RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412640.6

SOX9-AS1-201, SOX9 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene SOX9-AS1, Length 635 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX9-AS1-201ENST00000412640 L1RE1Q9UN81 338 aa9.85□□□□□ -0.83
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa9.85□□□□□ -0.83
SOX9-AS1-201ENST00000412640 KNL1Q8NG31 2342 aa9.85□□□□□ -0.83
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CLEC18AA5D8T8 446 aa9.84□□□□□ -0.83
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SIGLEC16A6NMB1 481 aa9.84□□□□□ -0.83
SOX9-AS1-201ENST00000412640 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PSTPIP1O43586 416 aa9.84□□□□□ -0.83
SOX9-AS1-201ENST00000412640 HUS1O60921 280 aa9.84□□□□□ -0.83
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TULP3O75386 442 aa9.84□□□□□ -0.83
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CYP11A1P05108 521 aa9.84□□□□□ -0.83
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ITGB6P18564 788 aa9.84□□□□□ -0.83
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CYP2F1P24903 491 aa9.84□□□□□ -0.83
SOX9-AS1-201ENST00000412640 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
SOX9-AS1-201ENST00000412640 RWDD2BP57060 319 aa9.84□□□□□ -0.83
SOX9-AS1-201ENST00000412640 C2orf54Q08AI8 447 aa9.84□□□□□ -0.83
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PDCLQ13371 301 aa9.84□□□□□ -0.83
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TEAD4Q15561 434 aa9.84□□□□□ -0.83
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PPP2R5EQ16537 467 aa9.84□□□□□ -0.83
SOX9-AS1-201ENST00000412640 LINC00303Q3SY05 128 aa9.84□□□□□ -0.83
SOX9-AS1-201ENST00000412640 LRRC38Q5VT99 294 aa9.84□□□□□ -0.83
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CCDC70Q6NSX1 233 aa9.84□□□□□ -0.83
SOX9-AS1-201ENST00000412640 DNAJC24Q6P3W2 148 aa9.84□□□□□ -0.83
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CLEC18BQ6UXF7 455 aa9.84□□□□□ -0.83
SOX9-AS1-201ENST00000412640 XYLT1Q86Y38 959 aa9.84□□□□□ -0.83
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa9.84□□□□□ -0.83
SOX9-AS1-201ENST00000412640 THEM5Q8N1Q8 247 aa9.84□□□□□ -0.83
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TMEM86AQ8N2M4 240 aa9.84□□□□□ -0.83
SOX9-AS1-201ENST00000412640 EID2Q8N6I1 236 aa9.84□□□□□ -0.83
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TERB1Q8NA31 727 aa9.84□□□□□ -0.83
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CLEC18CQ8NCF0 446 aa9.84□□□□□ -0.83
SOX9-AS1-201ENST00000412640 KRT35Q92764 455 aa9.84□□□□□ -0.83
SOX9-AS1-201ENST00000412640 C18orf8Q96DM3 657 aa9.84□□□□□ -0.83
SOX9-AS1-201ENST00000412640 BTBD6Q96KE9 485 aa9.84□□□□□ -0.83
SOX9-AS1-201ENST00000412640 MYRFLQ96LU7 910 aa9.84□□□□□ -0.83
SOX9-AS1-201ENST00000412640 GABRG3Q99928 467 aa9.84□□□□□ -0.83
SOX9-AS1-201ENST00000412640 DPH1Q9BZG8 443 aa9.84□□□□□ -0.83
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TRIM7Q9C029 511 aa9.84□□□□□ -0.83
SOX9-AS1-201ENST00000412640 RNF38Q9H0F5 515 aa9.84□□□□□ -0.83
SOX9-AS1-201ENST00000412640 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa9.84□□□□□ -0.83
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TM9SF3Q9HD45 589 aa9.84□□□□□ -0.83
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa9.84□□□□□ -0.83
SOX9-AS1-201ENST00000412640 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CFAP97Q9P2B7 532 aa9.84□□□□□ -0.83
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TSPAN16Q9UKR8 245 aa9.84□□□□□ -0.83
SOX9-AS1-201ENST00000412640 M0QYV0 167 aa9.83□□□□□ -0.84
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ATP8B1O43520 1251 aa9.83□□□□□ -0.84
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SPOPO43791 374 aa9.83□□□□□ -0.84
SOX9-AS1-201ENST00000412640 RHOXF2BP0C7M4 288 aa9.83□□□□□ -0.84
