RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449504.5

HDLBP-222, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 5

Gene HDLBP, Length 566 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-222ENST00000449504 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
HDLBP-222ENST00000449504 SPAG5Q96R06 1193 aa7.41□□□□□ -1.22
HDLBP-222ENST00000449504 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
HDLBP-222ENST00000449504 SLC12A9Q9BXP2 914 aa7.41□□□□□ -1.22
HDLBP-222ENST00000449504 ULBP1Q9BZM6 244 aa7.41□□□□□ -1.22
HDLBP-222ENST00000449504 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
HDLBP-222ENST00000449504 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa7.41□□□□□ -1.22
HDLBP-222ENST00000449504 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
HDLBP-222ENST00000449504 FOXJ2Q9P0K8 574 aa7.41□□□□□ -1.22
HDLBP-222ENST00000449504 KLF15Q9UIH9 416 aa7.41□□□□□ -1.22
HDLBP-222ENST00000449504 STOML2Q9UJZ1 356 aa7.41□□□□□ -1.22
HDLBP-222ENST00000449504 ACSL6Q9UKU0 697 aa7.41□□□□□ -1.22
HDLBP-222ENST00000449504 PADI4Q9UM07 663 aa7.41□□□□□ -1.22
HDLBP-222ENST00000449504 LOXL2Q9Y4K0 774 aa7.41□□□□□ -1.22
HDLBP-222ENST00000449504 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa7.41□□□□□ -1.22
HDLBP-222ENST00000449504 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
HDLBP-222ENST00000449504 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa7.4□□□□□ -1.22
HDLBP-222ENST00000449504 FRMD3A2A2Y4 597 aa7.4□□□□□ -1.22
HDLBP-222ENST00000449504 A6NNZ2 444 aa7.4□□□□□ -1.22
HDLBP-222ENST00000449504 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
HDLBP-222ENST00000449504 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa7.4□□□□□ -1.22
HDLBP-222ENST00000449504 H3BQV1 296 aa7.4□□□□□ -1.22
HDLBP-222ENST00000449504 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa7.4□□□□□ -1.22
HDLBP-222ENST00000449504 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
HDLBP-222ENST00000449504 TGFB1I1O43294 461 aa7.4□□□□□ -1.22
HDLBP-222ENST00000449504 ACSL4O60488 711 aa7.4□□□□□ -1.22
HDLBP-222ENST00000449504 EXOC3O60645 756 aa7.4□□□□□ -1.22
HDLBP-222ENST00000449504 VPS4BO75351 444 aa7.4□□□□□ -1.22
HDLBP-222ENST00000449504 LATS1O95835 1130 aa7.4□□□□□ -1.22
HDLBP-222ENST00000449504 ZBED1O96006 694 aa7.4□□□□□ -1.22
HDLBP-222ENST00000449504 NME1P15531 152 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
HDLBP-222ENST00000449504 GNLYP22749 145 aa7.4□□□□□ -1.22
HDLBP-222ENST00000449504 ETV5P41161 510 aa7.4□□□□□ -1.22
HDLBP-222ENST00000449504 OXCT1P55809 520 aa7.4□□□□□ -1.22
HDLBP-222ENST00000449504 TAS2R38P59533 333 aa7.4□□□□□ -1.22
HDLBP-222ENST00000449504 ZNF284Q2VY69 593 aa7.4□□□□□ -1.22
HDLBP-222ENST00000449504 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
HDLBP-222ENST00000449504 BSPRYQ5W0U4 402 aa7.4□□□□□ -1.22
HDLBP-222ENST00000449504 SEL1L3Q68CR1 1132 aa7.4□□□□□ -1.22
HDLBP-222ENST00000449504 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
HDLBP-222ENST00000449504 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa7.4□□□□□ -1.22
HDLBP-222ENST00000449504 HORMAD1Q86X24 394 aa7.4□□□□□ -1.22
HDLBP-222ENST00000449504 RBFAQ8N0V3 343 aa7.4□□□□□ -1.22
HDLBP-222ENST00000449504 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa7.4□□□□□ -1.22
HDLBP-222ENST00000449504 PLEKHO2Q8TD55 490 aa7.4□□□□□ -1.22
HDLBP-222ENST00000449504 MYEOVQ96EZ4 313 aa7.4□□□□□ -1.22
HDLBP-222ENST00000449504 BMFQ96LC9 184 aa7.4□□□□□ -1.22
