RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000430766.1

PTPRD-AS1-201, PTPRD antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRD-AS1, Length 1,959 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CCDC148Q8NFR7 591 aa8.83□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 KIFAP3Q92845 792 aa8.83□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RILPL2Q969X0 211 aa8.83□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP8.83□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TWSG1Q9GZX9 223 aa8.83□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa8.83□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa8.83□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SVEP1Q4LDE5 3571 aa8.83□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SFI1A8K8P3 1242 aa8.82□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MASP2O00187 686 aa8.82□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CLDN3O15551 220 aa8.82□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 C1orf61Q13536 156 aa8.82□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TMEM132DQ14C87 1099 aa8.82□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MAP9Q49MG5 647 aa8.82□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PRRT3Q5FWE3 981 aa8.82□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP8.82□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MTFR2Q6P444 385 aa8.82□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa8.82□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ZNF765Q7L2R6 523 aa8.82□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RBFAQ8N0V3 343 aa8.82□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ESX1Q8N693 406 aa8.82□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 AGBL5Q8NDL9 886 aa8.82□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 BMFQ96LC9 184 aa8.82□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ZNF560Q96MR9 790 aa8.82□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 LRRC61Q9BV99 259 aa8.82□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 HAPLN2Q9GZV7 340 aa8.82□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ACSS2Q9NR19 701 aa8.82□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP8.82□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa8.82□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 HUS1O60921 280 aa8.82□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PHACTR2O75167 634 aa8.82□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 DLGAP3O95886 979 aa8.82□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PRR29P0C7W0 189 aa8.82□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP8.82□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 AGAP20933 346 aa8.82□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 DLSTP36957 453 aa8.82□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CSNK1G2P78368 415 aa8.82□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP8.82□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP8.82□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 HMBOX1Q6NT76 420 aa8.82□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PODNL1Q6PEZ8 512 aa8.82□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 BHLHB9Q6PI77 547 aa8.82□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PIM3Q86V86 326 aa8.82□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SYT15Q9BQS2 421 aa8.82□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TMEM121Q9BTD3 319 aa8.82□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CLPBQ9H078 707 aa8.82□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CRTAC1Q9NQ79 661 aa8.82□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 IL37Q9NZH6 218 aa8.82□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TMEM63CQ9P1W3 806 aa8.82□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 FAM92AA1XBS5 289 aa8.81□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CREG1O75629 220 aa8.81□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CPNE6O95741 557 aa8.81□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TBX18O95935 607 aa8.81□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MS4A1P11836 297 aa8.81□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PNPLA4P41247 253 aa8.81□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 NPTX2P47972 431 aa8.81□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 THOP1P52888 689 aa8.81□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CYP27A1Q02318 531 aa8.81□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CHAF1BQ13112 559 aa8.81□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP8.81□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP8.81□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 LVRNQ6Q4G3 990 aa8.81□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 APOA5Q6Q788 366 aa8.81□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ZPBP2Q6X784 338 aa8.81□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 NRSN1Q8IZ57 195 aa8.81□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CPXM2Q8N436 756 aa8.81□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 KLK6Q92876 244 aa8.81□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP8.81□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TMEM30AQ9NV96 361 aa8.81□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SIRPGQ9P1W8 387 aa8.81□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa8.81□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CDH9Q9ULB4 789 aa8.81□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa8.81□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CCDC169A6NNP5 214 aa8.81□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 FAM189A1O60320 539 aa8.81□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CRLF1O75462 422 aa8.81□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 STC2O76061 302 aa8.81□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 STK17BO94768 372 aa8.81□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 KLKB1P03952 638 aa8.81□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP8.81□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP8.81□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP8.81□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CACNA2D1P54289 1103 aa8.81□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ST8SIA6P61647 398 aa8.81□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PCOLCEQ15113 449 aa8.81□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ASIC2Q16515 512 aa8.81□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 LONRF1Q17RB8 773 aa8.81□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ZNF284Q2VY69 593 aa8.81□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 AGBL4Q5VU57 503 aa8.81□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 NEK5Q6P3R8 708 aa8.81□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MEX3BQ6ZN04 569 aaKnown RBP8.81□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa8.81□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 KDM1BQ8NB78 822 aa8.81□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 DDI1Q8WTU0 396 aa8.81□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 THAP4Q8WY91 577 aa8.81□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PCED1BQ96HM7 432 aa8.81□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CCDC74BQ96LY2 380 aa8.81□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ZPBPQ9BS86 351 aa8.81□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ING2Q9H160 280 aa8.81□□□□□ -1
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 POLD4Q9HCU8 107 aa8.81□□□□□ -1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.8 ms