RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505941.5

SH3BP2-210, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 917 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-210ENST00000505941 LRIG2O94898 1065 aa21.6■■□□□ 1.05
SH3BP2-210ENST00000505941 IL1BP01584 269 aa21.6■■□□□ 1.05
SH3BP2-210ENST00000505941 CFIP05156 583 aa21.6■■□□□ 1.05
SH3BP2-210ENST00000505941 SLC8A1P32418 973 aa21.6■■□□□ 1.05
SH3BP2-210ENST00000505941 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
SH3BP2-210ENST00000505941 GNA12Q03113 381 aa21.6■■□□□ 1.05
SH3BP2-210ENST00000505941 CST6Q15828 149 aa21.6■■□□□ 1.05
SH3BP2-210ENST00000505941 TRIM61Q5EBN2 209 aa21.6■■□□□ 1.05
SH3BP2-210ENST00000505941 FAM46CQ5VWP2 391 aa21.6■■□□□ 1.05
SH3BP2-210ENST00000505941 SH2D3CQ8N5H7 860 aa21.6■■□□□ 1.05
SH3BP2-210ENST00000505941 FNIP1Q8TF40 1166 aa21.6■■□□□ 1.05
SH3BP2-210ENST00000505941 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
SH3BP2-210ENST00000505941 DEF6Q9H4E7 631 aa21.6■■□□□ 1.05
SH3BP2-210ENST00000505941 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa21.6■■□□□ 1.05
SH3BP2-210ENST00000505941 VPS51Q9UID3 782 aa21.6■■□□□ 1.05
SH3BP2-210ENST00000505941 FZD10Q9ULW2 581 aa21.6■■□□□ 1.05
SH3BP2-210ENST00000505941 HS3ST2Q9Y278 367 aa21.6■■□□□ 1.05
SH3BP2-210ENST00000505941 A0A0D9SEW6 157 aa21.59■■□□□ 1.05
SH3BP2-210ENST00000505941 CREB3O43889 395 aa21.59■■□□□ 1.05
SH3BP2-210ENST00000505941 BNIP3LO60238 219 aa21.59■■□□□ 1.05
SH3BP2-210ENST00000505941 PRPSAP2O60256 369 aa21.59■■□□□ 1.05
SH3BP2-210ENST00000505941 C7P10643 843 aa21.59■■□□□ 1.05
SH3BP2-210ENST00000505941 C5AR1P21730 350 aa21.59■■□□□ 1.05
SH3BP2-210ENST00000505941 EPHB2P29323 1055 aa21.59■■□□□ 1.05
SH3BP2-210ENST00000505941 PSMD8P48556 350 aa21.59■■□□□ 1.05
SH3BP2-210ENST00000505941 CLCN6P51797 869 aa21.59■■□□□ 1.05
SH3BP2-210ENST00000505941 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
SH3BP2-210ENST00000505941 CCDC122Q5T0U0 273 aa21.59■■□□□ 1.05
SH3BP2-210ENST00000505941 ZNF354CQ86Y25 554 aa21.59■■□□□ 1.05
SH3BP2-210ENST00000505941 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa21.59■■□□□ 1.05
SH3BP2-210ENST00000505941 OR7D4Q8NG98 312 aa21.59■■□□□ 1.05
SH3BP2-210ENST00000505941 NUP205Q92621 2012 aa21.59■■□□□ 1.05
SH3BP2-210ENST00000505941 TMEM248Q9NWD8 314 aa21.59■■□□□ 1.05
SH3BP2-210ENST00000505941 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
SH3BP2-210ENST00000505941 DNAI1Q9UI46 699 aa21.59■■□□□ 1.05
SH3BP2-210ENST00000505941 SLC6A14Q9UN76 642 aa21.59■■□□□ 1.05
SH3BP2-210ENST00000505941 CEP192Q8TEP8 1941 aa21.59■■□□□ 1.05
SH3BP2-210ENST00000505941 METTL12A8MUP2 240 aa21.58■■□□□ 1.05
SH3BP2-210ENST00000505941 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
SH3BP2-210ENST00000505941 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa21.58■■□□□ 1.05
SH3BP2-210ENST00000505941 FAM72CH0Y354 149 aa21.58■■□□□ 1.05
SH3BP2-210ENST00000505941 MID1O15344 667 aa21.58■■□□□ 1.05
SH3BP2-210ENST00000505941 GDF9O60383 454 aa21.58■■□□□ 1.05
SH3BP2-210ENST00000505941 SNAP91O60641 907 aa21.58■■□□□ 1.05
SH3BP2-210ENST00000505941 RAMP2O60895 175 aa21.58■■□□□ 1.05
SH3BP2-210ENST00000505941 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
SH3BP2-210ENST00000505941 SEMA4FO95754 770 aa21.58■■□□□ 1.05
SH3BP2-210ENST00000505941 HTR7P34969 479 aa21.58■■□□□ 1.05
SH3BP2-210ENST00000505941 LIMK1P53667 647 aa21.58■■□□□ 1.05
