RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639501.1

PMS1-222, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PMS1, Length 2,506 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-222ENST00000639501 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
PMS1-222ENST00000639501 SCUBE3Q8IX30 993 aa20.87■□□□□ 0.93
PMS1-222ENST00000639501 PYROXD2Q8N2H3 581 aa20.87■□□□□ 0.93
PMS1-222ENST00000639501 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
PMS1-222ENST00000639501 FAM110BQ8TC76 370 aa20.87■□□□□ 0.93
PMS1-222ENST00000639501 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
PMS1-222ENST00000639501 CSPG4P5Q96PW8 444 aa20.87■□□□□ 0.93
PMS1-222ENST00000639501 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
PMS1-222ENST00000639501 CPNE1Q99829 537 aa20.87■□□□□ 0.93
PMS1-222ENST00000639501 ADA2Q9NZK5 511 aa20.87■□□□□ 0.93
PMS1-222ENST00000639501 BCAP29Q9UHQ4 241 aa20.87■□□□□ 0.93
PMS1-222ENST00000639501 CLEC11AQ9Y240 323 aa20.87■□□□□ 0.93
PMS1-222ENST00000639501 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
PMS1-222ENST00000639501 LTBP3Q9NS15 1303 aa20.87■□□□□ 0.93
PMS1-222ENST00000639501 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
PMS1-222ENST00000639501 GABBR2O75899 941 aa20.87■□□□□ 0.93
PMS1-222ENST00000639501 SURF1Q15526 300 aa20.87■□□□□ 0.93
PMS1-222ENST00000639501 GK5Q6ZS86 529 aa20.87■□□□□ 0.93
PMS1-222ENST00000639501 SYT17Q9BSW7 474 aa20.87■□□□□ 0.93
PMS1-222ENST00000639501 PDZD7Q9H5P4 517 aa20.87■□□□□ 0.93
PMS1-222ENST00000639501 PLGRKTQ9HBL7 147 aa20.87■□□□□ 0.93
PMS1-222ENST00000639501 NMRAL1Q9HBL8 299 aa20.87■□□□□ 0.93
PMS1-222ENST00000639501 FAM49BQ9NUQ9 324 aa20.87■□□□□ 0.93
PMS1-222ENST00000639501 RAP2CQ9Y3L5 183 aa20.87■□□□□ 0.93
PMS1-222ENST00000639501 AP4S1Q9Y587 144 aa20.87■□□□□ 0.93
PMS1-222ENST00000639501 TMEM233B4DJY2 109 aa20.86■□□□□ 0.93
PMS1-222ENST00000639501 SBK3P0C264 359 aa20.86■□□□□ 0.93
PMS1-222ENST00000639501 VDRP11473 427 aa20.86■□□□□ 0.93
PMS1-222ENST00000639501 GARSP41250 739 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
PMS1-222ENST00000639501 RPL14P50914 215 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
PMS1-222ENST00000639501 NDST1P52848 882 aa20.86■□□□□ 0.93
PMS1-222ENST00000639501 LIMK2P53671 638 aa20.86■□□□□ 0.93
PMS1-222ENST00000639501 PFKPQ01813 784 aa20.86■□□□□ 0.93
PMS1-222ENST00000639501 SLC44A4Q53GD3 710 aa20.86■□□□□ 0.93
PMS1-222ENST00000639501 GRTP1Q5TC63 336 aa20.86■□□□□ 0.93
PMS1-222ENST00000639501 KRT80Q6KB66 452 aa20.86■□□□□ 0.93
PMS1-222ENST00000639501 HMBOX1Q6NT76 420 aa20.86■□□□□ 0.93
PMS1-222ENST00000639501 ANKRD23Q86SG2 305 aa20.86■□□□□ 0.93
PMS1-222ENST00000639501 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
PMS1-222ENST00000639501 CXorf38Q8TB03 319 aa20.86■□□□□ 0.93
PMS1-222ENST00000639501 GIPC3Q8TF64 312 aa20.86■□□□□ 0.93
PMS1-222ENST00000639501 ISOC1Q96CN7 298 aa20.86■□□□□ 0.93
PMS1-222ENST00000639501 TBCBQ99426 244 aa20.86■□□□□ 0.93
PMS1-222ENST00000639501 TRPV6Q9H1D0 765 aa20.86■□□□□ 0.93
PMS1-222ENST00000639501 OXSMQ9NWU1 459 aa20.86■□□□□ 0.93
PMS1-222ENST00000639501 CDC14AQ9UNH5 594 aa20.86■□□□□ 0.93
PMS1-222ENST00000639501 KPNA7A9QM74 516 aa20.86■□□□□ 0.93
PMS1-222ENST00000639501 USP12O75317 370 aa20.86■□□□□ 0.93
PMS1-222ENST00000639501 C2P06681 752 aa20.86■□□□□ 0.93
