RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000222305.7

USF2-201, Transcript of upstream transcription factor 2, c-fos interacting, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USF2, Length 1,634 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2-201ENST00000222305 A0A0A0MRY4 1105 aa23.45■■□□□ 1.34
USF2-201ENST00000222305 C5orf60A6NFR6 353 aa23.45■■□□□ 1.34
USF2-201ENST00000222305 CTIFO43310 598 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
USF2-201ENST00000222305 MTSS1O43312 755 aa23.45■■□□□ 1.34
USF2-201ENST00000222305 TULP3O75386 442 aa23.45■■□□□ 1.34
USF2-201ENST00000222305 STK10O94804 968 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
USF2-201ENST00000222305 JCHAINP01591 159 aa23.45■■□□□ 1.34
USF2-201ENST00000222305 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
USF2-201ENST00000222305 SLC6A11P48066 632 aa23.45■■□□□ 1.34
USF2-201ENST00000222305 GPS1Q13098 491 aa23.45■■□□□ 1.34
USF2-201ENST00000222305 NR1H3Q13133 447 aa23.45■■□□□ 1.34
USF2-201ENST00000222305 P3H1Q32P28 736 aa23.45■■□□□ 1.34
USF2-201ENST00000222305 PITRM1Q5JRX3 1037 aa23.45■■□□□ 1.34
USF2-201ENST00000222305 LINGO4Q6UY18 593 aa23.45■■□□□ 1.34
USF2-201ENST00000222305 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa23.45■■□□□ 1.34
USF2-201ENST00000222305 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
USF2-201ENST00000222305 DCAF4L2Q8NA75 395 aa23.45■■□□□ 1.34
USF2-201ENST00000222305 MAML1Q92585 1016 aa23.45■■□□□ 1.34
USF2-201ENST00000222305 SPATA13Q96N96 652 aa23.45■■□□□ 1.34
USF2-201ENST00000222305 AGAP3Q96P47 875 aa23.45■■□□□ 1.34
USF2-201ENST00000222305 PNKPQ96T60 521 aa23.45■■□□□ 1.34
USF2-201ENST00000222305 SLC2A11Q9BYW1 496 aa23.45■■□□□ 1.34
USF2-201ENST00000222305 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
USF2-201ENST00000222305 VPS51Q9UID3 782 aa23.45■■□□□ 1.34
USF2-201ENST00000222305 FBXO10Q9UK96 956 aa23.45■■□□□ 1.34
USF2-201ENST00000222305 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
USF2-201ENST00000222305 GCATO75600 419 aa23.44■■□□□ 1.34
USF2-201ENST00000222305 ZMPSTE24O75844 475 aa23.44■■□□□ 1.34
USF2-201ENST00000222305 ASGR2P07307 311 aa23.44■■□□□ 1.34
USF2-201ENST00000222305 GJA4P35212 333 aa23.44■■□□□ 1.34
USF2-201ENST00000222305 ACTN2P35609 894 aa23.44■■□□□ 1.34
USF2-201ENST00000222305 DGKGP49619 791 aa23.44■■□□□ 1.34
USF2-201ENST00000222305 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
USF2-201ENST00000222305 SLC10A7Q0GE19 358 aa23.44■■□□□ 1.34
USF2-201ENST00000222305 SLC12A1Q13621 1099 aa23.44■■□□□ 1.34
USF2-201ENST00000222305 DUPD1Q68J44 220 aa23.44■■□□□ 1.34
USF2-201ENST00000222305 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
USF2-201ENST00000222305 SNX24Q9Y343 169 aa23.44■■□□□ 1.34
USF2-201ENST00000222305 ANKRD36A6QL64 1941 aa23.44■■□□□ 1.34
USF2-201ENST00000222305 F5H423 210 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
USF2-201ENST00000222305 CISD3P0C7P0 127 aa23.44■■□□□ 1.34
USF2-201ENST00000222305 ADCY8P40145 1251 aa23.44■■□□□ 1.34
USF2-201ENST00000222305 RPL21P46778 160 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
USF2-201ENST00000222305 PLK1P53350 603 aa23.44■■□□□ 1.34
USF2-201ENST00000222305 MESP2Q0VG99 397 aa23.44■■□□□ 1.34
USF2-201ENST00000222305 GEN1Q17RS7 908 aa23.44■■□□□ 1.34
USF2-201ENST00000222305 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa23.44■■□□□ 1.34
USF2-201ENST00000222305 TEX44Q53QW1 395 aa23.44■■□□□ 1.34
USF2-201ENST00000222305 PID1Q7Z2X4 250 aa23.44■■□□□ 1.34