SH3BP2-210ENST00000505941 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
SH3BP2-210ENST00000505941 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
SH3BP2-210ENST00000505941 ACAP1Q15027 740 aa21.58■■□□□ 1.05
SH3BP2-210ENST00000505941 FAM72AQ5TYM5 149 aa21.58■■□□□ 1.05
SH3BP2-210ENST00000505941 MANEALQ5VSG8 457 aa21.58■■□□□ 1.05
SH3BP2-210ENST00000505941 DCAF12L1Q5VU92 463 aa21.58■■□□□ 1.05
SH3BP2-210ENST00000505941 TCEAL6Q6IPX3 200 aa21.58■■□□□ 1.05
SH3BP2-210ENST00000505941 FAM72DQ6L9T8 149 aa21.58■■□□□ 1.05
SH3BP2-210ENST00000505941 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
SH3BP2-210ENST00000505941 SLC23A3Q6PIS1 610 aa21.58■■□□□ 1.05
SH3BP2-210ENST00000505941 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa21.58■■□□□ 1.05
SH3BP2-210ENST00000505941 FAM72BQ86X60 149 aa21.58■■□□□ 1.05
SH3BP2-210ENST00000505941 DNAAF5Q86Y56 855 aa21.58■■□□□ 1.05
SH3BP2-210ENST00000505941 TCEAL3Q969E4 200 aa21.58■■□□□ 1.05
SH3BP2-210ENST00000505941 FAM129BQ96TA1 746 aa21.58■■□□□ 1.05
SH3BP2-210ENST00000505941 PSMB7Q99436 277 aa21.58■■□□□ 1.05
SH3BP2-210ENST00000505941 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
SH3BP2-210ENST00000505941 EDEM2Q9BV94 578 aa21.58■■□□□ 1.05
SH3BP2-210ENST00000505941 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa21.58■■□□□ 1.05
SH3BP2-210ENST00000505941 MAGEH1Q9H213 219 aa21.58■■□□□ 1.05
SH3BP2-210ENST00000505941 TMEM74BQ9NUR3 256 aa21.58■■□□□ 1.05
SH3BP2-210ENST00000505941 DLL3Q9NYJ7 618 aa21.58■■□□□ 1.05
SH3BP2-210ENST00000505941 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.04
SH3BP2-210ENST00000505941 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
SH3BP2-210ENST00000505941 LRRC72A6NJI9 287 aa21.57■■□□□ 1.04
SH3BP2-210ENST00000505941 SLC30A4O14863 429 aa21.57■■□□□ 1.04
SH3BP2-210ENST00000505941 ALOX15BO15296 676 aa21.57■■□□□ 1.04
SH3BP2-210ENST00000505941 DAPK3O43293 454 aa21.57■■□□□ 1.04
SH3BP2-210ENST00000505941 SRCP12931 536 aa21.57■■□□□ 1.04
SH3BP2-210ENST00000505941 ACSL1P33121 698 aa21.57■■□□□ 1.04
SH3BP2-210ENST00000505941 IRX4P78413 519 aa21.57■■□□□ 1.04
SH3BP2-210ENST00000505941 OGDHQ02218 1023 aa21.57■■□□□ 1.04
SH3BP2-210ENST00000505941 CCDC15Q0P6D6 951 aa21.57■■□□□ 1.04
SH3BP2-210ENST00000505941 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
SH3BP2-210ENST00000505941 ERMARDQ5T6L9 678 aa21.57■■□□□ 1.04
SH3BP2-210ENST00000505941 VSTM4Q8IW00 320 aa21.57■■□□□ 1.04
SH3BP2-210ENST00000505941 HDDC3Q8N4P3 179 aa21.57■■□□□ 1.04
SH3BP2-210ENST00000505941 FRS2Q8WU20 508 aa21.57■■□□□ 1.04
SH3BP2-210ENST00000505941 SNX19Q92543 992 aa21.57■■□□□ 1.04
SH3BP2-210ENST00000505941 TRIM5Q9C035 493 aa21.57■■□□□ 1.04
SH3BP2-210ENST00000505941 PCSK1NQ9UHG2 260 aa21.57■■□□□ 1.04
SH3BP2-210ENST00000505941 FZD4Q9ULV1 537 aa21.57■■□□□ 1.04
SH3BP2-210ENST00000505941 A0A087X0T9 212 aa21.56■■□□□ 1.04
SH3BP2-210ENST00000505941 A0A1W2PP55 124 aa21.56■■□□□ 1.04
SH3BP2-210ENST00000505941 PATE3B3GLJ2 98 aa21.56■■□□□ 1.04
SH3BP2-210ENST00000505941 MCF2LO15068 1137 aa21.56■■□□□ 1.04
SH3BP2-210ENST00000505941 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
SH3BP2-210ENST00000505941 SYPP08247 313 aa21.56■■□□□ 1.04
SH3BP2-210ENST00000505941 SERPINF2P08697 491 aa21.56■■□□□ 1.04
SH3BP2-210ENST00000505941 FAM228BP0C875 321 aa21.56■■□□□ 1.04
SH3BP2-210ENST00000505941 GOT1P17174 413 aa21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.8 ms