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TNFRSF8P28908 595 aa9.83□□□□□ -0.84
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SCNN1AP37088 669 aa9.83□□□□□ -0.84
SOX9-AS1-201ENST00000412640 GRIK1P39086 918 aa9.83□□□□□ -0.84
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CTSKP43235 329 aa9.83□□□□□ -0.84
SOX9-AS1-201ENST00000412640 DNA2P51530 1060 aa9.83□□□□□ -0.84
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TPMTP51580 245 aa9.83□□□□□ -0.84
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CLCN6P51797 869 aa9.83□□□□□ -0.84
SOX9-AS1-201ENST00000412640 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
SOX9-AS1-201ENST00000412640 GABREP78334 506 aa9.83□□□□□ -0.84
SOX9-AS1-201ENST00000412640 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
SOX9-AS1-201ENST00000412640 GAD2Q05329 585 aa9.83□□□□□ -0.84
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SMARCB1Q12824 385 aa9.83□□□□□ -0.84
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ORC1Q13415 861 aa9.83□□□□□ -0.84
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
SOX9-AS1-201ENST00000412640 IGFBP7Q16270 282 aa9.83□□□□□ -0.84
SOX9-AS1-201ENST00000412640 C2CD6Q53TS8 623 aa9.83□□□□□ -0.84
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
SOX9-AS1-201ENST00000412640 BTBD8Q5XKL5 378 aa9.83□□□□□ -0.84
SOX9-AS1-201ENST00000412640 WSCD1Q658N2 575 aa9.83□□□□□ -0.84
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CCDC81Q6ZN84 652 aa9.83□□□□□ -0.84
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TMEM110Q86TL2 294 aa9.83□□□□□ -0.84
SOX9-AS1-201ENST00000412640 FAM124AQ86V42 546 aa9.83□□□□□ -0.84
SOX9-AS1-201ENST00000412640 METTL23Q86XA0 190 aa9.83□□□□□ -0.84
SOX9-AS1-201ENST00000412640 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ADGRF2Q8IZF7 708 aa9.83□□□□□ -0.84
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PDCL2Q8N4E4 241 aa9.83□□□□□ -0.84
SOX9-AS1-201ENST00000412640 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa9.83□□□□□ -0.84
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ANKRD52Q8NB46 1076 aa9.83□□□□□ -0.84
SOX9-AS1-201ENST00000412640 OR6B3Q8NGW1 331 aa9.83□□□□□ -0.84
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SLC35F5Q8WV83 523 aa9.83□□□□□ -0.84
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TNIP3Q96KP6 325 aa9.83□□□□□ -0.84
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CPXM1Q96SM3 734 aa9.83□□□□□ -0.84
SOX9-AS1-201ENST00000412640 RHOXF2Q9BQY4 288 aa9.83□□□□□ -0.84
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SLC4A5Q9BY07 1137 aa9.83□□□□□ -0.84
SOX9-AS1-201ENST00000412640 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SNX25Q9H3E2 840 aa9.83□□□□□ -0.84
SOX9-AS1-201ENST00000412640 STARD13Q9Y3M8 1113 aa9.83□□□□□ -0.84
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CPQQ9Y646 472 aa9.83□□□□□ -0.84
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa9.83□□□□□ -0.84
SOX9-AS1-201ENST00000412640 C2CD3Q4AC94 2353 aa9.82□□□□□ -0.84
SOX9-AS1-201ENST00000412640 A0A1B0GTQ1 180 aa9.82□□□□□ -0.84
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa9.82□□□□□ -0.84
SOX9-AS1-201ENST00000412640 A8MXQ7 604 aa9.82□□□□□ -0.84
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PRRT4C9JH25 899 aa9.82□□□□□ -0.84
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CYB561D2O14569 222 aa9.82□□□□□ -0.84
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP9.82□□□□□ -0.84
SOX9-AS1-201ENST00000412640 MT-CO3P00414 261 aa9.82□□□□□ -0.84
SOX9-AS1-201ENST00000412640 FGGP02679 453 aa9.82□□□□□ -0.84
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ERBB2P04626 1255 aa9.82□□□□□ -0.84
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ITGAVP06756 1048 aa9.82□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37 ms