RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641643.1

SYT6-210, Transcript of synaptotagmin 6, humanhuman

BASIC

Gene SYT6, Length 1,587 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Exosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT6-210ENST00000641643 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
SYT6-210ENST00000641643 SGK2Q9HBY8 427 aa22.93■■□□□ 1.26
SYT6-210ENST00000641643 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
SYT6-210ENST00000641643 SUSD2Q9UGT4 822 aa22.93■■□□□ 1.26
SYT6-210ENST00000641643 CEP192Q8TEP8 1941 aa22.92■■□□□ 1.26
SYT6-210ENST00000641643 PI4KAP42356 2102 aa22.92■■□□□ 1.26
SYT6-210ENST00000641643 FAM72CH0Y354 149 aa22.92■■□□□ 1.26
SYT6-210ENST00000641643 SLC30A4O14863 429 aa22.92■■□□□ 1.26
SYT6-210ENST00000641643 MID1O15344 667 aa22.92■■□□□ 1.26
SYT6-210ENST00000641643 IL1BP01584 269 aa22.92■■□□□ 1.26
SYT6-210ENST00000641643 GNSP15586 552 aa22.92■■□□□ 1.26
SYT6-210ENST00000641643 RHOQP17081 205 aa22.92■■□□□ 1.26
SYT6-210ENST00000641643 ETFBP38117 255 aa22.92■■□□□ 1.26
SYT6-210ENST00000641643 IRX4P78413 519 aa22.92■■□□□ 1.26
SYT6-210ENST00000641643 GNA12Q03113 381 aa22.92■■□□□ 1.26
SYT6-210ENST00000641643 FAM72AQ5TYM5 149 aa22.92■■□□□ 1.26
SYT6-210ENST00000641643 MANEALQ5VSG8 457 aa22.92■■□□□ 1.26
SYT6-210ENST00000641643 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
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SYT6-210ENST00000641643 FAM72DQ6L9T8 149 aa22.92■■□□□ 1.26
SYT6-210ENST00000641643 USP30Q70CQ3 517 aa22.92■■□□□ 1.26
SYT6-210ENST00000641643 DSG4Q86SJ6 1040 aa22.92■■□□□ 1.26
SYT6-210ENST00000641643 FAM72BQ86X60 149 aa22.92■■□□□ 1.26
SYT6-210ENST00000641643 OR7D4Q8NG98 312 aa22.92■■□□□ 1.26
SYT6-210ENST00000641643 OR8D1Q8WZ84 308 aa22.92■■□□□ 1.26
SYT6-210ENST00000641643 FAM129BQ96TA1 746 aa22.92■■□□□ 1.26
SYT6-210ENST00000641643 ISCUQ9H1K1 167 aa22.92■■□□□ 1.26
SYT6-210ENST00000641643 ATP13A1Q9HD20 1204 aa22.92■■□□□ 1.26
SYT6-210ENST00000641643 MYO1AQ9UBC5 1043 aa22.92■■□□□ 1.26
SYT6-210ENST00000641643 VPS51Q9UID3 782 aa22.92■■□□□ 1.26
SYT6-210ENST00000641643 HS3ST2Q9Y278 367 aa22.92■■□□□ 1.26
SYT6-210ENST00000641643 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
SYT6-210ENST00000641643 LNP1A1A4G5 178 aa22.91■■□□□ 1.26
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SYT6-210ENST00000641643 RNF8O76064 485 aa22.91■■□□□ 1.26
SYT6-210ENST00000641643 ADH1BP00325 375 aa22.91■■□□□ 1.26
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SYT6-210ENST00000641643 VAV1P15498 845 aa22.91■■□□□ 1.26
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SYT6-210ENST00000641643 DCAF12L1Q5VU92 463 aa22.91■■□□□ 1.26
SYT6-210ENST00000641643 RETSATQ6NUM9 610 aa22.91■■□□□ 1.26
SYT6-210ENST00000641643 SLC23A3Q6PIS1 610 aa22.91■■□□□ 1.26
SYT6-210ENST00000641643 PSMB7Q99436 277 aa22.91■■□□□ 1.26
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SYT6-210ENST00000641643 DOCK4Q8N1I0 1966 aa22.91■■□□□ 1.26
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SYT6-210ENST00000641643 SRCP12931 536 aa22.9■■□□□ 1.26
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SYT6-210ENST00000641643 CLCN6P51797 869 aa22.9■■□□□ 1.26
SYT6-210ENST00000641643 NUMA1Q14980 2115 aa22.9■■□□□ 1.26
SYT6-210ENST00000641643 ARTNQ5T4W7 220 aa22.9■■□□□ 1.26
SYT6-210ENST00000641643 STPG1Q5TH74 334 aa22.9■■□□□ 1.26
SYT6-210ENST00000641643 FNIP1Q8TF40 1166 aa22.9■■□□□ 1.26
SYT6-210ENST00000641643 CCDC114Q96M63 670 aa22.9■■□□□ 1.26
SYT6-210ENST00000641643 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa22.9■■□□□ 1.26
SYT6-210ENST00000641643 TMEM248Q9NWD8 314 aa22.9■■□□□ 1.26
SYT6-210ENST00000641643 SLC6A14Q9UN76 642 aa22.9■■□□□ 1.26
SYT6-210ENST00000641643 MT-CO1P00395 513 aa22.89■■□□□ 1.26
SYT6-210ENST00000641643 C5AR1P21730 350 aa22.89■■□□□ 1.26
SYT6-210ENST00000641643 EPHB2P29323 1055 aa22.89■■□□□ 1.26
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SYT6-210ENST00000641643 SARM1Q6SZW1 724 aa22.89■■□□□ 1.26
SYT6-210ENST00000641643 Q6ZVU0 165 aa22.89■■□□□ 1.26
SYT6-210ENST00000641643 NLRP14Q86W24 1093 aa22.89■■□□□ 1.26
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SYT6-210ENST00000641643 RAMP2O60895 175 aa22.89■■□□□ 1.25
SYT6-210ENST00000641643 SERPINF2P08697 491 aa22.89■■□□□ 1.25
SYT6-210ENST00000641643 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
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SYT6-210ENST00000641643 ERMP1Q7Z2K6 904 aa22.89■■□□□ 1.25
SYT6-210ENST00000641643 DNASE2BQ8WZ79 361 aa22.89■■□□□ 1.25
SYT6-210ENST00000641643 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
SYT6-210ENST00000641643 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa22.89■■□□□ 1.25
SYT6-210ENST00000641643 TMEM9BQ9NQ34 198 aa22.89■■□□□ 1.25
SYT6-210ENST00000641643 NDFIP2Q9NV92 336 aa22.89■■□□□ 1.25
SYT6-210ENST00000641643 HPCAL4Q9UM19 191 aa22.89■■□□□ 1.25
SYT6-210ENST00000641643 DCDC2BA2VCK2 349 aa22.88■■□□□ 1.25
SYT6-210ENST00000641643 FAM47DPA6NHR8 397 aa22.88■■□□□ 1.25
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