RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513325.5

HERC3-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-211ENST00000513325 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP17.33■□□□□ 0.36
HERC3-211ENST00000513325 PES1O00541 588 aaKnown RBP17.33■□□□□ 0.36
HERC3-211ENST00000513325 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP17.33■□□□□ 0.36
HERC3-211ENST00000513325 MAGEC1O60732 1142 aa17.33■□□□□ 0.36
HERC3-211ENST00000513325 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP17.33■□□□□ 0.36
HERC3-211ENST00000513325 RFPL3O75679 317 aa17.33■□□□□ 0.36
HERC3-211ENST00000513325 F9P00740 461 aa17.33■□□□□ 0.36
HERC3-211ENST00000513325 RRM1P23921 792 aa17.33■□□□□ 0.36
HERC3-211ENST00000513325 CHRNA3P32297 505 aa17.33■□□□□ 0.36
HERC3-211ENST00000513325 ACADVLP49748 655 aa17.33■□□□□ 0.36
HERC3-211ENST00000513325 OVGP1Q12889 678 aa17.33■□□□□ 0.36
HERC3-211ENST00000513325 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP17.33■□□□□ 0.36
HERC3-211ENST00000513325 SLC25A52Q3SY17 297 aa17.33■□□□□ 0.36
HERC3-211ENST00000513325 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa17.33■□□□□ 0.36
HERC3-211ENST00000513325 SFMBT2Q5VUG0 894 aa17.33■□□□□ 0.36
HERC3-211ENST00000513325 LINGO4Q6UY18 593 aa17.33■□□□□ 0.36
HERC3-211ENST00000513325 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa17.33■□□□□ 0.36
HERC3-211ENST00000513325 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP17.33■□□□□ 0.36
HERC3-211ENST00000513325 PDZD3Q86UT5 571 aa17.33■□□□□ 0.36
HERC3-211ENST00000513325 IQCHQ86VS3 1027 aa17.33■□□□□ 0.36
HERC3-211ENST00000513325 C1orf74Q96LT6 269 aa17.33■□□□□ 0.36
HERC3-211ENST00000513325 CCDC114Q96M63 670 aa17.33■□□□□ 0.36
HERC3-211ENST00000513325 CLSTN2Q9H4D0 955 aa17.33■□□□□ 0.36
HERC3-211ENST00000513325 PREBQ9HCU5 417 aa17.33■□□□□ 0.36
HERC3-211ENST00000513325 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP17.33■□□□□ 0.36
HERC3-211ENST00000513325 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa17.33■□□□□ 0.36
HERC3-211ENST00000513325 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP17.33■□□□□ 0.36
HERC3-211ENST00000513325 DSPP15924 2871 aaKnown RBP17.33■□□□□ 0.36
HERC3-211ENST00000513325 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP17.32■□□□□ 0.36
HERC3-211ENST00000513325 GOLGA8SH3BPF8 625 aa17.32■□□□□ 0.36
HERC3-211ENST00000513325 RNF103O00237 685 aa17.32■□□□□ 0.36
HERC3-211ENST00000513325 SLC31A1O15431 190 aa17.32■□□□□ 0.36
HERC3-211ENST00000513325 SRGAP2O75044 1071 aa17.32■□□□□ 0.36
HERC3-211ENST00000513325 SDC3O75056 442 aa17.32■□□□□ 0.36
HERC3-211ENST00000513325 C1SP09871 688 aa17.32■□□□□ 0.36
HERC3-211ENST00000513325 JUPP14923 745 aa17.32■□□□□ 0.36
HERC3-211ENST00000513325 PRLRP16471 622 aa17.32■□□□□ 0.36
HERC3-211ENST00000513325 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP17.32■□□□□ 0.36
HERC3-211ENST00000513325 FLT3P36888 993 aa17.32■□□□□ 0.36
HERC3-211ENST00000513325 SCNN1AP37088 669 aa17.32■□□□□ 0.36
HERC3-211ENST00000513325 C6orf118Q5T5N4 469 aa17.32■□□□□ 0.36
HERC3-211ENST00000513325 DCAF4L2Q8NA75 395 aa17.32■□□□□ 0.36
HERC3-211ENST00000513325 CHST14Q8NCH0 376 aa17.32■□□□□ 0.36
HERC3-211ENST00000513325 TMIEQ8NEW7 156 aa17.32■□□□□ 0.36
HERC3-211ENST00000513325 TSC1Q92574 1164 aa17.32■□□□□ 0.36
HERC3-211ENST00000513325 KLK6Q92876 244 aa17.32■□□□□ 0.36
HERC3-211ENST00000513325 ARRDC3Q96B67 414 aa17.32■□□□□ 0.36
