RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000458294.5

PBRM1-218, Transcript of polybromo 1, humanhuman

TSL 3

Gene PBRM1, Length 476 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBRM1-218ENST00000458294 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP27.09■■□□□ 1.93
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PBRM1-218ENST00000458294 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP27.09■■□□□ 1.93
PBRM1-218ENST00000458294 AUHQ13825 339 aaKnown RBP27.09■■□□□ 1.93
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PBRM1-218ENST00000458294 OR51B4Q9Y5P0 310 aa27.09■■□□□ 1.93
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PBRM1-218ENST00000458294 OR52K2Q8NGK3 314 aa27.08■■□□□ 1.93
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PBRM1-218ENST00000458294 STX17P56962 302 aa27.07■■□□□ 1.92
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PBRM1-218ENST00000458294 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP27.07■■□□□ 1.92
PBRM1-218ENST00000458294 POM121L1PQ3SYA9 428 aa27.07■■□□□ 1.92
PBRM1-218ENST00000458294 C5orf22Q49AR2 442 aa27.07■■□□□ 1.92
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PBRM1-218ENST00000458294 TMEM145Q8NBT3 493 aa27.06■■□□□ 1.92
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PBRM1-218ENST00000458294 HS3ST2Q9Y278 367 aa27.06■■□□□ 1.92
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PBRM1-218ENST00000458294 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP27.03■■□□□ 1.92
PBRM1-218ENST00000458294 APEX2Q9UBZ4 518 aa27.03■■□□□ 1.92
PBRM1-218ENST00000458294 A0A1W2PQU0 124 aa27.02■■□□□ 1.92
PBRM1-218ENST00000458294 M0QYT0 321 aa27.02■■□□□ 1.92
PBRM1-218ENST00000458294 BIN1O00499 593 aa27.02■■□□□ 1.92
PBRM1-218ENST00000458294 CTSLP07711 333 aa27.02■■□□□ 1.92
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