RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362869.1

RNU6-552P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 552, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-552P, Length 119 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-552P-201ENST00000362869 ACTR2P61160 394 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-552P-201ENST00000362869 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
RNU6-552P-201ENST00000362869 GRAMD1BQ3KR37 738 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-552P-201ENST00000362869 ADCK5Q3MIX3 580 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-552P-201ENST00000362869 ANO1Q5XXA6 986 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-552P-201ENST00000362869 BHLHA9Q7RTU4 235 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-552P-201ENST00000362869 WDR5BQ86VZ2 330 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-552P-201ENST00000362869 CADM3Q8N126 398 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-552P-201ENST00000362869 FBXL14Q8N1E6 418 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-552P-201ENST00000362869 HORMAD2Q8N7B1 307 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-552P-201ENST00000362869 SCAIQ8N9R8 606 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-552P-201ENST00000362869 ENGASEQ8NFI3 743 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-552P-201ENST00000362869 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-552P-201ENST00000362869 BICD2Q8TD16 824 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-552P-201ENST00000362869 AFG1LQ8WV93 481 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-552P-201ENST00000362869 OIT3Q8WWZ8 545 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-552P-201ENST00000362869 MIB2Q96AX9 1013 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-552P-201ENST00000362869 SDCCAG3Q96C92 435 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-552P-201ENST00000362869 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
RNU6-552P-201ENST00000362869 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
RNU6-552P-201ENST00000362869 ARPC5LQ9BPX5 153 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-552P-201ENST00000362869 TMEM204Q9BSN7 226 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-552P-201ENST00000362869 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
RNU6-552P-201ENST00000362869 HIPK2Q9H2X6 1198 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-552P-201ENST00000362869 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-552P-201ENST00000362869 CHODLQ9H9P2 273 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-552P-201ENST00000362869 PLAC1Q9HBJ0 212 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-552P-201ENST00000362869 CDH22Q9UJ99 828 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-552P-201ENST00000362869 DHDHQ9UQ10 334 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-552P-201ENST00000362869 OSGIN2Q9Y236 505 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-552P-201ENST00000362869 A0A0A0MQY5 61 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-552P-201ENST00000362869 STMND1H3BQB6 276 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-552P-201ENST00000362869 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-552P-201ENST00000362869 STX16O14662 325 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-552P-201ENST00000362869 ARSAP15289 507 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-552P-201ENST00000362869 ARSBP15848 533 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-552P-201ENST00000362869 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
RNU6-552P-201ENST00000362869 MVDP53602 400 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-552P-201ENST00000362869 GOLGA8FQ08AF8 430 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-552P-201ENST00000362869 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
RNU6-552P-201ENST00000362869 ERV3-1Q14264 604 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-552P-201ENST00000362869 SYTL3Q4VX76 610 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-552P-201ENST00000362869 ANKRD45Q5TZF3 282 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-552P-201ENST00000362869 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
RNU6-552P-201ENST00000362869 DCAF12L2Q5VW00 463 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-552P-201ENST00000362869 TMEM268Q5VZI3 342 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-552P-201ENST00000362869 TMEM71Q6P5X7 295 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-552P-201ENST00000362869 MOGAT3Q86VF5 341 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-552P-201ENST00000362869 TMEM57Q8N5G2 664 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-552P-201ENST00000362869 LINS1Q8NG48 757 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-552P-201ENST00000362869 HDAC7Q8WUI4 952 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-552P-201ENST00000362869 RILPL2Q969X0 211 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-552P-201ENST00000362869 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF479Q96JC4 524 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF333Q96JL9 665 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-552P-201ENST00000362869 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
RNU6-552P-201ENST00000362869 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
RNU6-552P-201ENST00000362869 KLHL31Q9H511 634 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-552P-201ENST00000362869 HIF1ANQ9NWT6 349 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-552P-201ENST00000362869 PLK2Q9NYY3 685 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-552P-201ENST00000362869 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
RNU6-552P-201ENST00000362869 FEM1BQ9UK73 627 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-552P-201ENST00000362869 FZD10Q9ULW2 581 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-552P-201ENST00000362869 MYO6Q9UM54 1294 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-552P-201ENST00000362869 ICKQ9UPZ9 632 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-552P-201ENST00000362869 DERAQ9Y315 318 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-552P-201ENST00000362869 MST1RQ04912 1400 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-552P-201ENST00000362869 C17orf102A2RUQ5 167 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-552P-201ENST00000362869 OR6C75A6NL08 312 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-552P-201ENST00000362869 C17orf100A8MU93 164 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-552P-201ENST00000362869 BECN2A8MW95 431 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-552P-201ENST00000362869 RNMTO43148 476 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
RNU6-552P-201ENST00000362869 RGS14O43566 566 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-552P-201ENST00000362869 SPRY3O43610 288 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-552P-201ENST00000362869 HBP1O60381 514 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-552P-201ENST00000362869 CBX6O95503 412 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-552P-201ENST00000362869 NGFRP08138 427 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-552P-201ENST00000362869 MYZAPP0CAP1 466 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-552P-201ENST00000362869 TNNT1P13805 278 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-552P-201ENST00000362869 RXRAP19793 462 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-552P-201ENST00000362869 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
RNU6-552P-201ENST00000362869 GJC1P36383 396 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-552P-201ENST00000362869 AVPR1AP37288 418 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-552P-201ENST00000362869 PPP3CCP48454 512 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZP1P60852 638 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-552P-201ENST00000362869 ARHGAP8P85298 464 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-552P-201ENST00000362869 PKP1Q13835 747 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-552P-201ENST00000362869 IL13RA2Q14627 380 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-552P-201ENST00000362869 TAF5Q15542 800 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-552P-201ENST00000362869 DUSP6Q16828 381 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-552P-201ENST00000362869 AP5B1Q2VPB7 878 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-552P-201ENST00000362869 CTXN3Q4LDR2 81 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-552P-201ENST00000362869 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
RNU6-552P-201ENST00000362869 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-552P-201ENST00000362869 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-552P-201ENST00000362869 PDXDC1Q6P996 788 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-552P-201ENST00000362869 SERPINA11Q86U17 422 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-552P-201ENST00000362869 C2CD5Q86YS7 1000 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-552P-201ENST00000362869 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
RNU6-552P-201ENST00000362869 ANKRD44Q8N8A2 993 aa3.34□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.3 ms