HERC3-211ENST00000513325 MYOCQ99972 504 aa17.32■□□□□ 0.36
HERC3-211ENST00000513325 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP17.32■□□□□ 0.36
HERC3-211ENST00000513325 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa17.31■□□□□ 0.36
HERC3-211ENST00000513325 A0A1W2PQU0 124 aa17.31■□□□□ 0.36
HERC3-211ENST00000513325 E9PAM4 449 aa17.31■□□□□ 0.36
HERC3-211ENST00000513325 CDK4P11802 303 aa17.31■□□□□ 0.36
HERC3-211ENST00000513325 UCHL3P15374 230 aa17.31■□□□□ 0.36
HERC3-211ENST00000513325 GLDCP23378 1020 aa17.31■□□□□ 0.36
HERC3-211ENST00000513325 OR1E1P30953 314 aa17.31■□□□□ 0.36
HERC3-211ENST00000513325 HNF1BP35680 557 aa17.31■□□□□ 0.36
HERC3-211ENST00000513325 ARTNQ5T4W7 220 aa17.31■□□□□ 0.36
HERC3-211ENST00000513325 TRNP1Q6NT89 227 aa17.31■□□□□ 0.36
HERC3-211ENST00000513325 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP17.31■□□□□ 0.36
HERC3-211ENST00000513325 TMEM145Q8NBT3 493 aa17.31■□□□□ 0.36
HERC3-211ENST00000513325 OR7D4Q8NG98 312 aa17.31■□□□□ 0.36
HERC3-211ENST00000513325 KLHDC7BQ96G42 594 aa17.31■□□□□ 0.36
HERC3-211ENST00000513325 TNKS2Q9H2K2 1166 aa17.31■□□□□ 0.36
HERC3-211ENST00000513325 SCUBE2Q9NQ36 999 aa17.31■□□□□ 0.36
HERC3-211ENST00000513325 DOCK9Q9BZ29 2069 aa17.31■□□□□ 0.36
HERC3-211ENST00000513325 APC2O95996 2303 aa17.3■□□□□ 0.36
HERC3-211ENST00000513325 ENDOD1O94919 500 aa17.3■□□□□ 0.36
HERC3-211ENST00000513325 PRNPP04156 253 aa17.3■□□□□ 0.36
HERC3-211ENST00000513325 MMEP08473 750 aa17.3■□□□□ 0.36
HERC3-211ENST00000513325 CLCN6P51797 869 aa17.3■□□□□ 0.36
HERC3-211ENST00000513325 CCDC15Q0P6D6 951 aa17.3■□□□□ 0.36
HERC3-211ENST00000513325 ARSIQ5FYB1 569 aa17.3■□□□□ 0.36
HERC3-211ENST00000513325 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP17.3■□□□□ 0.36
HERC3-211ENST00000513325 HES3Q5TGS1 186 aa17.3■□□□□ 0.36
HERC3-211ENST00000513325 NEK5Q6P3R8 708 aa17.3■□□□□ 0.36
HERC3-211ENST00000513325 C22orf39Q6P5X5 142 aa17.3■□□□□ 0.36
HERC3-211ENST00000513325 BNIPLQ7Z465 357 aa17.3■□□□□ 0.36
HERC3-211ENST00000513325 FAM131BQ86XD5 332 aa17.3■□□□□ 0.36
HERC3-211ENST00000513325 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa17.3■□□□□ 0.36
HERC3-211ENST00000513325 CPA5Q8WXQ8 436 aa17.3■□□□□ 0.36
HERC3-211ENST00000513325 CFAP57Q96MR6 1250 aa17.3■□□□□ 0.36
HERC3-211ENST00000513325 HAPLN3Q96S86 360 aa17.3■□□□□ 0.36
HERC3-211ENST00000513325 SPON2Q9BUD6 331 aa17.3■□□□□ 0.36
HERC3-211ENST00000513325 FZD3Q9NPG1 666 aa17.3■□□□□ 0.36
HERC3-211ENST00000513325 DYRK4Q9NR20 520 aa17.3■□□□□ 0.36
HERC3-211ENST00000513325 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP17.3■□□□□ 0.36
HERC3-211ENST00000513325 TMEM51Q9NW97 253 aa17.3■□□□□ 0.36
HERC3-211ENST00000513325 CHMP5Q9NZZ3 219 aa17.3■□□□□ 0.36
HERC3-211ENST00000513325 DACH1Q9UI36 760 aa17.3■□□□□ 0.36
HERC3-211ENST00000513325 TMEM59LQ9UK28 342 aa17.3■□□□□ 0.36
HERC3-211ENST00000513325 ACACAQ13085 2346 aa17.29■□□□□ 0.36
HERC3-211ENST00000513325 ILVBLA1L0T0 632 aa17.29■□□□□ 0.36
HERC3-211ENST00000513325 F8VZ95 297 aa17.29■□□□□ 0.36
HERC3-211ENST00000513325 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP17.29■□□□□ 0.36
HERC3-211ENST00000513325 PCDH8O95206 1070 aa17.29■□□□□ 0.36
HERC3-211ENST00000513325 LSM8O95777 96 aaKnown RBP17.29■□□□□ 0.36
HERC3-211ENST00000513325 THEGLP0DJG4 465 aa17.29■□□□□ 0.36
HERC3-211ENST00000513325 CKMT2P17540 419 aa17.29■□□□□ 0.36
HERC3-211ENST00000513325 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23 ms