RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000630804.2

SPTAN1-222, Transcript of spectrin alpha, non-erythrocytic 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SPTAN1, Length 7,812 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1-222ENST00000630804 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
SPTAN1-222ENST00000630804 TGFB3P10600 412 aa8.35□□□□□ -1.07
SPTAN1-222ENST00000630804 FOSL1P15407 271 aa8.35□□□□□ -1.07
SPTAN1-222ENST00000630804 RAG1P15918 1043 aa8.35□□□□□ -1.07
SPTAN1-222ENST00000630804 ERCC2P18074 760 aa8.35□□□□□ -1.07
SPTAN1-222ENST00000630804 UGT1A5P35504 534 aa8.35□□□□□ -1.07
SPTAN1-222ENST00000630804 CAP2P40123 477 aa8.35□□□□□ -1.07
SPTAN1-222ENST00000630804 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP8.35□□□□□ -1.071e-7■■■■□ 24.7
SPTAN1-222ENST00000630804 SCNN1BP51168 640 aa8.35□□□□□ -1.07
SPTAN1-222ENST00000630804 SPIDRQ14159 915 aa8.35□□□□□ -1.07
SPTAN1-222ENST00000630804 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
SPTAN1-222ENST00000630804 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
SPTAN1-222ENST00000630804 CBWD3Q5JTY5 395 aa8.35□□□□□ -1.07
SPTAN1-222ENST00000630804 CBWD5Q5RIA9 395 aa8.35□□□□□ -1.07
SPTAN1-222ENST00000630804 ATG4CQ96DT6 458 aa8.35□□□□□ -1.07
SPTAN1-222ENST00000630804 PHF21BQ96EK2 531 aa8.35□□□□□ -1.07
SPTAN1-222ENST00000630804 VPS45Q9NRW7 570 aa8.35□□□□□ -1.07
SPTAN1-222ENST00000630804 CKLFQ9UBR5 152 aa8.35□□□□□ -1.07
SPTAN1-222ENST00000630804 TUBE1Q9UJT0 475 aa8.35□□□□□ -1.07
SPTAN1-222ENST00000630804 NUP50Q9UKX7 468 aa8.35□□□□□ -1.07
SPTAN1-222ENST00000630804 NR2E3Q9Y5X4 410 aa8.35□□□□□ -1.07
SPTAN1-222ENST00000630804 THP07101 528 aa8.35□□□□□ -1.07
SPTAN1-222ENST00000630804 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
SPTAN1-222ENST00000630804 KCNMA1Q12791 1236 aa8.35□□□□□ -1.07
SPTAN1-222ENST00000630804 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
SPTAN1-222ENST00000630804 BOLA3Q53S33 107 aa8.35□□□□□ -1.07
SPTAN1-222ENST00000630804 OR5T3Q8NGG3 340 aa8.35□□□□□ -1.07
SPTAN1-222ENST00000630804 UBA3Q8TBC4 463 aa8.35□□□□□ -1.07
SPTAN1-222ENST00000630804 FEZF2Q8TBJ5 459 aa8.35□□□□□ -1.07
SPTAN1-222ENST00000630804 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa8.35□□□□□ -1.07
SPTAN1-222ENST00000630804 MARCH7Q9H992 704 aa8.35□□□□□ -1.07
SPTAN1-222ENST00000630804 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
SPTAN1-222ENST00000630804 DPP3Q9NY33 737 aa8.35□□□□□ -1.07
SPTAN1-222ENST00000630804 SSR3Q9UNL2 185 aa8.35□□□□□ -1.07
SPTAN1-222ENST00000630804 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
SPTAN1-222ENST00000630804 SEC22BO75396 215 aa8.35□□□□□ -1.07
SPTAN1-222ENST00000630804 CCNB2O95067 398 aa8.35□□□□□ -1.07
SPTAN1-222ENST00000630804 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
SPTAN1-222ENST00000630804 SLC26A3P40879 764 aa8.35□□□□□ -1.07
SPTAN1-222ENST00000630804 NAMPTP43490 491 aa8.35□□□□□ -1.07
SPTAN1-222ENST00000630804 ADSSL1Q8N142 457 aa8.35□□□□□ -1.07
SPTAN1-222ENST00000630804 WDR24Q96S15 920 aa8.35□□□□□ -1.07
SPTAN1-222ENST00000630804 GANQ9H2C0 597 aa8.35□□□□□ -1.07
SPTAN1-222ENST00000630804 LRRC40Q9H9A6 602 aa8.35□□□□□ -1.07
SPTAN1-222ENST00000630804 TCF7L2Q9NQB0 619 aa8.35□□□□□ -1.07
SPTAN1-222ENST00000630804 DDIT4Q9NX09 232 aa8.35□□□□□ -1.07
SPTAN1-222ENST00000630804 ETAA1Q9NY74 926 aa8.35□□□□□ -1.07
SPTAN1-222ENST00000630804 CRYL1Q9Y2S2 319 aa8.35□□□□□ -1.07
SPTAN1-222ENST00000630804 MCIDASD6RGH6 385 aa8.35□□□□□ -1.07
