□□□ 0.09
ACTN4-211ENST00000589528 COBLL1Q53SF7 1204 aa15.62■□□□□ 0.09
ACTN4-211ENST00000589528 ZNF542PQ5EBM4 170 aa15.62■□□□□ 0.09
ACTN4-211ENST00000589528 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa15.62■□□□□ 0.09
ACTN4-211ENST00000589528 FBXL22Q6P050 247 aa15.62■□□□□ 0.09
ACTN4-211ENST00000589528 DENND1BQ6P3S1 775 aa15.62■□□□□ 0.09
ACTN4-211ENST00000589528 FAM181AQ8N9Y4 354 aa15.62■□□□□ 0.09
ACTN4-211ENST00000589528 ATP11CQ8NB49 1132 aa15.62■□□□□ 0.09
ACTN4-211ENST00000589528 IFI44Q8TCB0 444 aa15.62■□□□□ 0.09
ACTN4-211ENST00000589528 STK32AQ8WU08 396 aa15.62■□□□□ 0.09
ACTN4-211ENST00000589528 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
ACTN4-211ENST00000589528 GSDMAQ96QA5 445 aa15.62■□□□□ 0.09
ACTN4-211ENST00000589528 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
ACTN4-211ENST00000589528 CLMPQ9H6B4 373 aa15.62■□□□□ 0.09
ACTN4-211ENST00000589528 WDR70Q9NW82 654 aa15.62■□□□□ 0.09
ACTN4-211ENST00000589528 VANGL2Q9ULK5 521 aa15.62■□□□□ 0.09
ACTN4-211ENST00000589528 SATB2Q9UPW6 733 aa15.62■□□□□ 0.09
ACTN4-211ENST00000589528 RP1P56715 2156 aa15.62■□□□□ 0.09
ACTN4-211ENST00000589528 PSMA7O14818 248 aa15.61■□□□□ 0.09
ACTN4-211ENST00000589528 PMM2O15305 246 aa15.61■□□□□ 0.09
ACTN4-211ENST00000589528 P4HA2O15460 535 aa15.61■□□□□ 0.09
ACTN4-211ENST00000589528 THAP12O43422 761 aa15.61■□□□□ 0.09
ACTN4-211ENST00000589528 CLDN11O75508 207 aa15.61■□□□□ 0.09
ACTN4-211ENST00000589528 NEBLO76041 1014 aa15.61■□□□□ 0.09
ACTN4-211ENST00000589528 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
ACTN4-211ENST00000589528 IGLV3-25P01717 112 aa15.61■□□□□ 0.09
ACTN4-211ENST00000589528 PRNPP04156 253 aa15.61■□□□□ 0.09
ACTN4-211ENST00000589528 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
ACTN4-211ENST00000589528 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
ACTN4-211ENST00000589528 MTA1Q13330 715 aa15.61■□□□□ 0.09
ACTN4-211ENST00000589528 AUHQ13825 339 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
ACTN4-211ENST00000589528 ZNF284Q2VY69 593 aa15.61■□□□□ 0.09
ACTN4-211ENST00000589528 FOXR1Q6PIV2 292 aa15.61■□□□□ 0.09
ACTN4-211ENST00000589528 Q6ZSR6 202 aa15.61■□□□□ 0.09
ACTN4-211ENST00000589528 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
ACTN4-211ENST00000589528 ARHGEF19Q8IW93 802 aa15.61■□□□□ 0.09
ACTN4-211ENST00000589528 FAM174AQ8TBP5 190 aa15.61■□□□□ 0.09
ACTN4-211ENST00000589528 IFT43Q96FT9 208 aa15.61■□□□□ 0.09
ACTN4-211ENST00000589528 PPP1R16AQ96I34 528 aa15.61■□□□□ 0.09
ACTN4-211ENST00000589528 CEP63Q96MT8 703 aa15.61■□□□□ 0.09
ACTN4-211ENST00000589528 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP15.61■□□□□ 0.09
ACTN4-211ENST00000589528 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
ACTN4-211ENST00000589528 SLC4A5Q9BY07 1137 aa15.61■□□□□ 0.09
ACTN4-211ENST00000589528 SEMA4CQ9C0C4 833 aa15.61■□□□□ 0.09
ACTN4-211ENST00000589528 ASCL3Q9NQ33 180 aa15.61■□□□□ 0.09
ACTN4-211ENST00000589528 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa15.61■□□□□ 0.09
ACTN4-211ENST00000589528 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
ACTN4-211ENST00000589528 CPED1A4D0V7 1026 aa15.6■□□□□ 0.09
ACTN4-211ENST00000589528 K7ESM1 405 aa15.6■□□□□ 0.09
ACTN4-211ENST00000589528 CTSLP07711 333 aa15.6■□□□□ 0.09
