RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493468.6

PRPF40A-211, Transcript of pre-mRNA processing factor 40 homolog A, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRPF40A, Length 1,043 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40A-211ENST00000493468 PAGE5Q96GU1 130 aa14.66□□□□□ -0.06
PRPF40A-211ENST00000493468 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa14.66□□□□□ -0.06
PRPF40A-211ENST00000493468 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
PRPF40A-211ENST00000493468 CALN1Q9BXU9 219 aa14.66□□□□□ -0.06
PRPF40A-211ENST00000493468 GPR27Q9NS67 375 aa14.66□□□□□ -0.06
PRPF40A-211ENST00000493468 SERTAD1Q9UHV2 236 aa14.66□□□□□ -0.06
PRPF40A-211ENST00000493468 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
PRPF40A-211ENST00000493468 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa14.66□□□□□ -0.06
PRPF40A-211ENST00000493468 ITGB2P05107 769 aa14.65□□□□□ -0.06
PRPF40A-211ENST00000493468 FYNP06241 537 aa14.65□□□□□ -0.06
PRPF40A-211ENST00000493468 PRLRP16471 622 aa14.65□□□□□ -0.06
PRPF40A-211ENST00000493468 TACR2P21452 398 aa14.65□□□□□ -0.06
PRPF40A-211ENST00000493468 CCDC15Q0P6D6 951 aa14.65□□□□□ -0.06
PRPF40A-211ENST00000493468 COLEC12Q5KU26 742 aa14.65□□□□□ -0.06
PRPF40A-211ENST00000493468 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa14.65□□□□□ -0.06
PRPF40A-211ENST00000493468 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
PRPF40A-211ENST00000493468 PMF1Q6P1K2 205 aa14.65□□□□□ -0.06
PRPF40A-211ENST00000493468 GCNT7Q6ZNI0 430 aa14.65□□□□□ -0.06
PRPF40A-211ENST00000493468 BEND5Q7L4P6 421 aa14.65□□□□□ -0.06
PRPF40A-211ENST00000493468 HORMAD1Q86X24 394 aa14.65□□□□□ -0.06
PRPF40A-211ENST00000493468 UBR7Q8N806 425 aa14.65□□□□□ -0.06
PRPF40A-211ENST00000493468 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
PRPF40A-211ENST00000493468 WDR48Q8TAF3 677 aa14.65□□□□□ -0.06
PRPF40A-211ENST00000493468 HSFY1Q96LI6 401 aa14.65□□□□□ -0.06
PRPF40A-211ENST00000493468 PPP1R9BQ96SB3 815 aa14.65□□□□□ -0.06
PRPF40A-211ENST00000493468 TRIM4Q9C037 500 aa14.65□□□□□ -0.06
PRPF40A-211ENST00000493468 OSBPL2Q9H1P3 480 aa14.65□□□□□ -0.06
PRPF40A-211ENST00000493468 PCDHA7Q9UN72 937 aa14.65□□□□□ -0.06
PRPF40A-211ENST00000493468 COQ4Q9Y3A0 265 aa14.65□□□□□ -0.06
PRPF40A-211ENST00000493468 LRRK2Q5S007 2527 aa14.64□□□□□ -0.07
PRPF40A-211ENST00000493468 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
PRPF40A-211ENST00000493468 A0A1W2PQU0 124 aa14.64□□□□□ -0.07
PRPF40A-211ENST00000493468 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
PRPF40A-211ENST00000493468 TCAF2A6NFQ2 919 aa14.64□□□□□ -0.07
PRPF40A-211ENST00000493468 A6NNZ2 444 aa14.64□□□□□ -0.07
PRPF40A-211ENST00000493468 SLC31A1O15431 190 aa14.64□□□□□ -0.07
PRPF40A-211ENST00000493468 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
PRPF40A-211ENST00000493468 APOEP02649 317 aa14.64□□□□□ -0.07
PRPF40A-211ENST00000493468 ITGA2BP08514 1039 aa14.64□□□□□ -0.07
PRPF40A-211ENST00000493468 PAEPP09466 180 aa14.64□□□□□ -0.07
PRPF40A-211ENST00000493468 MYF5P13349 255 aa14.64□□□□□ -0.07
PRPF40A-211ENST00000493468 KRT10P13645 584 aa14.64□□□□□ -0.07
PRPF40A-211ENST00000493468 PDGFRAP16234 1089 aa14.64□□□□□ -0.07
PRPF40A-211ENST00000493468 RGS7P49802 495 aa14.64□□□□□ -0.07
PRPF40A-211ENST00000493468 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
PRPF40A-211ENST00000493468 ADAM9Q13443 819 aa14.64□□□□□ -0.07
PRPF40A-211ENST00000493468 LINC00303Q3SY05 128 aa14.64□□□□□ -0.07
PRPF40A-211ENST00000493468 ZCWPW2Q504Y3 356 aa14.64□□□□□ -0.07
PRPF40A-211ENST00000493468 RAP1GAP2Q684P5 730 aa14.64□□□□□ -0.07
PRPF40A-211ENST00000493468 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