HDLBP-222ENST00000449504 TMEM74Q96NL1 305 aa7.4□□□□□ -1.22
HDLBP-222ENST00000449504 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
HDLBP-222ENST00000449504 SIRPGQ9P1W8 387 aa7.4□□□□□ -1.22
HDLBP-222ENST00000449504 TUBD1Q9UJT1 453 aa7.4□□□□□ -1.22
HDLBP-222ENST00000449504 VPS4AQ9UN37 437 aa7.4□□□□□ -1.22
HDLBP-222ENST00000449504 ITIH6Q6UXX5 1313 aa7.4□□□□□ -1.22
HDLBP-222ENST00000449504 RELNP78509 3460 aa7.39□□□□□ -1.23
HDLBP-222ENST00000449504 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa7.39□□□□□ -1.23
HDLBP-222ENST00000449504 POM121BA6NF01 834 aa7.39□□□□□ -1.23
HDLBP-222ENST00000449504 PRR19A6NJB7 356 aa7.39□□□□□ -1.23
HDLBP-222ENST00000449504 C9orf172C9J069 976 aa7.39□□□□□ -1.23
HDLBP-222ENST00000449504 D6RAR5 112 aa7.39□□□□□ -1.23
HDLBP-222ENST00000449504 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
HDLBP-222ENST00000449504 TPP1O14773 563 aa7.39□□□□□ -1.23
HDLBP-222ENST00000449504 IRAK2O43187 625 aa7.39□□□□□ -1.23
HDLBP-222ENST00000449504 SEMA7AO75326 666 aa7.39□□□□□ -1.23
HDLBP-222ENST00000449504 GCATO75600 419 aa7.39□□□□□ -1.23
HDLBP-222ENST00000449504 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
HDLBP-222ENST00000449504 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
HDLBP-222ENST00000449504 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
HDLBP-222ENST00000449504 ANXA6P08133 673 aa7.39□□□□□ -1.23
HDLBP-222ENST00000449504 RNF224P0DH78 156 aa7.39□□□□□ -1.23
HDLBP-222ENST00000449504 GJB2P29033 226 aa7.39□□□□□ -1.23
HDLBP-222ENST00000449504 DCTP40126 519 aa7.39□□□□□ -1.23
HDLBP-222ENST00000449504 TXLNAP40222 546 aa7.39□□□□□ -1.23
HDLBP-222ENST00000449504 STAT6P42226 847 aa7.39□□□□□ -1.23
HDLBP-222ENST00000449504 ASPAP45381 313 aa7.39□□□□□ -1.23
HDLBP-222ENST00000449504 CD97P48960 835 aa7.39□□□□□ -1.23
HDLBP-222ENST00000449504 AP3M2P53677 418 aa7.39□□□□□ -1.23
HDLBP-222ENST00000449504 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
HDLBP-222ENST00000449504 TCEA2Q15560 299 aa7.39□□□□□ -1.23
HDLBP-222ENST00000449504 PRRT3Q5FWE3 981 aa7.39□□□□□ -1.23
HDLBP-222ENST00000449504 NADSYN1Q6IA69 706 aa7.39□□□□□ -1.23
HDLBP-222ENST00000449504 PARGQ86W56 976 aa7.39□□□□□ -1.23
HDLBP-222ENST00000449504 DTX1Q86Y01 620 aa7.39□□□□□ -1.23
HDLBP-222ENST00000449504 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
HDLBP-222ENST00000449504 UNC45BQ8IWX7 931 aa7.39□□□□□ -1.23
HDLBP-222ENST00000449504 IL22RA1Q8N6P7 574 aa7.39□□□□□ -1.23
HDLBP-222ENST00000449504 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
HDLBP-222ENST00000449504 TEX19Q8NA77 164 aa7.39□□□□□ -1.23
HDLBP-222ENST00000449504 PARD3BQ8TEW8 1205 aa7.39□□□□□ -1.23
HDLBP-222ENST00000449504 CCDC74AQ96AQ1 378 aa7.39□□□□□ -1.23
HDLBP-222ENST00000449504 FAM131CQ96AQ9 280 aa7.39□□□□□ -1.23
HDLBP-222ENST00000449504 ABHD17AQ96GS6 310 aa7.39□□□□□ -1.23
HDLBP-222ENST00000449504 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
HDLBP-222ENST00000449504 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
HDLBP-222ENST00000449504 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
HDLBP-222ENST00000449504 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
HDLBP-222ENST00000449504 BOCQ9BWV1 1114 aa7.39□□□□□ -1.23
HDLBP-222ENST00000449504 DNAI2Q9GZS0 605 aa7.39□□□□□ -1.23
HDLBP-222ENST00000449504 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
HDLBP-222ENST00000449504 LRRC4Q9HBW1 653 aa7.39□□□□□ -1.23
HDLBP-222ENST00000449504 SPASTQ9UBP0 616 aa7.39□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.1 ms