USF2-201ENST00000222305 CNTD1Q8N815 330 aa23.44■■□□□ 1.34
USF2-201ENST00000222305 IL12RB2Q99665 862 aa23.44■■□□□ 1.34
USF2-201ENST00000222305 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
USF2-201ENST00000222305 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
USF2-201ENST00000222305 FAM50BQ9Y247 325 aa23.44■■□□□ 1.34
USF2-201ENST00000222305 TTLL3Q9Y4R7 772 aa23.44■■□□□ 1.34
USF2-201ENST00000222305 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
USF2-201ENST00000222305 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
USF2-201ENST00000222305 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
USF2-201ENST00000222305 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
USF2-201ENST00000222305 IVDP26440 423 aa23.43■■□□□ 1.34
USF2-201ENST00000222305 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
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USF2-201ENST00000222305 FAXCQ5TGI0 409 aa23.43■■□□□ 1.34
USF2-201ENST00000222305 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa23.43■■□□□ 1.34
USF2-201ENST00000222305 SLC44A3Q8N4M1 653 aa23.43■■□□□ 1.34
USF2-201ENST00000222305 NSMCE1Q8WV22 266 aa23.43■■□□□ 1.34
USF2-201ENST00000222305 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa23.43■■□□□ 1.34
USF2-201ENST00000222305 FATE1Q969F0 183 aa23.43■■□□□ 1.34
USF2-201ENST00000222305 CHFRQ96EP1 664 aa23.43■■□□□ 1.34
USF2-201ENST00000222305 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP23.43■■□□□ 1.34
USF2-201ENST00000222305 PAK5Q9P286 719 aa23.43■■□□□ 1.34
USF2-201ENST00000222305 THEGQ9P2T0 379 aa23.43■■□□□ 1.34
USF2-201ENST00000222305 OPHN1O60890 802 aa23.42■■□□□ 1.34
USF2-201ENST00000222305 METTL18O95568 372 aa23.42■■□□□ 1.34
USF2-201ENST00000222305 CD160O95971 181 aa23.42■■□□□ 1.34
USF2-201ENST00000222305 HLA-DQB2P05538 268 aa23.42■■□□□ 1.34
USF2-201ENST00000222305 OPRD1P41143 372 aa23.42■■□□□ 1.34
USF2-201ENST00000222305 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
USF2-201ENST00000222305 SOX9P48436 509 aa23.42■■□□□ 1.34
USF2-201ENST00000222305 KDSRQ06136 332 aa23.42■■□□□ 1.34
USF2-201ENST00000222305 TMCO4Q5TGY1 634 aa23.42■■□□□ 1.34
USF2-201ENST00000222305 MARC1Q5VT66 337 aa23.42■■□□□ 1.34
USF2-201ENST00000222305 TMEM215Q68D42 235 aa23.42■■□□□ 1.34
USF2-201ENST00000222305 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
USF2-201ENST00000222305 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP23.42■■□□□ 1.34
USF2-201ENST00000222305 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
USF2-201ENST00000222305 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP23.42■■□□□ 1.34
USF2-201ENST00000222305 CCHCR1Q8TD31 782 aa23.42■■□□□ 1.34
USF2-201ENST00000222305 TEKT5Q96M29 485 aa23.42■■□□□ 1.34
USF2-201ENST00000222305 VAT1Q99536 393 aa23.42■■□□□ 1.34
USF2-201ENST00000222305 NEBLO76041 1014 aa23.41■■□□□ 1.34
USF2-201ENST00000222305 CD68P34810 354 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
USF2-201ENST00000222305 MMP13P45452 471 aa23.41■■□□□ 1.34
USF2-201ENST00000222305 RENBPP51606 427 aa23.41■■□□□ 1.34
USF2-201ENST00000222305 ADIPOR2Q86V24 386 aa23.41■■□□□ 1.34
USF2-201ENST00000222305 AHI1Q8N157 1196 aa23.41■■□□□ 1.34
USF2-201ENST00000222305 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa23.41■■□□□ 1.34
USF2-201ENST00000222305 SEC14L1Q92503 715 aa23.41■■□□□ 1.34
USF2-201ENST00000222305 NXPE3Q969Y0 559 aa23.41■■□□□ 1.34
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