PMS1-222ENST00000639501 TFEBP19484 476 aa20.86■□□□□ 0.93
PMS1-222ENST00000639501 GRIA4P48058 902 aa20.86■□□□□ 0.93
PMS1-222ENST00000639501 RALGDSQ12967 914 aa20.86■□□□□ 0.93
PMS1-222ENST00000639501 DPYSL2Q16555 572 aa20.86■□□□□ 0.93
PMS1-222ENST00000639501 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa20.86■□□□□ 0.93
PMS1-222ENST00000639501 CDHR1Q96JP9 859 aa20.86■□□□□ 0.93
PMS1-222ENST00000639501 OSBPL11Q9BXB4 747 aa20.86■□□□□ 0.93
PMS1-222ENST00000639501 TANC1Q9C0D5 1861 aa20.86■□□□□ 0.93
PMS1-222ENST00000639501 ZNF232Q9UNY5 417 aa20.86■□□□□ 0.93
PMS1-222ENST00000639501 SNX13Q9Y5W8 968 aa20.86■□□□□ 0.93
PMS1-222ENST00000639501 LCTP09848 1927 aa20.86■□□□□ 0.93
PMS1-222ENST00000639501 SCN4AP35499 1836 aa20.86■□□□□ 0.93
PMS1-222ENST00000639501 KCNU1A8MYU2 1149 aa20.85■□□□□ 0.93
PMS1-222ENST00000639501 RNF103O00237 685 aa20.85■□□□□ 0.93
PMS1-222ENST00000639501 TRIM38O00635 465 aa20.85■□□□□ 0.93
PMS1-222ENST00000639501 PROZP22891 400 aa20.85■□□□□ 0.93
PMS1-222ENST00000639501 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa20.85■□□□□ 0.93
PMS1-222ENST00000639501 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
PMS1-222ENST00000639501 DPYSQ14117 519 aa20.85■□□□□ 0.93
PMS1-222ENST00000639501 KIZQ2M2Z5 673 aa20.85■□□□□ 0.93
PMS1-222ENST00000639501 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa20.85■□□□□ 0.93
PMS1-222ENST00000639501 EML3Q32P44 896 aa20.85■□□□□ 0.93
PMS1-222ENST00000639501 MPZL3Q6UWV2 235 aa20.85■□□□□ 0.93
PMS1-222ENST00000639501 CCDC185Q8N715 623 aa20.85■□□□□ 0.93
PMS1-222ENST00000639501 SLC7A14Q8TBB6 771 aa20.85■□□□□ 0.93
PMS1-222ENST00000639501 CLEC4CQ8WTT0 213 aa20.85■□□□□ 0.93
PMS1-222ENST00000639501 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
PMS1-222ENST00000639501 EFCAB1Q9HAE3 211 aa20.85■□□□□ 0.93
PMS1-222ENST00000639501 PNPLA3Q9NST1 481 aa20.85■□□□□ 0.93
PMS1-222ENST00000639501 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
PMS1-222ENST00000639501 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa20.85■□□□□ 0.93
PMS1-222ENST00000639501 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
PMS1-222ENST00000639501 MFSD11O43934 449 aa20.85■□□□□ 0.93
PMS1-222ENST00000639501 TADA2AO75478 443 aa20.85■□□□□ 0.93
PMS1-222ENST00000639501 GOT1P17174 413 aa20.85■□□□□ 0.93
PMS1-222ENST00000639501 CKMT2P17540 419 aa20.85■□□□□ 0.93
PMS1-222ENST00000639501 GABRB3P28472 473 aa20.85■□□□□ 0.93
PMS1-222ENST00000639501 EPHX2P34913 555 aa20.85■□□□□ 0.93
PMS1-222ENST00000639501 PHKA2P46019 1235 aa20.85■□□□□ 0.93
PMS1-222ENST00000639501 EFNA5P52803 228 aa20.85■□□□□ 0.93
PMS1-222ENST00000639501 JADE1Q6IE81 842 aa20.85■□□□□ 0.93
PMS1-222ENST00000639501 CROCCP3Q8IVE0 287 aa20.85■□□□□ 0.93
PMS1-222ENST00000639501 FAM47BQ8NA70 645 aa20.85■□□□□ 0.93
PMS1-222ENST00000639501 URGCPQ8TCY9 931 aa20.85■□□□□ 0.93
PMS1-222ENST00000639501 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
PMS1-222ENST00000639501 ASB9Q96DX5 294 aa20.85■□□□□ 0.93
PMS1-222ENST00000639501 PTPRHQ9HD43 1115 aa20.85■□□□□ 0.93
PMS1-222ENST00000639501 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
PMS1-222ENST00000639501 SEPT10Q9P0V9 454 aa20.85■□□□□ 0.93
PMS1-222ENST00000639501 AP4E1Q9UPM8 1137 aa20.85■□□□□ 0.93
PMS1-222ENST00000639501 SQORQ9Y6N5 450 aa20.85■□□□□ 0.93
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