RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617451.4

PTPRF-216, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRF, Length 1,129 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-216ENST00000617451 PASD1Q8IV76 773 aa25.62■■□□□ 1.69
PTPRF-216ENST00000617451 HS3ST4Q9Y661 456 aa25.62■■□□□ 1.69
PTPRF-216ENST00000617451 MAGEC1O60732 1142 aa25.61■■□□□ 1.69
PTPRF-216ENST00000617451 NME3Q13232 169 aa25.61■■□□□ 1.69
PTPRF-216ENST00000617451 C5orf22Q49AR2 442 aa25.61■■□□□ 1.69
PTPRF-216ENST00000617451 OLFML1Q6UWY5 402 aa25.61■■□□□ 1.69
PTPRF-216ENST00000617451 GBP6Q6ZN66 633 aa25.61■■□□□ 1.69
PTPRF-216ENST00000617451 Q6ZVU0 165 aa25.61■■□□□ 1.69
PTPRF-216ENST00000617451 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa25.61■■□□□ 1.69
PTPRF-216ENST00000617451 NXPE2Q96DL1 559 aa25.61■■□□□ 1.69
PTPRF-216ENST00000617451 VPS28Q9UK41 221 aa25.61■■□□□ 1.69
PTPRF-216ENST00000617451 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa25.61■■□□□ 1.69
PTPRF-216ENST00000617451 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa25.6■■□□□ 1.69
PTPRF-216ENST00000617451 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP25.6■■□□□ 1.69
PTPRF-216ENST00000617451 PAGE1O75459 146 aa25.6■■□□□ 1.69
PTPRF-216ENST00000617451 CLDN11O75508 207 aa25.6■■□□□ 1.69
PTPRF-216ENST00000617451 STAT4Q14765 748 aa25.6■■□□□ 1.69
PTPRF-216ENST00000617451 POM121L1PQ3SYA9 428 aa25.6■■□□□ 1.69
PTPRF-216ENST00000617451 C6orf118Q5T5N4 469 aa25.6■■□□□ 1.69
PTPRF-216ENST00000617451 FBXL19Q6PCT2 694 aa25.6■■□□□ 1.69
PTPRF-216ENST00000617451 C14orf80Q86SX3 495 aa25.6■■□□□ 1.69
PTPRF-216ENST00000617451 SH2D3CQ8N5H7 860 aa25.6■■□□□ 1.69
PTPRF-216ENST00000617451 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP25.6■■□□□ 1.69
PTPRF-216ENST00000617451 NOX5Q96PH1 765 aa25.6■■□□□ 1.69
PTPRF-216ENST00000617451 RWDD2AQ9UIY3 292 aa25.6■■□□□ 1.69
PTPRF-216ENST00000617451 ERBB2P04626 1255 aa25.59■■□□□ 1.69
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF18P17022 549 aa25.59■■□□□ 1.69
PTPRF-216ENST00000617451 GGCXP38435 758 aa25.59■■□□□ 1.69
PTPRF-216ENST00000617451 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP25.59■■□□□ 1.693e-6■■■■□ 20.1
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PTPRF-216ENST00000617451 EXOC3L4Q17RC7 722 aa25.59■■□□□ 1.69
PTPRF-216ENST00000617451 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP25.59■■□□□ 1.69
PTPRF-216ENST00000617451 HES3Q5TGS1 186 aa25.59■■□□□ 1.69
PTPRF-216ENST00000617451 SMYD5Q6GMV2 418 aa25.59■■□□□ 1.69
PTPRF-216ENST00000617451 OR6B2Q6IFH4 312 aa25.59■■□□□ 1.69
PTPRF-216ENST00000617451 SLC26A9Q7LBE3 791 aa25.59■■□□□ 1.69
PTPRF-216ENST00000617451 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP25.59■■□□□ 1.69
PTPRF-216ENST00000617451 PREBQ9HCU5 417 aa25.59■■□□□ 1.69
PTPRF-216ENST00000617451 HS3ST2Q9Y278 367 aa25.59■■□□□ 1.69
PTPRF-216ENST00000617451 DOCK9Q9BZ29 2069 aa25.59■■□□□ 1.69
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PTPRF-216ENST00000617451 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa25.58■■□□□ 1.69
PTPRF-216ENST00000617451 M0QYT0 321 aa25.58■■□□□ 1.69
PTPRF-216ENST00000617451 DAB1O75553 588 aa25.58■■□□□ 1.69
PTPRF-216ENST00000617451 CKMT2P17540 419 aa25.58■■□□□ 1.69
PTPRF-216ENST00000617451 PON1P27169 355 aa25.58■■□□□ 1.69
