RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000216877.10

PTPRA-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type A, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRA, Length 3,725 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRA-201ENST00000216877 GLRA3O75311 464 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRA-201ENST00000216877 CHRNGP07510 517 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRA-201ENST00000216877 MYL4P12829 197 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRA-201ENST00000216877 UNGP13051 313 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
PTPRA-201ENST00000216877 CCND2P30279 289 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRA-201ENST00000216877 DPP6P42658 865 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRA-201ENST00000216877 GABRB2P47870 512 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRA-201ENST00000216877 GLRBP48167 497 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRA-201ENST00000216877 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
PTPRA-201ENST00000216877 STX1BP61266 288 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRA-201ENST00000216877 VAC14Q08AM6 782 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRA-201ENST00000216877 MERTKQ12866 999 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRA-201ENST00000216877 TICAM1Q8IUC6 712 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRA-201ENST00000216877 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
PTPRA-201ENST00000216877 TTC39CQ8N584 583 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRA-201ENST00000216877 FAM110BQ8TC76 370 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRA-201ENST00000216877 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
PTPRA-201ENST00000216877 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
PTPRA-201ENST00000216877 MROQ9BYG7 248 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRA-201ENST00000216877 IMPG2Q9BZV3 1241 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRA-201ENST00000216877 CYP26B1Q9NR63 512 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRA-201ENST00000216877 UCKL1Q9NWZ5 548 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRA-201ENST00000216877 MTMR4Q9NYA4 1195 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRA-201ENST00000216877 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP14.9□□□□□ -0.02
PTPRA-201ENST00000216877 COPG2Q9UBF2 871 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRA-201ENST00000216877 MTRRQ9UBK8 725 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRA-201ENST00000216877 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
PTPRA-201ENST00000216877 TTLL3Q9Y4R7 772 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRA-201ENST00000216877 PLIN3O60664 434 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRA-201ENST00000216877 MMRN1Q13201 1228 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRA-201ENST00000216877 TMEM132AQ24JP5 1023 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRA-201ENST00000216877 SIGIRRQ6IA17 410 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRA-201ENST00000216877 CAMK1DQ8IU85 385 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRA-201ENST00000216877 PGAM4Q8N0Y7 254 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRA-201ENST00000216877 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
PTPRA-201ENST00000216877 MAGEE1Q9HCI5 957 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRA-201ENST00000216877 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRA-201ENST00000216877 CLRN2A0PK11 232 aa14.89□□□□□ -0.03
PTPRA-201ENST00000216877 HEATR9A2RTY3 570 aa14.89□□□□□ -0.03
PTPRA-201ENST00000216877 SYCE1LA8MT33 242 aa14.89□□□□□ -0.03
PTPRA-201ENST00000216877 TBX1O43435 398 aa14.89□□□□□ -0.03
PTPRA-201ENST00000216877 GRIN3BO60391 1043 aa14.89□□□□□ -0.03
PTPRA-201ENST00000216877 NTSR2O95665 410 aa14.89□□□□□ -0.03
PTPRA-201ENST00000216877 CDKN2BP42772 138 aa14.89□□□□□ -0.03
PTPRA-201ENST00000216877 IFITM2Q01629 132 aa14.89□□□□□ -0.03
PTPRA-201ENST00000216877 DGCR6Q14129 220 aa14.89□□□□□ -0.03
PTPRA-201ENST00000216877 SEL1L3Q68CR1 1132 aa14.89□□□□□ -0.03
PTPRA-201ENST00000216877 UNC5AQ6ZN44 842 aa14.89□□□□□ -0.03
PTPRA-201ENST00000216877 SPERTQ8NA61 448 aa14.89□□□□□ -0.03
PTPRA-201ENST00000216877 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
PTPRA-201ENST00000216877 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
PTPRA-201ENST00000216877 MEN1O00255 615 aa14.89□□□□□ -0.03
PTPRA-201ENST00000216877 IL1BP01584 269 aa14.89□□□□□ -0.03
PTPRA-201ENST00000216877 GFAPP14136 432 aa14.89□□□□□ -0.03
PTPRA-201ENST00000216877 ELK4P28324 431 aa14.89□□□□□ -0.03
PTPRA-201ENST00000216877 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
PTPRA-201ENST00000216877 CDKL2Q92772 493 aa14.89□□□□□ -0.03
PTPRA-201ENST00000216877 TCF12Q99081 682 aa14.89□□□□□ -0.03
PTPRA-201ENST00000216877 LXNQ9BS40 222 aa14.89□□□□□ -0.03
PTPRA-201ENST00000216877 ADPRHL2Q9NX46 363 aa14.89□□□□□ -0.03
PTPRA-201ENST00000216877 SNTG2Q9NY99 539 aa14.89□□□□□ -0.03
PTPRA-201ENST00000216877 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
PTPRA-201ENST00000216877 PCDHGC3Q9UN70 934 aa14.89□□□□□ -0.03
PTPRA-201ENST00000216877 ZHX2Q9Y6X8 837 aa14.89□□□□□ -0.03
PTPRA-201ENST00000216877 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa14.89□□□□□ -0.03
PTPRA-201ENST00000216877 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
PTPRA-201ENST00000216877 SNX2O60749 519 aa14.89□□□□□ -0.03
PTPRA-201ENST00000216877 RAD17O75943 681 aa14.89□□□□□ -0.03
PTPRA-201ENST00000216877 CYP3A4P08684 503 aa14.89□□□□□ -0.03
PTPRA-201ENST00000216877 IFI30P13284 250 aa14.89□□□□□ -0.03
PTPRA-201ENST00000216877 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
PTPRA-201ENST00000216877 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
PTPRA-201ENST00000216877 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
PTPRA-201ENST00000216877 SH2D5Q6ZV89 423 aa14.89□□□□□ -0.03
PTPRA-201ENST00000216877 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa14.89□□□□□ -0.03
PTPRA-201ENST00000216877 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
PTPRA-201ENST00000216877 FAM20AQ96MK3 541 aa14.89□□□□□ -0.03
PTPRA-201ENST00000216877 GTSE1Q9NYZ3 720 aa14.89□□□□□ -0.03
PTPRA-201ENST00000216877 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa14.89□□□□□ -0.03
PTPRA-201ENST00000216877 CCDC78A2IDD5 438 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRA-201ENST00000216877 IL10P22301 178 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRA-201ENST00000216877 CHRNA5P30532 468 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRA-201ENST00000216877 PTPN9P43378 593 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRA-201ENST00000216877 AP3M2P53677 418 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRA-201ENST00000216877 DGKDQ16760 1214 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRA-201ENST00000216877 AGKQ53H12 422 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRA-201ENST00000216877 TTC23LQ6PF05 361 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRA-201ENST00000216877 DHFR2Q86XF0 187 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRA-201ENST00000216877 SYTL1Q8IYJ3 562 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRA-201ENST00000216877 MPP5Q8N3R9 675 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRA-201ENST00000216877 SLC35B2Q8TB61 432 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRA-201ENST00000216877 NACC2Q96BF6 587 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRA-201ENST00000216877 PIF1Q9H611 641 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRA-201ENST00000216877 NANOGQ9H9S0 305 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRA-201ENST00000216877 TEX264Q9Y6I9 313 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRA-201ENST00000216877 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRA-201ENST00000216877 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
PTPRA-201ENST00000216877 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
PTPRA-201ENST00000216877 GABRB3P28472 473 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRA-201ENST00000216877 SPIRE1Q08AE8 756 aa14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.6 ms