RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516224.1

RNU6-311P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 311, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-311P, Length 102 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-311P-201ENST00000516224 SCAIQ8N9R8 606 aa5.02□□□□□ -1.61
RNU6-311P-201ENST00000516224 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP5.02□□□□□ -1.61
RNU6-311P-201ENST00000516224 FAR1Q8WVX9 515 aa5.02□□□□□ -1.61
RNU6-311P-201ENST00000516224 MARK4Q96L34 752 aa5.02□□□□□ -1.61
RNU6-311P-201ENST00000516224 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP5.02□□□□□ -1.61
RNU6-311P-201ENST00000516224 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP5.02□□□□□ -1.61
RNU6-311P-201ENST00000516224 HDAC6Q9UBN7 1215 aa5.02□□□□□ -1.61
RNU6-311P-201ENST00000516224 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP5.02□□□□□ -1.61
RNU6-311P-201ENST00000516224 ICKQ9UPZ9 632 aa5.02□□□□□ -1.61
RNU6-311P-201ENST00000516224 DERAQ9Y315 318 aa5.02□□□□□ -1.61
RNU6-311P-201ENST00000516224 MST1RQ04912 1400 aa5.02□□□□□ -1.61
RNU6-311P-201ENST00000516224 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa5.01□□□□□ -1.61
RNU6-311P-201ENST00000516224 STX16O14662 325 aa5.01□□□□□ -1.61
RNU6-311P-201ENST00000516224 PIP5K1CO60331 668 aa5.01□□□□□ -1.61
RNU6-311P-201ENST00000516224 CHRNB2P17787 502 aa5.01□□□□□ -1.61
RNU6-311P-201ENST00000516224 MTNR1AP48039 350 aa5.01□□□□□ -1.61
RNU6-311P-201ENST00000516224 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP5.01□□□□□ -1.61
RNU6-311P-201ENST00000516224 TRAF1Q13077 416 aa5.01□□□□□ -1.61
RNU6-311P-201ENST00000516224 DUSP6Q16828 381 aa5.01□□□□□ -1.61
RNU6-311P-201ENST00000516224 MASTLQ96GX5 879 aa5.01□□□□□ -1.61
RNU6-311P-201ENST00000516224 LYZL4Q96KX0 146 aa5.01□□□□□ -1.61
RNU6-311P-201ENST00000516224 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
RNU6-311P-201ENST00000516224 KLHL31Q9H511 634 aa5.01□□□□□ -1.61
RNU6-311P-201ENST00000516224 ITM2CQ9NQX7 267 aa5.01□□□□□ -1.61
RNU6-311P-201ENST00000516224 RASSF1Q9NS23 344 aa5.01□□□□□ -1.61
RNU6-311P-201ENST00000516224 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa5.01□□□□□ -1.61
RNU6-311P-201ENST00000516224 INSL5Q9Y5Q6 135 aa5.01□□□□□ -1.61
RNU6-311P-201ENST00000516224 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP5.01□□□□□ -1.61
RNU6-311P-201ENST00000516224 BECN2A8MW95 431 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-311P-201ENST00000516224 I6L893 689 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
RNU6-311P-201ENST00000516224 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
RNU6-311P-201ENST00000516224 LCATP04180 440 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-311P-201ENST00000516224 ARSBP15848 533 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-311P-201ENST00000516224 ARL4CP56559 192 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-311P-201ENST00000516224 TMPRSS3P57727 454 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-311P-201ENST00000516224 ARHGAP8P85298 464 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-311P-201ENST00000516224 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
RNU6-311P-201ENST00000516224 AP5B1Q2VPB7 878 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-311P-201ENST00000516224 ADCK5Q3MIX3 580 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-311P-201ENST00000516224 CBWD5Q5RIA9 395 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-311P-201ENST00000516224 TBC1D9BQ66K14 1250 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-311P-201ENST00000516224 WDR5BQ86VZ2 330 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-311P-201ENST00000516224 CAMK1DQ8IU85 385 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-311P-201ENST00000516224 TMEM57Q8N5G2 664 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-311P-201ENST00000516224 SPATA5Q8NB90 893 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-311P-201ENST00000516224 BICD2Q8TD16 824 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-311P-201ENST00000516224 OIT3Q8WWZ8 545 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-311P-201ENST00000516224 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
RNU6-311P-201ENST00000516224 ISCA1Q9BUE6 129 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-311P-201ENST00000516224 IFT27Q9BW83 186 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-311P-201ENST00000516224 CTDSP1Q9GZU7 261 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-311P-201ENST00000516224 PLAC1Q9HBJ0 212 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-311P-201ENST00000516224 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