PTPRF-216ENST00000617451 NOS2P35228 1153 aa25.58■■□□□ 1.69
PTPRF-216ENST00000617451 CDH4P55283 916 aa25.58■■□□□ 1.69
PTPRF-216ENST00000617451 TAS2R38P59533 333 aa25.58■■□□□ 1.69
PTPRF-216ENST00000617451 SLC6A3Q01959 620 aa25.58■■□□□ 1.69
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PTPRF-216ENST00000617451 CRELD1Q96HD1 420 aa25.58■■□□□ 1.69
PTPRF-216ENST00000617451 SIK2Q9H0K1 926 aa25.58■■□□□ 1.69
PTPRF-216ENST00000617451 MT-CO1P00395 513 aa25.57■■□□□ 1.68
PTPRF-216ENST00000617451 SNX16P57768 344 aa25.57■■□□□ 1.68
PTPRF-216ENST00000617451 PTPN20Q4JDL3 420 aa25.57■■□□□ 1.68
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PTPRF-216ENST00000617451 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP25.57■■□□□ 1.68
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PTPRF-216ENST00000617451 CNTN5O94779 1100 aa25.56■■□□□ 1.68
PTPRF-216ENST00000617451 CTSLP07711 333 aa25.56■■□□□ 1.68
PTPRF-216ENST00000617451 SRCP12931 536 aa25.56■■□□□ 1.68
PTPRF-216ENST00000617451 KRT9P35527 623 aa25.56■■□□□ 1.68
PTPRF-216ENST00000617451 RTP5Q14D33 572 aa25.56■■□□□ 1.68
PTPRF-216ENST00000617451 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa25.56■■□□□ 1.68
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PTPRF-216ENST00000617451 TMEM145Q8NBT3 493 aa25.56■■□□□ 1.68
PTPRF-216ENST00000617451 KLHDC7BQ96G42 594 aa25.56■■□□□ 1.68
PTPRF-216ENST00000617451 PSMB7Q99436 277 aa25.56■■□□□ 1.68
PTPRF-216ENST00000617451 NPY6RQ99463 290 aa25.56■■□□□ 1.68
PTPRF-216ENST00000617451 NRSN2Q9GZP1 204 aa25.56■■□□□ 1.68
PTPRF-216ENST00000617451 ANLNQ9NQW6 1124 aa25.56■■□□□ 1.68
PTPRF-216ENST00000617451 PIGVQ9NUD9 493 aa25.56■■□□□ 1.68
PTPRF-216ENST00000617451 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa25.56■■□□□ 1.68
PTPRF-216ENST00000617451 RRN3Q9NYV6 651 aa25.56■■□□□ 1.68
PTPRF-216ENST00000617451 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP25.56■■□□□ 1.68
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PTPRF-216ENST00000617451 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP25.55■■□□□ 1.68
PTPRF-216ENST00000617451 SDC3O75056 442 aa25.55■■□□□ 1.68
PTPRF-216ENST00000617451 ADCY5O95622 1261 aa25.55■■□□□ 1.68
PTPRF-216ENST00000617451 CLCN1P35523 988 aa25.55■■□□□ 1.68
PTPRF-216ENST00000617451 CXCR3P49682 368 aa25.55■■□□□ 1.68
PTPRF-216ENST00000617451 KRT83P78385 493 aa25.55■■□□□ 1.68
PTPRF-216ENST00000617451 SEMG2Q02383 582 aa25.55■■□□□ 1.68
PTPRF-216ENST00000617451 PROX2Q3B8N5 592 aa25.55■■□□□ 1.68
PTPRF-216ENST00000617451 ALFQ53S48 1182 aa25.55■■□□□ 1.68
PTPRF-216ENST00000617451 NEK5Q6P3R8 708 aa25.55■■□□□ 1.68
PTPRF-216ENST00000617451 SLC47A2Q86VL8 602 aa25.55■■□□□ 1.68
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF683Q8IZ20 524 aa25.55■■□□□ 1.68
PTPRF-216ENST00000617451 ATP11CQ8NB49 1132 aa25.55■■□□□ 1.68
PTPRF-216ENST00000617451 OR2A12Q8NGT7 310 aa25.55■■□□□ 1.68
PTPRF-216ENST00000617451 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP25.55■■□□□ 1.68
PTPRF-216ENST00000617451 TKTL2Q9H0I9 626 aa25.55■■□□□ 1.68
PTPRF-216ENST00000617451 WDCPQ9H6R7 721 aa25.55■■□□□ 1.68
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PTPRF-216ENST00000617451 SIX2Q9NPC8 291 aa25.55■■□□□ 1.68
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