ACTN4-211ENST00000589528 SRCP12931 536 aa15.6■□□□□ 0.09
ACTN4-211ENST00000589528 KCNC4Q03721 635 aa15.6■□□□□ 0.09
ACTN4-211ENST00000589528 NME3Q13232 169 aa15.6■□□□□ 0.09
ACTN4-211ENST00000589528 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
ACTN4-211ENST00000589528 CDKN3Q16667 212 aa15.6■□□□□ 0.09
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ACTN4-211ENST00000589528 OR6B2Q6IFH4 312 aa15.6■□□□□ 0.09
ACTN4-211ENST00000589528 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
ACTN4-211ENST00000589528 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
ACTN4-211ENST00000589528 TMEM110Q86TL2 294 aa15.6■□□□□ 0.09
ACTN4-211ENST00000589528 TMIEQ8NEW7 156 aa15.6■□□□□ 0.09
ACTN4-211ENST00000589528 OR52K2Q8NGK3 314 aa15.6■□□□□ 0.09
ACTN4-211ENST00000589528 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa15.6■□□□□ 0.09
ACTN4-211ENST00000589528 SMARCE1Q969G3 411 aa15.6■□□□□ 0.09
ACTN4-211ENST00000589528 ALG14Q96F25 216 aa15.6■□□□□ 0.09
ACTN4-211ENST00000589528 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
ACTN4-211ENST00000589528 HS3ST2Q9Y278 367 aa15.6■□□□□ 0.09
ACTN4-211ENST00000589528 MYO18BQ8IUG5 2567 aa15.59■□□□□ 0.09
ACTN4-211ENST00000589528 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa15.59■□□□□ 0.09
ACTN4-211ENST00000589528 SLC28A2O43868 658 aa15.59■□□□□ 0.09
ACTN4-211ENST00000589528 RHOCP08134 193 aa15.59■□□□□ 0.09
ACTN4-211ENST00000589528 GNA15P30679 374 aa15.59■□□□□ 0.09
ACTN4-211ENST00000589528 GGCXP38435 758 aa15.59■□□□□ 0.09
ACTN4-211ENST00000589528 CDH4P55283 916 aa15.59■□□□□ 0.09
ACTN4-211ENST00000589528 TAF5Q15542 800 aa15.59■□□□□ 0.09
ACTN4-211ENST00000589528 MEA1Q16626 185 aa15.59■□□□□ 0.09
ACTN4-211ENST00000589528 EFHC1Q5JVL4 640 aa15.59■□□□□ 0.09
ACTN4-211ENST00000589528 SEL1L3Q68CR1 1132 aa15.59■□□□□ 0.09
ACTN4-211ENST00000589528 CCDC81Q6ZN84 652 aa15.59■□□□□ 0.09
ACTN4-211ENST00000589528 GCNT7Q6ZNI0 430 aa15.59■□□□□ 0.09
ACTN4-211ENST00000589528 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa15.59■□□□□ 0.09
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ACTN4-211ENST00000589528 DEFB106AQ8N104 65 aa15.59■□□□□ 0.09
ACTN4-211ENST00000589528 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa15.59■□□□□ 0.09
ACTN4-211ENST00000589528 EHBP1Q8NDI1 1231 aa15.59■□□□□ 0.09
ACTN4-211ENST00000589528 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
ACTN4-211ENST00000589528 LMO3Q8TAP4 145 aa15.59■□□□□ 0.09
ACTN4-211ENST00000589528 TTC9Q92623 222 aa15.59■□□□□ 0.09
ACTN4-211ENST00000589528 ARRDC3Q96B67 414 aa15.59■□□□□ 0.09
ACTN4-211ENST00000589528 GRAMD1AQ96CP6 724 aa15.59■□□□□ 0.09
ACTN4-211ENST00000589528 NOX5Q96PH1 765 aa15.59■□□□□ 0.09
ACTN4-211ENST00000589528 SIK2Q9H0K1 926 aa15.59■□□□□ 0.09
ACTN4-211ENST00000589528 IL36AQ9UHA7 158 aa15.59■□□□□ 0.09
ACTN4-211ENST00000589528 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
ACTN4-211ENST00000589528 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
ACTN4-211ENST00000589528 HS3ST4Q9Y661 456 aa15.59■□□□□ 0.09
ACTN4-211ENST00000589528 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa15.58■□□□□ 0.08
ACTN4-211ENST00000589528 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa15.58■□□□□ 0.08
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