RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532751.1

PTPRK-222, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 4

Gene PTPRK, Length 563 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-222ENST00000532751 OXTRP30559 389 aa22.48■■□□□ 1.19
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PTPRK-222ENST00000532751 SPDYCQ5MJ68 293 aa22.48■■□□□ 1.19
PTPRK-222ENST00000532751 C9orf64Q5T6V5 341 aa22.48■■□□□ 1.19
PTPRK-222ENST00000532751 DCLK2Q8N568 766 aa22.48■■□□□ 1.19
PTPRK-222ENST00000532751 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
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PTPRK-222ENST00000532751 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
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PTPRK-222ENST00000532751 RHOT2Q8IXI1 618 aa22.45■■□□□ 1.18
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PTPRK-222ENST00000532751 H3BRJ5 948 aa22.43■■□□□ 1.18
PTPRK-222ENST00000532751 ALOX15BO15296 676 aa22.43■■□□□ 1.18
PTPRK-222ENST00000532751 BNIP3LO60238 219 aa22.43■■□□□ 1.18
PTPRK-222ENST00000532751 ADH1BP00325 375 aa22.43■■□□□ 1.18
PTPRK-222ENST00000532751 RARAP10276 462 aa22.43■■□□□ 1.18
PTPRK-222ENST00000532751 VAV1P15498 845 aa22.43■■□□□ 1.18
PTPRK-222ENST00000532751 GOT1P17174 413 aa22.43■■□□□ 1.18
PTPRK-222ENST00000532751 MAGEA1P43355 309 aa22.43■■□□□ 1.18
PTPRK-222ENST00000532751 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
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