RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485532.1

PRAME-212, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 709 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-212ENST00000485532 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP12.96□□□□□ -0.33
PRAME-212ENST00000485532 FKBP15Q5T1M5 1219 aa12.96□□□□□ -0.33
PRAME-212ENST00000485532 ARTNQ5T4W7 220 aa12.96□□□□□ -0.33
PRAME-212ENST00000485532 AGBL4Q5VU57 503 aa12.96□□□□□ -0.33
PRAME-212ENST00000485532 VSTM4Q8IW00 320 aa12.96□□□□□ -0.33
PRAME-212ENST00000485532 SH2D3CQ8N5H7 860 aa12.96□□□□□ -0.33
PRAME-212ENST00000485532 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa12.96□□□□□ -0.33
PRAME-212ENST00000485532 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP12.96□□□□□ -0.33
PRAME-212ENST00000485532 KLK6Q92876 244 aa12.96□□□□□ -0.33
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PRAME-212ENST00000485532 MYOCQ99972 504 aa12.96□□□□□ -0.33
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PRAME-212ENST00000485532 MUC3BQ9H195 1237 aa12.96□□□□□ -0.33
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PRAME-212ENST00000485532 GDF3Q9NR23 364 aa12.96□□□□□ -0.33
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PRAME-212ENST00000485532 FHOD1Q9Y613 1164 aa12.96□□□□□ -0.33
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PRAME-212ENST00000485532 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP12.95□□□□□ -0.34
PRAME-212ENST00000485532 DFNA5O60443 496 aa12.95□□□□□ -0.34
PRAME-212ENST00000485532 CLDN11O75508 207 aa12.95□□□□□ -0.34
PRAME-212ENST00000485532 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP12.95□□□□□ -0.34
PRAME-212ENST00000485532 TPM3P06753 285 aa12.95□□□□□ -0.34
PRAME-212ENST00000485532 SRCP12931 536 aa12.95□□□□□ -0.34
PRAME-212ENST00000485532 GLDCP23378 1020 aa12.95□□□□□ -0.34
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PRAME-212ENST00000485532 SULT1E1P49888 294 aa12.95□□□□□ -0.34
PRAME-212ENST00000485532 KCNMA1Q12791 1236 aa12.95□□□□□ -0.34
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PRAME-212ENST00000485532 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP12.95□□□□□ -0.34
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PRAME-212ENST00000485532 C5orf22Q49AR2 442 aa12.95□□□□□ -0.34
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PRAME-212ENST00000485532 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa12.95□□□□□ -0.34
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PRAME-212ENST00000485532 GALNT15Q8N3T1 639 aa12.95□□□□□ -0.34
PRAME-212ENST00000485532 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP12.95□□□□□ -0.34
PRAME-212ENST00000485532 SKA1Q96BD8 255 aa12.95□□□□□ -0.34
PRAME-212ENST00000485532 NOX5Q96PH1 765 aa12.95□□□□□ -0.34
PRAME-212ENST00000485532 WDCPQ9H6R7 721 aa12.95□□□□□ -0.34
PRAME-212ENST00000485532 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa12.95□□□□□ -0.34
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PRAME-212ENST00000485532 MCF2LO15068 1137 aa12.94□□□□□ -0.34
PRAME-212ENST00000485532 SDC3O75056 442 aa12.94□□□□□ -0.34
PRAME-212ENST00000485532 ENDOD1O94919 500 aa12.94□□□□□ -0.34
PRAME-212ENST00000485532 RHOCP08134 193 aa12.94□□□□□ -0.34
PRAME-212ENST00000485532 PRLRP16471 622 aa12.94□□□□□ -0.34
PRAME-212ENST00000485532 KLK7P49862 253 aa12.94□□□□□ -0.34
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PRAME-212ENST00000485532 OXCT1P55809 520 aa12.94□□□□□ -0.34
PRAME-212ENST00000485532 DEUP1Q05D60 604 aa12.94□□□□□ -0.34
PRAME-212ENST00000485532 INAVAQ3KP66 663 aa12.94□□□□□ -0.34
PRAME-212ENST00000485532 RAB6CQ53S08 254 aa12.94□□□□□ -0.34
PRAME-212ENST00000485532 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP12.94□□□□□ -0.34
PRAME-212ENST00000485532 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa12.94□□□□□ -0.34
PRAME-212ENST00000485532 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa12.94□□□□□ -0.34
PRAME-212ENST00000485532 DSG4Q86SJ6 1040 aa12.94□□□□□ -0.34
PRAME-212ENST00000485532 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP12.94□□□□□ -0.34
PRAME-212ENST00000485532 XYLT1Q86Y38 959 aa12.94□□□□□ -0.34
PRAME-212ENST00000485532 ATP11CQ8NB49 1132 aa12.94□□□□□ -0.34
PRAME-212ENST00000485532 CHST14Q8NCH0 376 aa12.94□□□□□ -0.34
PRAME-212ENST00000485532 ARRDC3Q96B67 414 aa12.94□□□□□ -0.34
PRAME-212ENST00000485532 CRELD1Q96HD1 420 aa12.94□□□□□ -0.34
PRAME-212ENST00000485532 PDLIM2Q96JY6 352 aa12.94□□□□□ -0.34
PRAME-212ENST00000485532 RAB6CQ9H0N0 254 aa12.94□□□□□ -0.34
PRAME-212ENST00000485532 TNKS2Q9H2K2 1166 aa12.94□□□□□ -0.34
PRAME-212ENST00000485532 FZD3Q9NPG1 666 aa12.94□□□□□ -0.34
PRAME-212ENST00000485532 VPS51Q9UID3 782 aa12.94□□□□□ -0.34
PRAME-212ENST00000485532 ACTL7AQ9Y615 435 aa12.94□□□□□ -0.34
PRAME-212ENST00000485532 IGSF10Q6WRI0 2623 aa12.94□□□□□ -0.34
PRAME-212ENST00000485532 BAHCC1Q9P281 2608 aa12.94□□□□□ -0.34
PRAME-212ENST00000485532 URB1O60287 2271 aaKnown RBP12.93□□□□□ -0.34
PRAME-212ENST00000485532 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa12.93□□□□□ -0.34
PRAME-212ENST00000485532 GOLGA8SH3BPF8 625 aa12.93□□□□□ -0.34
PRAME-212ENST00000485532 SLC31A1O15431 190 aa12.93□□□□□ -0.34
PRAME-212ENST00000485532 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP12.93□□□□□ -0.34
PRAME-212ENST00000485532 RFPL3O75679 317 aa12.93□□□□□ -0.34
PRAME-212ENST00000485532 FLT3P36888 993 aa12.93□□□□□ -0.34
PRAME-212ENST00000485532 ACADVLP49748 655 aa12.93□□□□□ -0.34
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