PRPF40A-211ENST00000493468 CHSY1Q86X52 802 aa14.64□□□□□ -0.07
PRPF40A-211ENST00000493468 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
PRPF40A-211ENST00000493468 CLEC4CQ8WTT0 213 aa14.64□□□□□ -0.07
PRPF40A-211ENST00000493468 BTN2A3PQ96KV6 586 aa14.64□□□□□ -0.07
PRPF40A-211ENST00000493468 MYOCQ99972 504 aa14.64□□□□□ -0.07
PRPF40A-211ENST00000493468 TRIM62Q9BVG3 475 aa14.64□□□□□ -0.07
PRPF40A-211ENST00000493468 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
PRPF40A-211ENST00000493468 USP25Q9UHP3 1055 aa14.64□□□□□ -0.07
PRPF40A-211ENST00000493468 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
PRPF40A-211ENST00000493468 SALL4Q9UJQ4 1053 aa14.64□□□□□ -0.07
PRPF40A-211ENST00000493468 SLC25A13Q9UJS0 675 aa14.64□□□□□ -0.07
PRPF40A-211ENST00000493468 SCN8AQ9UQD0 1980 aa14.64□□□□□ -0.07
PRPF40A-211ENST00000493468 CCDC187A0A096LP49 1063 aa14.63□□□□□ -0.07
PRPF40A-211ENST00000493468 F5H5T6 163 aa14.63□□□□□ -0.07
PRPF40A-211ENST00000493468 H3BM21 787 aa14.63□□□□□ -0.07
PRPF40A-211ENST00000493468 SART1O43290 800 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
PRPF40A-211ENST00000493468 SUV39H1O43463 412 aa14.63□□□□□ -0.07
PRPF40A-211ENST00000493468 NEBLO76041 1014 aa14.63□□□□□ -0.07
PRPF40A-211ENST00000493468 RHOBTB3O94955 611 aa14.63□□□□□ -0.07
PRPF40A-211ENST00000493468 CSF2P04141 144 aa14.63□□□□□ -0.07
PRPF40A-211ENST00000493468 SFTPCP11686 197 aa14.63□□□□□ -0.07
PRPF40A-211ENST00000493468 NME1P15531 152 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
PRPF40A-211ENST00000493468 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
PRPF40A-211ENST00000493468 ME1P48163 572 aa14.63□□□□□ -0.07
PRPF40A-211ENST00000493468 STILQ15468 1287 aa14.63□□□□□ -0.07
PRPF40A-211ENST00000493468 EDRF1Q3B7T1 1238 aa14.63□□□□□ -0.07
PRPF40A-211ENST00000493468 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa14.63□□□□□ -0.07
PRPF40A-211ENST00000493468 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa14.63□□□□□ -0.07
PRPF40A-211ENST00000493468 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
PRPF40A-211ENST00000493468 GUSBP11Q6P575 273 aa14.63□□□□□ -0.07
PRPF40A-211ENST00000493468 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
PRPF40A-211ENST00000493468 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
PRPF40A-211ENST00000493468 TAC4Q86UU9 113 aa14.63□□□□□ -0.07
PRPF40A-211ENST00000493468 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
PRPF40A-211ENST00000493468 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
PRPF40A-211ENST00000493468 ALG14Q96F25 216 aa14.63□□□□□ -0.07
PRPF40A-211ENST00000493468 NOX5Q96PH1 765 aa14.63□□□□□ -0.07
PRPF40A-211ENST00000493468 SEMA3CQ99985 751 aa14.63□□□□□ -0.07
PRPF40A-211ENST00000493468 FZD3Q9NPG1 666 aa14.63□□□□□ -0.07
PRPF40A-211ENST00000493468 DNAJC28Q9NX36 388 aa14.63□□□□□ -0.07
PRPF40A-211ENST00000493468 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
PRPF40A-211ENST00000493468 ACSL6Q9UKU0 697 aa14.63□□□□□ -0.07
PRPF40A-211ENST00000493468 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa14.63□□□□□ -0.07
PRPF40A-211ENST00000493468 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa14.63□□□□□ -0.07
PRPF40A-211ENST00000493468 TEX15Q9BXT5 2789 aa14.62□□□□□ -0.07
PRPF40A-211ENST00000493468 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa14.62□□□□□ -0.07
PRPF40A-211ENST00000493468 PIK3R2O00459 728 aa14.62□□□□□ -0.07
PRPF40A-211ENST00000493468 TPP1O14773 563 aa14.62□□□□□ -0.07
PRPF40A-211ENST00000493468 EFSO43281 561 aa14.62□□□□□ -0.07
PRPF40A-211ENST00000493468 TNFSF15O95150 251 aa14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.7 ms