RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619438.4

SGMS1-210, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SGMS1, Length 1,680 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-210ENST00000619438 CFAP97Q9P2B7 532 aa22.11■■□□□ 1.13
SGMS1-210ENST00000619438 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
SGMS1-210ENST00000619438 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa22.1■■□□□ 1.13
SGMS1-210ENST00000619438 TBX18O95935 607 aa22.1■■□□□ 1.13
SGMS1-210ENST00000619438 ARSAP15289 507 aa22.1■■□□□ 1.13
SGMS1-210ENST00000619438 TCF3P15923 654 aa22.1■■□□□ 1.13
SGMS1-210ENST00000619438 TARSP26639 723 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
SGMS1-210ENST00000619438 PLA2G5P39877 138 aa22.1■■□□□ 1.13
SGMS1-210ENST00000619438 USP4Q13107 963 aa22.1■■□□□ 1.13
SGMS1-210ENST00000619438 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
SGMS1-210ENST00000619438 NAT8LQ8N9F0 302 aa22.1■■□□□ 1.13
SGMS1-210ENST00000619438 DTWD2Q8NBA8 298 aa22.1■■□□□ 1.13
SGMS1-210ENST00000619438 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
SGMS1-210ENST00000619438 ATP2A3Q93084 1043 aa22.1■■□□□ 1.13
SGMS1-210ENST00000619438 C9orf72Q96LT7 481 aa22.1■■□□□ 1.13
SGMS1-210ENST00000619438 LINC00597Q9H2U6 94 aa22.1■■□□□ 1.13
SGMS1-210ENST00000619438 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
SGMS1-210ENST00000619438 MIA3Q5JRA6 1907 aa22.09■■□□□ 1.13
SGMS1-210ENST00000619438 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
SGMS1-210ENST00000619438 IFNB1P01574 187 aa22.09■■□□□ 1.13
SGMS1-210ENST00000619438 TGM2P21980 687 aa22.09■■□□□ 1.13
SGMS1-210ENST00000619438 RPL22P35268 128 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
SGMS1-210ENST00000619438 GDF10P55107 478 aa22.09■■□□□ 1.13
SGMS1-210ENST00000619438 NR1H3Q13133 447 aa22.09■■□□□ 1.13
SGMS1-210ENST00000619438 RAB41Q5JT25 222 aa22.09■■□□□ 1.13
SGMS1-210ENST00000619438 TADA2BQ86TJ2 420 aa22.09■■□□□ 1.13
SGMS1-210ENST00000619438 SCUBE3Q8IX30 993 aa22.09■■□□□ 1.13
SGMS1-210ENST00000619438 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa22.09■■□□□ 1.13
SGMS1-210ENST00000619438 ARHGAP18Q8N392 663 aa22.09■■□□□ 1.13
SGMS1-210ENST00000619438 CPA6Q8N4T0 437 aa22.09■■□□□ 1.13
SGMS1-210ENST00000619438 FAM172AQ8WUF8 416 aa22.09■■□□□ 1.13
SGMS1-210ENST00000619438 FAF2Q96CS3 445 aa22.09■■□□□ 1.13
SGMS1-210ENST00000619438 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
SGMS1-210ENST00000619438 NMUR1Q9HB89 426 aa22.09■■□□□ 1.13
SGMS1-210ENST00000619438 HPS4Q9NQG7 708 aa22.09■■□□□ 1.13
SGMS1-210ENST00000619438 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa22.09■■□□□ 1.13
SGMS1-210ENST00000619438 FAM169AQ9Y6X4 670 aa22.09■■□□□ 1.13
SGMS1-210ENST00000619438 VPS13AQ96RL7 3174 aa22.09■■□□□ 1.13
SGMS1-210ENST00000619438 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa22.09■■□□□ 1.13
SGMS1-210ENST00000619438 MYO1CO00159 1063 aa22.08■■□□□ 1.13
SGMS1-210ENST00000619438 PIK3R2O00459 728 aa22.08■■□□□ 1.13
SGMS1-210ENST00000619438 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
SGMS1-210ENST00000619438 ZBED1O96006 694 aa22.08■■□□□ 1.13
SGMS1-210ENST00000619438 RBP3P10745 1247 aa22.08■■□□□ 1.13
SGMS1-210ENST00000619438 CTHP32929 405 aa22.08■■□□□ 1.13
SGMS1-210ENST00000619438 C10orf120Q5SQS8 335 aa22.08■■□□□ 1.13
SGMS1-210ENST00000619438 CPT1BQ92523 772 aa22.08■■□□□ 1.13
