RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460231.5

PCNP-202, Transcript of PEST proteolytic signal containing nuclear protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PCNP, Length 2,165 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNP-202ENST00000460231 TCAF2A6NFQ2 919 aa14.62□□□□□ -0.07
PCNP-202ENST00000460231 MMP2P08253 660 aa14.62□□□□□ -0.07
PCNP-202ENST00000460231 CSKP41240 450 aa14.62□□□□□ -0.07
PCNP-202ENST00000460231 DSC2Q02487 901 aa14.62□□□□□ -0.07
PCNP-202ENST00000460231 TNK2Q07912 1038 aa14.62□□□□□ -0.07
PCNP-202ENST00000460231 BBS9Q3SYG4 887 aa14.62□□□□□ -0.07
PCNP-202ENST00000460231 SFTPA1Q8IWL2 248 aa14.62□□□□□ -0.07
PCNP-202ENST00000460231 UNC5BQ8IZJ1 945 aa14.62□□□□□ -0.07
PCNP-202ENST00000460231 LZTR1Q8N653 840 aa14.62□□□□□ -0.07
PCNP-202ENST00000460231 MAML1Q92585 1016 aa14.62□□□□□ -0.07
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PCNP-202ENST00000460231 SMIM14Q96QK8 99 aa14.62□□□□□ -0.07
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PCNP-202ENST00000460231 SFXN1Q9H9B4 322 aa14.62□□□□□ -0.07
PCNP-202ENST00000460231 NT5MQ9NPB1 228 aa14.62□□□□□ -0.07
PCNP-202ENST00000460231 FAM53CQ9NYF3 392 aa14.62□□□□□ -0.07
PCNP-202ENST00000460231 RSPH14Q9UHP6 348 aa14.62□□□□□ -0.07
PCNP-202ENST00000460231 ARHGAP42A6NI28 874 aa14.61□□□□□ -0.07
PCNP-202ENST00000460231 CBX4O00257 560 aa14.61□□□□□ -0.07
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PCNP-202ENST00000460231 OPHN1O60890 802 aa14.61□□□□□ -0.07
PCNP-202ENST00000460231 SSTR1P30872 391 aa14.61□□□□□ -0.07
PCNP-202ENST00000460231 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
PCNP-202ENST00000460231 MAGEA4P43358 317 aa14.61□□□□□ -0.07
PCNP-202ENST00000460231 MAGEA6P43360 314 aa14.61□□□□□ -0.07
PCNP-202ENST00000460231 CHRNA4P43681 627 aa14.61□□□□□ -0.07
PCNP-202ENST00000460231 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
PCNP-202ENST00000460231 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP14.61□□□□□ -0.076e-8■■■□□ 15
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PCNP-202ENST00000460231 KCTD11Q693B1 232 aa14.61□□□□□ -0.07
PCNP-202ENST00000460231 IL31Q6EBC2 164 aa14.61□□□□□ -0.07
PCNP-202ENST00000460231 ANKRD54Q6NXT1 300 aa14.61□□□□□ -0.07
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PCNP-202ENST00000460231 GBA3Q9H227 469 aa14.61□□□□□ -0.07
PCNP-202ENST00000460231 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa14.61□□□□□ -0.07
PCNP-202ENST00000460231 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa14.61□□□□□ -0.07
PCNP-202ENST00000460231 CHMP2BQ9UQN3 213 aa14.61□□□□□ -0.07
PCNP-202ENST00000460231 MTCH2Q9Y6C9 303 aa14.61□□□□□ -0.07
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PCNP-202ENST00000460231 RHOCP08134 193 aa14.61□□□□□ -0.07
PCNP-202ENST00000460231 TPH1P17752 444 aa14.61□□□□□ -0.07
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PCNP-202ENST00000460231 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa14.61□□□□□ -0.07
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PCNP-202ENST00000460231 CCHCR1Q8TD31 782 aa14.61□□□□□ -0.07
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PCNP-202ENST00000460231 S1PR5Q9H228 398 aa14.61□□□□□ -0.07
PCNP-202ENST00000460231 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
PCNP-202ENST00000460231 IGSF9Q9P2J2 1179 aa14.61□□□□□ -0.07
PCNP-202ENST00000460231 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa14.61□□□□□ -0.07
PCNP-202ENST00000460231 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
PCNP-202ENST00000460231 RAD54BQ9Y620 910 aa14.61□□□□□ -0.07
PCNP-202ENST00000460231 MYO15AQ9UKN7 3530 aa14.6□□□□□ -0.07
PCNP-202ENST00000460231 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
PCNP-202ENST00000460231 SMIM23A6NLE4 172 aa14.6□□□□□ -0.07
PCNP-202ENST00000460231 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa14.6□□□□□ -0.07
PCNP-202ENST00000460231 H0Y626 953 aa14.6□□□□□ -0.07
PCNP-202ENST00000460231 ZMPSTE24O75844 475 aa14.6□□□□□ -0.07
PCNP-202ENST00000460231 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
PCNP-202ENST00000460231 AGTP01019 485 aa14.6□□□□□ -0.07
PCNP-202ENST00000460231 ACTN2P35609 894 aa14.6□□□□□ -0.07
PCNP-202ENST00000460231 ELK3P41970 407 aa14.6□□□□□ -0.07
PCNP-202ENST00000460231 MAGEA3P43357 314 aa14.6□□□□□ -0.07
PCNP-202ENST00000460231 SLCO1A2P46721 670 aa14.6□□□□□ -0.07
PCNP-202ENST00000460231 RGS19P49795 217 aa14.6□□□□□ -0.07
PCNP-202ENST00000460231 GYS2P54840 703 aa14.6□□□□□ -0.07
PCNP-202ENST00000460231 LMAN2Q12907 356 aa14.6□□□□□ -0.07
PCNP-202ENST00000460231 USP4Q13107 963 aa14.6□□□□□ -0.07
PCNP-202ENST00000460231 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
PCNP-202ENST00000460231 ADAM15Q13444 863 aa14.6□□□□□ -0.07
PCNP-202ENST00000460231 LY6G5CQ5SRR4 150 aa14.6□□□□□ -0.07
PCNP-202ENST00000460231 CES3Q6UWW8 571 aa14.6□□□□□ -0.07
PCNP-202ENST00000460231 C12orf40Q86WS4 652 aa14.6□□□□□ -0.07
PCNP-202ENST00000460231 FBXO36Q8NEA4 188 aa14.6□□□□□ -0.07
PCNP-202ENST00000460231 TTC8Q8TAM2 541 aa14.6□□□□□ -0.07
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PCNP-202ENST00000460231 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
PCNP-202ENST00000460231 SP110Q9HB58 689 aa14.6□□□□□ -0.07
PCNP-202ENST00000460231 ATP13A1Q9HD20 1204 aa14.6□□□□□ -0.07
PCNP-202ENST00000460231 A0A0U1RQS6 177 aa14.6□□□□□ -0.07
PCNP-202ENST00000460231 CCDC78A2IDD5 438 aa14.6□□□□□ -0.07
PCNP-202ENST00000460231 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
PCNP-202ENST00000460231 ARSAP15289 507 aa14.6□□□□□ -0.07
PCNP-202ENST00000460231 FSHRP23945 695 aa14.6□□□□□ -0.07
PCNP-202ENST00000460231 WEE1P30291 646 aa14.6□□□□□ -0.07
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