SPTAN1-222ENST00000630804 TRIM38O00635 465 aa8.35□□□□□ -1.07
SPTAN1-222ENST00000630804 TEX33O43247 280 aa8.35□□□□□ -1.07
SPTAN1-222ENST00000630804 COMTP21964 271 aa8.35□□□□□ -1.07
SPTAN1-222ENST00000630804 CDH3P22223 829 aa8.35□□□□□ -1.07
SPTAN1-222ENST00000630804 POLD2P49005 469 aa8.35□□□□□ -1.07
SPTAN1-222ENST00000630804 PTPAQ15257 358 aa8.35□□□□□ -1.07
SPTAN1-222ENST00000630804 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP8.35□□□□□ -1.07
SPTAN1-222ENST00000630804 CARNMT1Q8N4J0 409 aa8.35□□□□□ -1.07
SPTAN1-222ENST00000630804 FATE1Q969F0 183 aa8.35□□□□□ -1.07
SPTAN1-222ENST00000630804 FBXO32Q969P5 355 aa8.35□□□□□ -1.07
SPTAN1-222ENST00000630804 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa8.35□□□□□ -1.07
SPTAN1-222ENST00000630804 PSME2Q9UL46 239 aa8.35□□□□□ -1.07
SPTAN1-222ENST00000630804 CDH9Q9ULB4 789 aa8.35□□□□□ -1.07
SPTAN1-222ENST00000630804 TRIM17Q9Y577 477 aa8.35□□□□□ -1.07
SPTAN1-222ENST00000630804 ABCA9Q8IUA7 1624 aa8.35□□□□□ -1.07
SPTAN1-222ENST00000630804 PRLP01236 227 aa8.35□□□□□ -1.07
SPTAN1-222ENST00000630804 PAX7P23759 505 aa8.35□□□□□ -1.07
SPTAN1-222ENST00000630804 LHX1P48742 406 aa8.35□□□□□ -1.07
SPTAN1-222ENST00000630804 CAV3P56539 151 aa8.35□□□□□ -1.07
SPTAN1-222ENST00000630804 SGCGQ13326 291 aa8.35□□□□□ -1.07
SPTAN1-222ENST00000630804 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
SPTAN1-222ENST00000630804 GPAT2Q6NUI2 795 aa8.35□□□□□ -1.07
SPTAN1-222ENST00000630804 LRRC34Q8IZ02 419 aa8.35□□□□□ -1.07
SPTAN1-222ENST00000630804 TMEM159Q96B96 161 aa8.35□□□□□ -1.07
SPTAN1-222ENST00000630804 ISCUQ9H1K1 167 aa8.35□□□□□ -1.07
SPTAN1-222ENST00000630804 RXFP1Q9HBX9 757 aa8.35□□□□□ -1.07
SPTAN1-222ENST00000630804 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP8.35□□□□□ -1.071e-6■■□□□ 12.7
SPTAN1-222ENST00000630804 OGTO15294 1046 aa8.34□□□□□ -1.07
SPTAN1-222ENST00000630804 KRT36O76013 467 aa8.34□□□□□ -1.07
SPTAN1-222ENST00000630804 KCNH1O95259 989 aa8.34□□□□□ -1.07
SPTAN1-222ENST00000630804 RPL9P32969 192 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
SPTAN1-222ENST00000630804 TTKP33981 857 aa8.34□□□□□ -1.07
SPTAN1-222ENST00000630804 CSHL1Q14406 222 aa8.34□□□□□ -1.07
SPTAN1-222ENST00000630804 CLEC17AQ6ZS10 378 aa8.34□□□□□ -1.07
SPTAN1-222ENST00000630804 AKAP14Q86UN6 197 aa8.34□□□□□ -1.07
SPTAN1-222ENST00000630804 COL26A1Q96A83 441 aa8.34□□□□□ -1.07
SPTAN1-222ENST00000630804 GNPTGQ9UJJ9 305 aa8.34□□□□□ -1.07
SPTAN1-222ENST00000630804 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
SPTAN1-222ENST00000630804 A0A0G2JPF8 293 aa8.34□□□□□ -1.07
SPTAN1-222ENST00000630804 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa8.34□□□□□ -1.07
SPTAN1-222ENST00000630804 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa8.34□□□□□ -1.07
SPTAN1-222ENST00000630804 M0QYT0 321 aa8.34□□□□□ -1.07
SPTAN1-222ENST00000630804 ENDOD1O94919 500 aa8.34□□□□□ -1.07
SPTAN1-222ENST00000630804 NTSR2O95665 410 aa8.34□□□□□ -1.07
SPTAN1-222ENST00000630804 DBIP07108 87 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
SPTAN1-222ENST00000630804 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa8.34□□□□□ -1.07
SPTAN1-222ENST00000630804 MYBP10242 640 aa8.34□□□□□ -1.07
SPTAN1-222ENST00000630804 ATF6P18850 670 aa8.34□□□□□ -1.07
SPTAN1-222ENST00000630804 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
SPTAN1-222ENST00000630804 FAM83AQ86UY5 434 aa8.34□□□□□ -1.07
SPTAN1-222ENST00000630804 TRPV1Q8NER1 839 aa8.34□□□□□ -1.07
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