RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000020163.6

Nedd1-201, Transcript of Protein NEDD1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Nedd1, Length 3,534 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Homer2Q9QWW1 354 aa10.11□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 QkiQ9QYS9 341 aaKnown RBP10.11□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Morf4l2Q9R0Q4 288 aa10.11□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ubr3Q5U430 1889 aa10.1□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Nrxn2E9Q7X7 1710 aa10.1□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gm21897J3KMP5 500 aa10.1□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gm21750L7N228 499 aa10.1□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Vmn2r61L7N2B8 865 aa10.1□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Kng1O08677 661 aa10.1□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Pdcd5P56812 126 aa10.1□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 GabpaQ00422 454 aa10.1□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Pcbp2Q61990 362 aaKnown RBP10.1□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Cyp3a16Q64481 504 aa10.1□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Podnl1Q6P3Y9 559 aa10.1□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 PrcpQ7TMR0 491 aa10.1□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Cnksr2Q80YA9 1032 aa10.1□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Zbtb41Q811F1 908 aa10.1□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Fnbp1lQ8K012 605 aa10.1□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ccdc59Q8R2N0 240 aaKnown RBP10.1□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Prpsap2Q8R574 369 aa10.1□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 NpntQ91V88 561 aa10.1□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Slc22a7Q91WU2 540 aa10.1□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Emc2Q9CRD2 297 aa10.1□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Serpinb3bQ9D1Q5 387 aa10.1□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Hormad1Q9D5T7 392 aa10.1□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Htr3bQ9JHJ5 437 aa10.1□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Olfr625-ps1A0A140T8L4 321 aa10.1□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Pde4aO89084 844 aa10.1□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 H2-Eb1P04230 264 aa10.1□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 PrkceP16054 737 aa10.1□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Csf3rP40223 837 aa10.1□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 TgfbiP82198 683 aa10.1□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Adra1dP97714 562 aa10.1□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ceacam5Q3UKK2 947 aa10.1□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Olfm4Q3UZZ4 505 aa10.1□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Tmem247Q497K7 211 aa10.1□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Scn2bQ56A07 215 aa10.1□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Abcb7Q61102 752 aaKnown RBP10.1□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Krt73Q6NXH9 539 aa10.1□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Naa50Q6PGB6 169 aaKnown RBP10.1□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Letm2Q7TNU7 480 aa10.1□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Prap1Q80XD8 149 aa10.1□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Camk1dQ8BW96 385 aa10.1□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Irak4Q8R4K2 459 aa10.1□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Olfr617Q8VGA1 318 aa10.1□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Nr3c2Q8VII8 978 aa10.1□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Dhrs4Q99LB2 279 aa10.1□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Cmtm6Q9CZ69 183 aa10.1□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Atg7Q9D906 698 aa10.1□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ift43Q9DA69 206 aa10.1□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ampd2Q9DBT5 798 aa10.1□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Hcar2Q9EP66 360 aa10.1□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 PorcnQ9JJJ7 461 aa10.1□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Trpc5Q9QX29 975 aa10.1□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Aqp5Q9WTY4 265 aa10.1□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 CtshP49935 333 aa10.1□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 GuloP58710 440 aa10.1□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Tubgcp3P58854 905 aa10.1□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 OxtrP97926 388 aa10.1□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gpr174Q3U507 335 aa10.1□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Trim75Q3UWZ0 467 aa10.1□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 FAM120AQ6A0A9 1112 aaKnown RBP10.1□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Trit1Q80UN9 467 aa10.1□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Clptm1lQ8BXA5 539 aa10.1□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 TbcelQ8C5W3 424 aa10.1□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 BicralQ8CHH5 1074 aa10.1□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Mark4Q8CIP4 752 aa10.1□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Adam32Q8K410 754 aa10.1□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Wdr98Q8VC42 657 aa10.1□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Zfp566Q8VCI1 386 aa10.1□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Usb1Q91W78 267 aa10.1□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Kiaa2013Q91X21 634 aa10.1□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 FdpsQ920E5 353 aa10.1□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ddx50Q99MJ9 734 aaKnown RBP10.1□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Lrrc17Q9CXD9 443 aa10.1□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 MlklQ9D2Y4 472 aa10.1□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Efhd2Q9D8Y0 240 aaKnown RBP10.1□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Abhd1Q9QZC8 412 aa10.1□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gria4Q9Z2W8 902 aa10.1□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gm10424A0A0J9YVD0 481 aa10.09□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gm10406A6NAS4 205 aa10.09□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gm3373A6NAS7 205 aa10.09□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Serpina3iD3Z450 408 aa10.09□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gm3252E9PUT9 216 aa10.09□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gm3002E9PW72 216 aa10.09□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gm3298E9PW80 205 aa10.09□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gm3468E9QAJ8 216 aa10.09□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gm7971J3QMM8 481 aa10.09□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gm3667K7N757 205 aa10.09□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Serpina3kP07759 418 aa10.09□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gnl1P36916 607 aa10.09□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 NxnP97346 435 aa10.09□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Fmo3P97501 534 aa10.09□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Itga4Q00651 1039 aa10.09□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Dok7Q18PE0 504 aa10.09□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Krt26Q3TRJ4 462 aa10.09□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Zmym5Q3U2E2 627 aa10.09□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gm3558Q5FWC9 205 aa10.09□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Atg9bQ6EBV9 922 aa10.09□□□□□ -0.79
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Thoc7Q7TMY4 204 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 27.2 ms