RNU6-311P-201ENST00000516224 CD207Q9UJ71 328 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-311P-201ENST00000516224 CDH22Q9UJ99 828 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-311P-201ENST00000516224 RAP2CQ9Y3L5 183 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-311P-201ENST00000516224 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-311P-201ENST00000516224 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
RNU6-311P-201ENST00000516224 STMND1H3BQB6 276 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-311P-201ENST00000516224 RXRAP19793 462 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-311P-201ENST00000516224 CCKARP32238 428 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-311P-201ENST00000516224 GJC1P36383 396 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-311P-201ENST00000516224 HALP42357 657 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-311P-201ENST00000516224 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
RNU6-311P-201ENST00000516224 CLCNKBP51801 687 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-311P-201ENST00000516224 CTXN3Q4LDR2 81 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-311P-201ENST00000516224 SH2D4BQ5SQS7 431 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-311P-201ENST00000516224 TMEM268Q5VZI3 342 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-311P-201ENST00000516224 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-311P-201ENST00000516224 Q6ZTK2 550 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-311P-201ENST00000516224 HORMAD2Q8N7B1 307 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-311P-201ENST00000516224 CEP70Q8NHQ1 597 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-311P-201ENST00000516224 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
RNU6-311P-201ENST00000516224 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
RNU6-311P-201ENST00000516224 PCDHA7Q9UN72 937 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-311P-201ENST00000516224 RAI2Q9Y5P3 530 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-311P-201ENST00000516224 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU6-311P-201ENST00000516224 SAC3D1A6NKF1 404 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU6-311P-201ENST00000516224 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP4.98□□□□□ -1.61
RNU6-311P-201ENST00000516224 HSPB6O14558 160 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU6-311P-201ENST00000516224 RNMTO43148 476 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
RNU6-311P-201ENST00000516224 IRAK2O43187 625 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU6-311P-201ENST00000516224 RGS14O43566 566 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU6-311P-201ENST00000516224 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
RNU6-311P-201ENST00000516224 CYP1A2P05177 515 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU6-311P-201ENST00000516224 TNNT1P13805 278 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU6-311P-201ENST00000516224 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP4.98□□□□□ -1.61
RNU6-311P-201ENST00000516224 AVPR1AP37288 418 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU6-311P-201ENST00000516224 PPP3CCP48454 512 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU6-311P-201ENST00000516224 GPR18Q14330 331 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU6-311P-201ENST00000516224 IL13RA2Q14627 380 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU6-311P-201ENST00000516224 DCAF12L2Q5VW00 463 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU6-311P-201ENST00000516224 DENND1BQ6P3S1 775 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU6-311P-201ENST00000516224 GJB7Q6PEY0 223 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU6-311P-201ENST00000516224 SETD9Q8NE22 299 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU6-311P-201ENST00000516224 MIB2Q96AX9 1013 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU6-311P-201ENST00000516224 RNFT2Q96EX2 444 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU6-311P-201ENST00000516224 HERPUD2Q9BSE4 406 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU6-311P-201ENST00000516224 GRHL1Q9NZI5 618 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU6-311P-201ENST00000516224 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa4.98□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.7 ms