SGMS1-210ENST00000619438 CHMP6Q96FZ7 201 aa22.08■■□□□ 1.13
SGMS1-210ENST00000619438 ZNF670Q9BS34 389 aa22.08■■□□□ 1.13
SGMS1-210ENST00000619438 ECT2Q9H8V3 914 aa22.08■■□□□ 1.13
SGMS1-210ENST00000619438 OSER1Q9NX31 292 aa22.08■■□□□ 1.13
SGMS1-210ENST00000619438 FETUBQ9UGM5 382 aa22.08■■□□□ 1.13
SGMS1-210ENST00000619438 NUDT5Q9UKK9 219 aa22.08■■□□□ 1.13
SGMS1-210ENST00000619438 MYO15AQ9UKN7 3530 aa22.08■■□□□ 1.13
SGMS1-210ENST00000619438 E7ESA3 106 aa22.07■■□□□ 1.12
SGMS1-210ENST00000619438 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
SGMS1-210ENST00000619438 GRAP2O75791 330 aa22.07■■□□□ 1.12
SGMS1-210ENST00000619438 LCP1P13796 627 aa22.07■■□□□ 1.12
SGMS1-210ENST00000619438 TSHRP16473 764 aa22.07■■□□□ 1.12
SGMS1-210ENST00000619438 DRD4P21917 467 aa22.07■■□□□ 1.12
SGMS1-210ENST00000619438 IL4RP24394 825 aa22.07■■□□□ 1.12
SGMS1-210ENST00000619438 ADIGQ0VDE8 80 aa22.07■■□□□ 1.12
SGMS1-210ENST00000619438 KRT81Q14533 505 aa22.07■■□□□ 1.12
SGMS1-210ENST00000619438 HIF1AQ16665 826 aa22.07■■□□□ 1.12
SGMS1-210ENST00000619438 SLC9A4Q6AI14 798 aa22.07■■□□□ 1.12
SGMS1-210ENST00000619438 UNC45BQ8IWX7 931 aa22.07■■□□□ 1.12
SGMS1-210ENST00000619438 P3H4Q92791 437 aa22.07■■□□□ 1.12
SGMS1-210ENST00000619438 RTP4Q96DX8 246 aa22.07■■□□□ 1.12
SGMS1-210ENST00000619438 ULBP1Q9BZM6 244 aa22.07■■□□□ 1.12
SGMS1-210ENST00000619438 LMAN1LQ9HAT1 526 aa22.07■■□□□ 1.12
SGMS1-210ENST00000619438 PCDH18Q9HCL0 1135 aa22.07■■□□□ 1.12
SGMS1-210ENST00000619438 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP22.07■■□□□ 1.12
SGMS1-210ENST00000619438 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa22.07■■□□□ 1.12
SGMS1-210ENST00000619438 COL4A2P08572 1712 aa22.07■■□□□ 1.12
SGMS1-210ENST00000619438 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
SGMS1-210ENST00000619438 SHISA7A6NL88 538 aa22.07■■□□□ 1.12
SGMS1-210ENST00000619438 NFATC1O95644 943 aa22.07■■□□□ 1.12
SGMS1-210ENST00000619438 IRF1P10914 325 aa22.07■■□□□ 1.12
SGMS1-210ENST00000619438 PTPN5P54829 565 aa22.07■■□□□ 1.12
SGMS1-210ENST00000619438 HDAC4P56524 1084 aa22.07■■□□□ 1.12
SGMS1-210ENST00000619438 TCF15Q12870 199 aa22.07■■□□□ 1.12
SGMS1-210ENST00000619438 MMRN1Q13201 1228 aa22.07■■□□□ 1.12
SGMS1-210ENST00000619438 EML3Q32P44 896 aa22.07■■□□□ 1.12
SGMS1-210ENST00000619438 RAB6CQ53S08 254 aa22.07■■□□□ 1.12
SGMS1-210ENST00000619438 SCD5Q86SK9 330 aa22.07■■□□□ 1.12
SGMS1-210ENST00000619438 KCTD13Q8WZ19 329 aa22.07■■□□□ 1.12
SGMS1-210ENST00000619438 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
SGMS1-210ENST00000619438 RAB6CQ9H0N0 254 aa22.07■■□□□ 1.12
SGMS1-210ENST00000619438 CLIC5Q9NZA1 410 aa22.07■■□□□ 1.12
SGMS1-210ENST00000619438 DNMT3LQ9UJW3 386 aa22.07■■□□□ 1.12
SGMS1-210ENST00000619438 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
SGMS1-210ENST00000619438 E2F8A0AVK6 867 aa22.06■■□□□ 1.12
SGMS1-210ENST00000619438 CFAP69A5D8W1 941 aa22.06■■□□□ 1.12
SGMS1-210ENST00000619438 H0Y858 1186 aa22.06■■□□□ 1.12
SGMS1-210ENST00000619438 ARL4CP56559 192 aa22.06■■□□□ 1.12
SGMS1-210ENST00000619438 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP22.06■■□□□ 1.12
SGMS1-210ENST00000619438 ATP11AP98196 1134 aa22.06■■□□□ 1.12
SGMS1-210ENST00000619438 PON2Q15165 354 aa22.06■■□□□ 1.12
SGMS1-210ENST00000619438 CDO1Q16878 200 aa22.06■■□□□ 1.12
SGMS1-210ENST00000619438 PM20D1Q6GTS8 502 aa22.06■■□□□ 1.12
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